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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G453160
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113427318-113428612 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1188 bp · TkA05G453160|TK1151|cDNA

TCGGAAAACACTGTTAAAGTCTCGCCGGACTCAGACTTGGCGTGGCGGCTCATTTTCATGATGGGTGCAATTCCGGCGTCTTTGACTTACTATTGGCAGATGAAGATGCCTGAAACCGCCCGATTCACAGCTTTGATCAAGAATAACCCATTACAAGCAGCCAAAGATATGGAGAAAGTGTTAAATGTATCACTTAGTTTAATCCTAGAAGATATCGAGACTATCAGTAGCCCCATCACTCTTGTTGATTACTCCTATGA...

954 bp · TkA05G453160|TK1151|CDS

ATGATGGGTGCAATTCCGGCGTCTTTGACTTACTATTGGCAGATGAAGATGCCTGAAACCGCCCGATTCACAGCTTTGATCAAGAATAACCCATTACAAGCAGCCAAAGATATGGAGAAAGTGTTAAATGTATCACTTAGTTTAATCCTAGAAGATATCGAGACTATCAGTAGCCCCATCACTCTTGTTGATTACTCCTATGATTTATTTTCTATGGAATTTCTCCGGCGACATGGCCGTGATCTCATTGCAGCATCCAT...

317 aa · TkA05G453160|TK1151|PROTEIN

MMGAIPASLTYYWQMKMPETARFTALIKNNPLQAAKDMEKVLNVSLSLILEDIETISSPITLVDYSYDLFSMEFLRRHGRDLIAASINRFLLDIVFYSLNLFQYHAFKHHTIAKNYNMDPYGVAMQVAVVQAIIAVCAVIPASFVTVFLIDYVGRVKIQAVGFFSMAICLFIMAKINKVNWGSETSGGFIMLYGLALFFSNCGPNTTTFVVPTELFPARFRATCHGISGGVGKVGAVIGTIGFLWASRDTPHVPDVSNVF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G453160
TK1151 IDTkA05G453160
OH-1004 IDLXL04_022245
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 59.032
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G453160
位置Chr05:113427318-113428612 (-)
描述Similar to PHT1-9: Probable inorganic phosphate transporter 1-9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76430 外部无机磷酸盐的高亲和力转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g20860 外部无机磷酸盐的高亲和力转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0325200 外部无机磷酸盐的高亲和力转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os10g0444700 外部无机磷酸盐的高亲和力转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os06g0324800 外部无机磷酸盐的高亲和力转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:1901684 arsenate ion transmembrane transport 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005315 phosphate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
GO:0015415 ATPase-coupled phosphate ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20860
ath:AT1G76430
dosa:Os06g0324800
dosa:Os06g0325200
osa:4340904
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.404
排名 1 · TkA05G453160 · TK1151
溶酶体/液泡0.227
排名 2 · TkA05G453160 · TK1151
内质网0.175
排名 3 · TkA05G453160 · TK1151
细胞质0.116
排名 4 · TkA05G453160 · TK1151
高尔基体0.102
排名 5 · TkA05G453160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00083Sugar_tr3-288 aa
PF07690MFS_1111-283 aa
PF24220DUF7439130-147 aa
PF24709DUF7670137-205 aa
PF24220DUF7439214-266 aa
PF24709DUF7670259-259 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G453160PF00083Sugar_tr32881e-2488.0
TkA05G453160PF07690MFS_11112835.9e-0626.1
TkA05G453160PF24220DUF74391301470.3111.6
TkA05G453160PF24709DUF76701372054.58.5
TkA05G453160PF24220DUF74392142660.3111.6
TkA05G453160PF24709DUF76702592594.58.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S735拟南芥sp|Q9S735|PHT19_ARATH Probable inorganic phosphate transporter 1-953.000%Swiss-Prot高置信
Q9SYQ1拟南芥sp|Q9SYQ1|PHT18_ARATH Probable inorganic phosphate transporter 1-850.200%Swiss-Prot高置信
Q69T94水稻sp|Q69T94|PT110_ORYSJ Probable inorganic phosphate transporter 1-1045.000%Swiss-Prot中等置信
Q8H6G8水稻sp|Q8H6G8|PHT18_ORYSJ Probable inorganic phosphate transporter 1-845.500%Swiss-Prot中等置信
Q8H6G7水稻sp|Q8H6G7|PHT19_ORYSJ Probable inorganic phosphate transporter 1-943.800%Swiss-Prot中等置信

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