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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_023846
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 70826417-70830496 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2265 bp · LXL04_023846|LXL04_023846|OH1004|cDNA

ATGATGGTGTTCGGTCACTCAAGCACCGGAGGAGGTTTCCTCCCCGCAAAACTACAGGTTTACCCAGTGGACTACGAGGCCGACGTCTCTCAACGCCTCCTTGAAGCTTCGTCCTGTGGCGATCTCAAATCGGCGTTAGACTGCATTGACGATCCCTACGTTGACGTCAACTATCTCGGCGCTGTTTCCTTGAAGGTTCGTATGGCGGAAGTTAACTGCCGCGATGAATCGGAGAATGTGGTGCGATTTGAGTACCAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2265 bp · LXL04_023846|LXL04_023846|OH1004|CDS

ATGATGGTGTTCGGTCACTCAAGCACCGGAGGAGGTTTCCTCCCCGCAAAACTACAGGTTTACCCAGTGGACTACGAGGCCGACGTCTCTCAACGCCTCCTTGAAGCTTCGTCCTGTGGCGATCTCAAATCGGCGTTAGACTGCATTGACGATCCCTACGTTGACGTCAACTATCTCGGCGCTGTTTCCTTGAAGGTTCGTATGGCGGAAGTTAACTGCCGCGATGAATCGGAGAATGTGGTGCGATTTGAGTACCAGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

754 aa · LXL04_023846|LXL04_023846|OH1004|PROTEIN

MMVFGHSSTGGGFLPAKLQVYPVDYEADVSQRLLEASSCGDLKSALDCIDDPYVDVNYLGAVSLKVRMAEVNCRDESENVVRFEYQDVKTDVTALFIAVHTGNATLVRKLLSRGADVNQKLFRGFSMTAAVREGHVEIFEILLKAGASQPSCEEALLDASCHGRGGQFVHLLMASDFIRPHIAVHALVTACCRGFIDVVDALLKCGVDVNASARVLLCSSKPSLHTNINCTPLVAAVVSRQVAVVPLLLQAGANINGMVQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_023846
TK1151 IDTkA06G208200
OH-1004 IDLXL04_023846
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)76.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.634 / OH-1004 78.647
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_023846
位置Chr05:70826417-70830496 (+)
描述Similar to Ank3: Ankyrin-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023846 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0007009 plasma membrane organization 生物过程
GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007528 neuromuscular junction development 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010650 positive regulation of cell communication by electrical coupling 生物过程
GO:0010765 positive regulation of sodium ion transport 生物过程
GO:0010960 magnesium ion homeostasis 生物过程
GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
KEGG 基因交叉引用
hsa:286
mmu:11735
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.546
排名 1 · LXL04_023846 · OH-1004
细胞核0.450
排名 2 · LXL04_023846 · OH-1004
线粒体0.078
排名 3 · LXL04_023846 · OH-1004
细胞膜0.045
排名 4 · LXL04_023846 · OH-1004
内质网0.034
排名 5 · LXL04_023846 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12796.14Ank_290-148 aa
PF00023.37Ank93-120 aa
PF12796.14Ank_2183-256 aa
PF12796.14Ank_2298-343 aa
PF12796.14Ank_2352-415 aa
PF12796.14Ank_2458-520 aa
PF12796.14Ank_2461-541 aa
PF13857.13Ank_5483-529 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_023846PF12796.14Ank_2901482.3e-60201.9
LXL04_023846PF00023.37Ank931204.1e-53175.1
LXL04_023846PF12796.14Ank_21832562.3e-60201.9
LXL04_023846PF12796.14Ank_22983432.3e-60201.9
LXL04_023846PF12796.14Ank_23524152.3e-60201.9
LXL04_023846PF12796.14Ank_24585202.3e-60201.9
LXL04_023846PF12796.14Ank_24615412.3e-60201.9
LXL04_023846PF13857.13Ank_54835297.9e-2896.9
LXL04_023846PF12796.14Ank_24965882.3e-60201.9
LXL04_023846PF13637.13Ank_45495781.7e-2898.7
LXL04_023846PF13857.13Ank_55545957.9e-2896.9
LXL04_023846PF00023.37Ank5585884.1e-53175.1
LXL04_023846PF13606.13Ank_35585861.1e-37124.0
LXL04_023846PF12796.14Ank_25626392.3e-60201.9
LXL04_023846PF13637.13Ank_45626111.7e-2898.7
LXL04_023846PF00023.37Ank5906154.1e-53175.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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