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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G452410
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113263574-113268824 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3112 bp · TkA05G452410|TK1151|cDNA

AAAAAATTGAAGAAAAAGCCCATTATTTATTCATCTTACATCAGCCATCTTGAGTTCTGTACTTGTATTCTCCCTGACGAATCATCACACTTCCATCTTAAAGATTGAATCTTTCCTTCACTACCAAGGATCTTGATTCTTGATCAACTGTTGCGATTCCCTAGGGGGCTTATGGTGGGGTTCCTGAGATTGCAAGGAGAATCTTGAACAAACAACAAATCAGCACGATTGGAAAAAGGTTTCAAGAACATAGGATTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1869 bp · TkA05G452410|TK1151|CDS

ATGGATAATAATAATGATGCGTTTACATTCGAAAATCCATCAGACTCACTTATGGATTTCGATTACATGGATGAACTCTTGTTAGACGGGTGTTGGTTACAAGCAACCGACGGATCCGAAATCGTGAACAACAATCCTCCTCCTTCCAACTCCATCTTCAATCCTTCATTTCAATGGCCGAATTTGGAATCCAATATCGGGGAGCCAGTTTCAAAAGACATGATCACCCCCGAAAGAAATTCGTCGAATCCCCATATCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

622 aa · TkA05G452410|TK1151|PROTEIN

MDNNNDAFTFENPSDSLMDFDYMDELLLDGCWLQATDGSEIVNNNPPPSNSIFNPSFQWPNLESNIGEPVSKDMITPERNSSNPHIKNLINQPESSKRWWIPPRASSGPSLSVIERLIYAIDNIKHYTVDKNVLIQVWLPEIRDGQKELCTSQQLFSLELNCPRLSNYRSISEKYRFPAEGNPTESVGLPGRVFMGKVPEWTPDVRLFKVEEYPRVSHAQEQDVRGSVAVPVFDQDVKNCIGVVEVIMTTQKSTYPLEIQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G452410
TK1151 IDTkA05G452410
OH-1004 IDLXL04_015217
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.087 / OH-1004 71.795
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G452410
位置Chr05:113263574-113268824 (+)
描述Similar to NLP4: Protein NLP4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76350 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g20640 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At4g35270 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g17150 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0131100 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015217 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000987 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0001216 DNA-binding transcription activator activity 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20640
ath:AT1G64530
ath:AT1G76350
ath:AT4G38340
dosa:Os01g0236700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.762
排名 1 · TkA05G452410 · TK1151
细胞质0.295
排名 2 · TkA05G452410 · TK1151
细胞膜0.084
排名 3 · TkA05G452410 · TK1151
内质网0.048
排名 4 · TkA05G452410 · TK1151
质体0.023
排名 5 · TkA05G452410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13185GAF_235-71 aa
PF22922GAF_NLP135-251 aa
PF13185GAF_2186-257 aa
PF14215bHLH-MYC_N187-234 aa
PF22922GAF_NLP286-456 aa
PF14215bHLH-MYC_N351-407 aa
PF13185GAF_2353-396 aa
PF14215bHLH-MYC_N431-468 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G452410PF13185GAF_235716.3e-0730.4
TkA05G452410PF22922GAF_NLP1352515.6e-80267.6
TkA05G452410PF13185GAF_21862576.3e-0730.4
TkA05G452410PF14215bHLH-MYC_N1872340.1712.9
TkA05G452410PF22922GAF_NLP2864565.6e-80267.6
TkA05G452410PF14215bHLH-MYC_N3514070.1712.9
TkA05G452410PF13185GAF_23533966.3e-0730.4
TkA05G452410PF14215bHLH-MYC_N4314680.1712.9
TkA05G452410PF01498HTH_Tnp_Tc3_24494770.1812.8
TkA05G452410PF02042RWP-RK5156011.1e-2693.4
TkA05G452410PF13542HTH_Tnp_ISL35255540.09412.9
TkA05G452410PF12728HTH_175325630.2312.5
TkA05G452410PF01498HTH_Tnp_Tc3_25375660.1812.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SFW8拟南芥sp|Q9SFW8|NLP5_ARATH Protein NLP548.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LE38拟南芥sp|Q9LE38|NLP4_ARATH Protein NLP448.000%Swiss-Prot中等置信
Q7X9B9拟南芥sp|Q7X9B9|NLP2_ARATH Protein NLP239.800%Swiss-Prot中等置信
Q8H111拟南芥sp|Q8H111|NLP1_ARATH Protein NLP141.600%Swiss-Prot中等置信
Q10S83水稻sp|Q10S83|NLP1_ORYSJ Protein NLP144.700%Swiss-Prot中等置信

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