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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G452440
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113275754-113278030 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1439 bp · TkA05G452440|TK1151|cDNA

TTTTTCTCTCGTTTGTTTTTATTTGTATGATGTTCCCTATCAAATACTTCATCGCTAAGGTTGAAACATATATAAGGATTTAGGGAATTAAAGACACAAAGAATCTCATCTTCAGATTTAGATTTAAGAATTTTTTTTTCTTGCTTCACAAACTGCAATTGCTTACTCAGAGAAGGATGCAGTTTTCCACTGGTCTTATATTACTCCTTCCTGTATTGGGTATTATTTTTCGATATTTACAGAAACATCAGGAGGAAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1263 bp · TkA05G452440|TK1151|CDS

ATGCAGTTTTCCACTGGTCTTATATTACTCCTTCCTGTATTGGGTATTATTTTTCGATATTTACAGAAACATCAGGAGGAAGATGATGGGCAGCAGAATAATTCATCCATGTCATCATCACCGGATCAACAACAATCCTTACACGAAGAAGAAGAAGAAGAAGATGGTCAGAGGAAGGATTTATTCTCATCAACCTTACAGGATAATCAATGTCGTCACTTTTCACTTGCTGAAATCAAGTTGGCCACCAATGATTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

421 aa · TkA05G452440|TK1151|PROTEIN

MQFSTGLILLLPVLGIIFRYLQKHQEEDDGQQNNSSMSSSPDQQQSLHEEEEEEDGQRKDLFSSTLQDNQCRHFSLAEIKLATNDFDDVIGKGGFGNVYKGTIDSGEDVAIKRLKLDSSQGAAEFQAEIEMLSQFRHIHIVPLLGYHEGSDEREMILIYKYMSNGSLEDHLHKRRVEGTNSSPLTWVQRLQICIGAARGLDYLHSGTAVESRVIHRDIKSSNILLDENLAAKISDFGLSRIGPVNLVGTTNVYTDQIKGT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G452440
TK1151 IDTkA05G452440
OH-1004 IDLXL04_022235
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 54.113
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G452440
位置Chr05:113275754-113278030 (+)
描述Similar to PBL4: Probable serine/threonine-protein kinase PBL4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022235 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26970
ath:AT2G02800
ath:AT2G17220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.736
排名 1 · TkA05G452440 · TK1151
细胞质0.188
排名 2 · TkA05G452440 · TK1151
细胞核0.151
排名 3 · TkA05G452440 · TK1151
内质网0.056
排名 4 · TkA05G452440 · TK1151
高尔基体0.032
排名 5 · TkA05G452440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase22-75 aa
PF12330Haspin_kinase78-131 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr86-364 aa
PF00069Pkinase88-362 aa
PF03109ABC189-115 aa
PF01636APH114-169 aa
PF03109ABC1208-240 aa
PF01636APH209-244 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G452440PF00069Pkinase22754.3e-43148.3
TkA05G452440PF12330Haspin_kinase781310.06812.9
TkA05G452440PF07714PK_Tyr_Ser-Thr863641.4e-46159.6
TkA05G452440PF00069Pkinase883624.3e-43148.3
TkA05G452440PF03109ABC1891150.001318.7
TkA05G452440PF01636APH1141690.02615.0
TkA05G452440PF03109ABC12082400.001318.7
TkA05G452440PF01636APH2092440.02615.0
TkA05G452440PF12330Haspin_kinase2152420.06812.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FN92拟南芥sp|Q9FN92|Y5597_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g5970050.600%Swiss-Prot高置信
Q9SCZ4拟南芥sp|Q9SCZ4|FERON_ARATH Receptor-like protein kinase FERONIA49.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FID8拟南芥sp|Q9FID8|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g3900049.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SJT0拟南芥sp|Q9SJT0|Y2214_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g2148049.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LX66拟南芥sp|Q9LX66|HERK_ARATH Receptor-like protein kinase HERK 152.300%Swiss-Prot高置信

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