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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G197200
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 51313445-51323671 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1547 bp · TkA06G197200|TK1151|cDNA

CAGAGACCAGATCCCAATAGACACCCCTCGATTTTCCTTATTTAATCTAAATTATACCTTCAACCCTATCGAGCATCAATGGCGATTGACGCTATTTGCTGTAAATTATAGCTGAAATACAAGTATCTAACTTCTCTTTTTAGCCGTCGTACAAGAGTTTCACGATTGTGATGGATGCTAAAACGTCGGCTAAATCCAGTAACATTGTTAACGATCAGTCTCCCTCTCAACAGGACAACGCACCTGCACAAAAGTCGAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1386 bp · TkA06G197200|TK1151|CDS

ATGGATGCTAAAACGTCGGCTAAATCCAGTAACATTGTTAACGATCAGTCTCCCTCTCAACAGGACAACGCACCTGCACAAAAGTCGAGCAAAGTGCCTTTCATCATAGGTGTTGCTGGCGGAACGGCATCCGGAAAAACAACTGTCTGCAATGTGATCATATCAAGACTCCATGATCAAAGAGTTTCCCTTATCAATCAAGATTCATTTTATCGTTCTTTGAGTGATGAACAATCAGCAAATGCACAAGATTACAATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

461 aa · TkA06G197200|TK1151|PROTEIN

MDAKTSAKSSNIVNDQSPSQQDNAPAQKSSKVPFIIGVAGGTASGKTTVCNVIISRLHDQRVSLINQDSFYRSLSDEQSANAQDYNFDHPDSFNTELLLSCMERLKKGQPANIPDYDYKIHKNSGPGRMVNPSDVIILEGILVLHDTRVRDLMSMKIFVDSDSDVRLGRRIKRDTVERGRNIQYVLDQYDRHVKPSFEEFILPSKKHADIIIPRGSDNDVAIDLIVQHIRTKLGQHDLCKIYQNLFVIPSTFQIRGMHTL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G197200
TK1151 IDTkA06G197200
OH-1004 IDLXL04_023906
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G197200
位置Chr06:51313445-51323671 (-)
描述Similar to UKL5: Uridine kinase-like protein 5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27440 参与嘧啶拯救途径。 暂无已核实直接文献
At1g55810 参与嘧啶拯救途径。 暂无已核实直接文献
At4g26510 参与嘧啶拯救途径。 暂无已核实直接文献
At5g40870 参与嘧啶补救途径（可能）。
Functional characterization of a gene encoding a dual domain for uridine kinase and uracil phosphoribosyltransferase in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9101-3
Plastid uridine salvage activity is required for photoassimilate allocation and partitioning in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.085829
Pyrimidine Salvage: Physiological Functions and Interaction with Chloroplast Biogenesis.2019 · DOI: 10.1104/pp.19.00329
At3g27190 参与嘧啶补救途径。
Plastid uridine salvage activity is required for photoassimilate allocation and partitioning in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.085829
Pyrimidine Salvage: Physiological Functions and Interaction with Chloroplast Biogenesis.2019 · DOI: 10.1104/pp.19.00329

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023906 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006207 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process 生物过程
GO:0044206 UMP salvage 生物过程
GO:0044211 CTP salvage 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1901141 regulation of lignin biosynthetic process 生物过程
GO:2000904 regulation of starch metabolic process 生物过程
GO:2001006 regulation of cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004845 uracil phosphoribosyltransferase activity 分子功能
GO:0004849 uridine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55810
ath:AT3G27190
ath:AT3G27440
ath:AT4G26510
ath:AT5G40870
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.560
排名 1 · TkA06G197200 · TK1151
细胞核0.328
排名 2 · TkA06G197200 · TK1151
线粒体0.178
排名 3 · TkA06G197200 · TK1151
过氧化物酶体0.050
排名 4 · TkA06G197200 · TK1151
细胞膜0.044
排名 5 · TkA06G197200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00437T2SSE19-63 aa
PF06414Zeta_toxin27-70 aa
PF00485PRK35-221 aa
PF01121CoaE35-79 aa
PF13238AAA_1836-178 aa
PF02224Cytidylate_kin36-74 aa
PF03029ATP_bind_138-69 aa
PF13207AAA_1740-174 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G197200PF00437T2SSE19630.1311.6
TkA06G197200PF06414Zeta_toxin27700.01515.5
TkA06G197200PF00485PRK352212.6e-47161.9
TkA06G197200PF01121CoaE35797.3e-0626.5
TkA06G197200PF13238AAA_18361789.7e-0523.6
TkA06G197200PF02224Cytidylate_kin36740.04514.2
TkA06G197200PF03029ATP_bind_138690.0613.8
TkA06G197200PF13207AAA_17401740.05914.4
TkA06G197200PF00156Pribosyltran48800.005516.8
TkA06G197200PF02188GoLoco55640.2711.4
TkA06G197200PF01121CoaE1362017.3e-0626.5
TkA06G197200PF02224Cytidylate_kin1471790.04514.2
TkA06G197200PF14681UPRTase2494501.7e-73247.2
TkA06G197200PF00485PRK2582712.6e-47161.9
TkA06G197200PF24390PRTase-CE3124330.0002821.6
TkA06G197200PF00156Pribosyltran3574070.005516.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LTY6拟南芥sp|Q9LTY6|UKL5_ARATH Uridine kinase-like protein 578.100%Swiss-Prot高置信
Q8VYB2拟南芥sp|Q8VYB2|UKL3_ARATH Uridine kinase-like protein 375.000%Swiss-Prot高置信
O65583拟南芥sp|O65583|UKL4_ARATH Uridine kinase-like protein 475.700%Swiss-Prot高置信
Q9FKS0拟南芥sp|Q9FKS0|UKL1_ARATH Uridine/cytidine kinase UKL1, chloroplastic71.700%Swiss-Prot高置信
Q9LK34拟南芥sp|Q9LK34|UKL2_ARATH Uridine/cytidine kinase UKL1, chloroplastic73.100%Swiss-Prot高置信

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