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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G465970
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 116820865-116823801 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2203 bp · TkA05G465970|TK1151|cDNA

TCACCAACCTATGATTTAGTCTATCTTTTTTTTATATTGCTTATAATACAACATAAGTAAAACATAAAAAATTCAAAAATACAGATTTAACAAAGGTGACACAAACTGTAAGAATACAGTTGTGGCACTTATTTGATTGGTGGGCATTGCATTGGATCCCATGTTTACCTCACTTCCAGAAAAACTGTTAAAAATTTGTACGAGTAATATTTTGGGTCCTCCAACATTTTTAATTTTAGTTGTTTAAAGCTTCTACTGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1710 bp · TkA05G465970|TK1151|CDS

ATGGAAAACCCATCTCAAACCTTCAACTTTTTCTTTCGAAATTTAACTTCAAGTGAAATGAGGAGCTCGAGAGCTGTTGTCTTTCTTTTATTTTGCTTGTTTTTTCCATGTGTGTTGAGTGGTGATAGAGAAGCACTTCTGGAACTGAAATCATCCATGGATACTTCCAGTTCTTTACAATGGAGAGGAAGTGATTTCTGCAAATGGGAAGGAGTTCGAGAATGCTTGAGAGGTCGAGTCTCGAAACTTGTTCTTGAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

570 aa · TkA05G465970|TK1151|PROTEIN

MENPSQTFNFFFRNLTSSEMRSSRAVVFLLFCLFFPCVLSGDREALLELKSSMDTSSSLQWRGSDFCKWEGVRECLRGRVSKLVLENLNLTGTLDSRIVNQLDQIRVLSLKQNSISGQIPDLSGLANLKSLYLSHNNFSGEFPASLTTLHRLKIIVLSSNRLSGTIPDSLLDLQRLYVFHVDDNNFTGKIPPFSQTTLTYLNLSNNQLSGEIPMTRTLLRFNSTSFTGNIDLCSNSFSIPCGFAPSPSFTPAYPTATNGT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G465970
TK1151 IDTkA05G465970
OH-1004 IDLXL04_022429
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.474 / OH-1004 84.195
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G465970
位置Chr05:116820865-116823801 (-)
描述Similar to At1g60630: Inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g60630
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g60630 非活性富含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g60630。 暂无已核实直接文献
At5g67200 可能为非活性受体激酶At5g67200。 暂无已核实直接文献
At2g26730 可能失活的受体激酶 At2g26730。 暂无已核实直接文献
At5g35390 受体样激酶参与花粉萌发和花粉管极性生长的控制。
AtPRK2 promotes ROP1 activation via RopGEFs in the control of polarized pollen tube growth.2013 · DOI: 10.1093/mp/sss103
At3g08680 可能的非活性受体激酶 At3g08680。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009898 cytoplasmic side of plasma membrane 细胞组分
GO:0016328 lateral plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G60630
ath:AT1G68400
ath:AT2G26730
ath:AT5G58300
ath:AT5G67200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.877
排名 1 · TkA05G465970 · TK1151
内质网0.086
排名 2 · TkA05G465970 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA05G465970 · TK1151
细胞核0.050
排名 4 · TkA05G465970 · TK1151
溶酶体／液泡0.022
排名 5 · TkA05G465970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20237DUF659422-40 aa
PF08263LRRNT_240-72 aa
PF13855LRR_880-138 aa
PF00560LRR_183-94 aa
PF12799LRR_485-92 aa
PF23598LRR_1485-185 aa
PF24141LRR_ComC104-213 aa
PF00560LRR_1105-121 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G465970PF20237DUF659422400.3211.6
TkA05G465970PF08263LRRNT_240722.1e-0731.8
TkA05G465970PF13855LRR_8801384.5e-0936.6
TkA05G465970PF00560LRR_183942.4e-1348.1
TkA05G465970PF12799LRR_485921.3e-1041.9
TkA05G465970PF23598LRR_14851854e-0523.2
TkA05G465970PF24141LRR_ComC1042130.00119.5
TkA05G465970PF00560LRR_11051212.4e-1348.1
TkA05G465970PF12799LRR_41051411.3e-1041.9
TkA05G465970PF13516LRR_61061160.0009519.8
TkA05G465970PF13516LRR_61261410.0009519.8
TkA05G465970PF00560LRR_11271492.4e-1348.1
TkA05G465970PF13855LRR_81271864.5e-0936.6
TkA05G465970PF07723LRR_21271410.09314.1
TkA05G465970PF12799LRR_41511931.3e-1041.9
TkA05G465970PF07723LRR_21511640.09314.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84MA9拟南芥sp|Q84MA9|Y1063_ARATH Inactive leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6063058.700%Swiss-Prot高置信
Q93Y06拟南芥sp|Q93Y06|Y5720_ARATH Probable inactive receptor kinase At5g6720048.100%Swiss-Prot中等置信
O48788拟南芥sp|O48788|Y2267_ARATH Probable inactive receptor kinase At2g2673040.300%Swiss-Prot中等置信
C0LGU0拟南芥sp|C0LGU0|PRK1_ARATH Pollen receptor-like kinase 136.800%Swiss-Prot中等置信
Q9C9Y8拟南芥sp|Q9C9Y8|Y3868_ARATH Probable inactive receptor kinase At3g0868037.800%Swiss-Prot中等置信

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