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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G075900
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 20356207-20358608 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1745 bp · TkA06G075900|TK1151|cDNA

AGAATCACTCCTCCACATGTTTGACCATTGACCACACAGTCACACACCATCACCACTGCCGCTACGACCACCAGCACCATGGCGGAGCTCAGAAGAAAATGAAAGAAAGCGTTGAAGAGGTGTGTATCTGAGGCTCGAACATCCATCTATCAAGCCTGGTTACAAATTCACACAGATACACTCGGCAGTGTGTGTGCGGCGGTCGTGGTGGATAACATCGTAACCTTTTACGGCAGCCAATTACCTGCAGATAAAGCTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

735 bp · TkA06G075900|TK1151|CDS

ATGAAGAAGAAAGCTTGTGATAGTAGTAGTAATAGTGATAAAGATGATCTAAAGCAGAAAGAAAGGCACATAGTTTCATGGTCTGAAGAGGAGGATAATATATTAAGGGAGCAGATTGGTATCCATGGAACCAATAATTGGGCAGTTATTGCATCCATGTTTGAGAACAAAACTACAAGGCAATGCAGAAGAAGATGGTTCACTTATTTAAACTCTGATTTCAAAAAAGGAGGGTGGTCACATGAAGAAGATATGCTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

244 aa · TkA06G075900|TK1151|PROTEIN

MKKKACDSSSNSDKDDLKQKERHIVSWSEEEDNILREQIGIHGTNNWAVIASMFENKTTRQCRRRWFTYLNSDFKKGGWSHEEDMLLCEAQKIFGNRWTEIAKVVSGRTDNAVKNRFSVLSKRKRKCDDSSSSKENNGGDNCMNSNNKRTRENTKMNKRIEKRKMSEDDICDGRKYPLPNSEFNSPIQVTPLFRSMAEGIPSPQFSESERNFLLKTLGMESTIPNPTSRTSQSPPCKRALLHCL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G075900
TK1151 IDTkA06G075900
OH-1004 IDLXL04_025195
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)81.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.311 / OH-1004 96.377
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G075900
位置Chr06:20356207-20358608 (-)
描述Similar to MYB88: Transcription factor MYB88
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g14350 与细胞周期基因启动子顺式调节元件 5'-GGCGCGC-3' 中的 DNA 结合的转录因子，包括细胞周期蛋白、细胞周期蛋白依赖性激酶 和预复制复合物的组件。
Developmental regulation of CYCA2s contributes to tissue-specific proliferation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1038/emboj.2011.240
At2g02820 与细胞周期基因启动子顺式调节元件 5'-GGCGCGC-3' 中的 DNA 结合的转录因子，包括细胞周期蛋白、细胞周期蛋白依赖性激酶 和预复制复合物的组件。
The Arabidopsis R2R3 MYB proteins FOUR LIPS and MYB88 restrict divisions late in the stomatal cell lineage.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.034116
Regulation of cell proliferation in the stomatal lineage by the Arabidopsis MYB FOUR LIPS via direct targeting of core cell cycle genes.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.074609
Role of the stomatal development regulators FLP/MYB88 in abiotic stress responses.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04364.x
Developmental regulation of CYCA2s contributes to tissue-specific proliferation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1038/emboj.2011.240
FOUR LIPS and MYB88 conditionally restrict the G1/S transition during stomatal formation.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert313
Deep functional redundancy between FAMA and FOUR LIPS in stomatal development.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12489
Requirement for A-type cyclin-dependent kinase and cyclins for the terminal division in the stomatal lineage of Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1093/jxb/eru139
Transcriptional regulation of PIN genes by FOUR LIPS and MYB88 during Arabidopsis root gravitropism.2015 · DOI: 10.1038/ncomms9822

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025195 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009629 response to gravity 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009926 auxin polar transport 生物过程
GO:0010052 guard cell differentiation 生物过程
GO:0010235 guard mother cell cytokinesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14350
ath:AT2G02820
hsa:4605
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966
排名 1 · TkA06G075900 · TK1151
细胞质0.112
排名 2 · TkA06G075900 · TK1151
细胞膜0.018
排名 3 · TkA06G075900 · TK1151
线粒体0.011
排名 4 · TkA06G075900 · TK1151
内质网0.007
排名 5 · TkA06G075900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15963Myb_DNA-bind_720-66 aa
PF00249Myb_DNA-binding26-70 aa
PF23082Myb_DNA-binding_226-58 aa
PF13921Myb_DNA-bind_627-87 aa
PF21227Myb_DNA-binding_727-66 aa
PF11626Rap1_C27-66 aa
PF20222DUF658141-79 aa
PF25072DUF779657-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G075900PF15963Myb_DNA-bind_720663.5e-0730.7
TkA06G075900PF00249Myb_DNA-binding26709.1e-30103.3
TkA06G075900PF23082Myb_DNA-binding_226580.0003421.3
TkA06G075900PF13921Myb_DNA-bind_627872.3e-2279.6
TkA06G075900PF21227Myb_DNA-binding_727660.06313.9
TkA06G075900PF11626Rap1_C27661.010.2
TkA06G075900PF20222DUF658141790.05313.1
TkA06G075900PF25072DUF7796571270.1212.0
TkA06G075900PF15963Myb_DNA-bind_7751263.5e-0730.7
TkA06G075900PF00249Myb_DNA-binding761179.1e-30103.3
TkA06G075900PF11626Rap1_C761171.010.2
TkA06G075900PF13921Myb_DNA-bind_6791252.3e-2279.6
TkA06G075900PF23082Myb_DNA-binding_2961350.0003421.3
TkA06G075900PF21227Myb_DNA-binding_7971200.06313.9
TkA06G075900PF20222DUF6581981260.05313.1
TkA06G075900PF11626Rap1_C1401641.010.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94FL6拟南芥sp|Q94FL6|MY124_ARATH Transcription factor MYB12434.400%Swiss-Prot中等置信
F4IRB4拟南芥sp|F4IRB4|MYB88_ARATH Transcription factor MYB8830.900%Swiss-Prot中等置信

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