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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G448690
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 112161327-112168389 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4700 bp · TkA05G448690|TK1151|cDNA

AATAGGTCGATATTTTGATCTAAGCCGTTGAAATAATGAACGGTTGACGTGCCATAATGTGATTAAACCCACAAGATTCCTTCCCCTGCACCAACAACTAGAAGCAGACTCTAGAGCCTCCTCTGTTTGTTTGTCCCTTTCCCATTTCATCATCATCGTCATCAATCCTCTTTATCATTCAAACCCTACACACCAATCCATCTCTATCTCATGTACTCCTGCTCGCCCTCTTACTTACCCTACCTCTTTTGTTCTTCTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

3144 bp · TkA05G448690|TK1151|CDS

ATGATGATGTCATTCAGACATTCACTACAGACAACCAGCTTTCAGAACTTGAAGAGAGAGATAGAGATGGGGGTTCCAGTTCGGCCAGCAGGGGTGATGGGCGCGGATAATCTGAGCGAGAAAGCGGCAAAGATGAGGGAGTCACTGCTGAAGAGTCAGTCAATCACAGACAACATGGTTTCCATCCTTGGTTCCTTCGACCACCGTCTCTCCGCCCTAGAAACCGCCATGCGCCCAACTCAGATCAGAACACATGCTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1047 aa · TkA05G448690|TK1151|PROTEIN

MMMSFRHSLQTTSFQNLKREIEMGVPVRPAGVMGADNLSEKAAKMRESLLKSQSITDNMVSILGSFDHRLSALETAMRPTQIRTHAIRRAHENIDRTLKSADVILDRFDLSCEILRGPHEDLESYLEAIEQLRSNIVFFTNNKSFKSSDGVISHASNLLSKAISKLEQEYKQLLSSYSKSVDPDRLYECLPSSLRPSSGSPDANGKNPSNSHTGHITAENAVFAPLILIPPRVLPLLHDLAQHMVQAGHLQQCLVVYRDT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G448690
TK1151 IDTkA05G448690
OH-1004 IDLXL04_022167
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.994 / OH-1004 99.711
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G448690
位置Chr05:112161327-112168389 (-)
描述Similar to EXO70A1: Exocyst complex component EXO70A1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03540 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。
AtEXO70A1, a member of a family of putative exocyst subunits specifically expanded in land plants, is important for polar growth and plant development.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02854.x
Arabidopsis exocyst subunits SEC8 and EXO70A1 and exocyst interactor ROH1 are involved in the localized deposition of seed coat pectin.2010 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03372.x
The Arabidopsis exocyst complex is involved in cytokinesis and cell plate maturation.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.074351
The exocyst complex contributes to PIN auxin efflux carrier recycling and polar auxin transport in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12074
EXO70A1-mediated vesicle trafficking is critical for tracheary element development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.112144
Microtubule-dependent targeting of the exocyst complex is necessary for xylem development in Arabidopsis.2017 · DOI: 10.1111/nph.14267
At5g52350 胞吐复合体（exocyst）的组分，参与调控性或极性分泌过程中，胞吐囊泡与质膜融合位点的对接。 暂无已核实直接文献
At5g58430 胞吐复合体（exocyst）亚复合物的组分，特异性参与自噬相关且不依赖高尔基体的向液泡膜运输。
Arabidopsis exocyst subcomplex containing subunit EXO70B1 is involved in autophagy-related transport to the vacuole.2013 · DOI: 10.1111/tra.12101
The N-Terminal UND Motif of the Arabidopsis U-Box E3 Ligase PUB18 Is Critical for the Negative Regulation of ABA-Mediated Stomatal Movement and Determines Its Ubiquitination Specificity for Exocyst Subunit Exo70B1.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00347
At1g07000 胞吐复合体（exocyst）亚复合物的组分，特异性参与自噬相关且不依赖高尔基体的向液泡膜运输。
The role for the exocyst complex subunits Exo70B2 and Exo70H1 in the plant-pathogen interaction.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq402
The ubiquitin ligase PUB22 targets a subunit of the exocyst complex required for PAMP-triggered responses in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104463
The N-Terminal UND Motif of the Arabidopsis U-Box E3 Ligase PUB18 Is Critical for the Negative Regulation of ABA-Mediated Stomatal Movement and Determines Its Ubiquitination Specificity for Exocyst Subunit Exo70B1.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00347
At5g13990 花粉管尖端最佳生长所需。
EXO70C2 Is a Key Regulatory Factor for Optimal Tip Growth of Pollen.2017 · DOI: 10.1104/pp.16.01282
Regulation of Exocyst Function in Pollen Tube Growth by Phosphorylation of Exocyst Subunit EXO70C2.2020 · DOI: 10.3389/fpls.2020.609600

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022167 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000919 cell plate assembly 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002238 response to molecule of fungal origin 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07000
ath:AT5G03540
ath:AT5G13990
ath:AT5G52350
ath:AT5G58430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.595
排名 1 · TkA05G448690 · TK1151
细胞核0.323
排名 2 · TkA05G448690 · TK1151
细胞膜0.159
排名 3 · TkA05G448690 · TK1151
高尔基体0.068
排名 4 · TkA05G448690 · TK1151
内质网0.064
排名 5 · TkA05G448690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20669Exo70_N97-175 aa
PF03081Exo70_C117-184 aa
PF26086Niban2120-185 aa
PF03081Exo70_C296-540 aa
PF26086Niban2349-455 aa
PF11521TFIIE-A_C613-649 aa
PF07706TAT_ubiq643-654 aa
PF11521TFIIE-A_C666-680 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G448690PF20669Exo70_N971753.2e-1660.1
TkA05G448690PF03081Exo70_C1171848.1e-82275.9
TkA05G448690PF26086Niban21201850.03515.0
TkA05G448690PF03081Exo70_C2965408.1e-82275.9
TkA05G448690PF26086Niban23494550.03515.0
TkA05G448690PF11521TFIIE-A_C6136493.48.8
TkA05G448690PF07706TAT_ubiq6436540.1512.9
TkA05G448690PF11521TFIIE-A_C6666803.48.8
TkA05G448690PF07706TAT_ubiq6746850.1512.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZD3拟南芥sp|Q9LZD3|E70A1_ARATH Exocyst complex component EXO70A175.400%Swiss-Prot低置信
F4KG58拟南芥sp|F4KG58|E70A3_ARATH Exocyst complex component EXO70A357.100%Swiss-Prot低置信
Q9FGH9拟南芥sp|Q9FGH9|E70B1_ARATH Exocyst complex component EXO70B133.100%Swiss-Prot低置信
Q9LMJ4拟南芥sp|Q9LMJ4|E70B2_ARATH Exocyst complex component EXO70B228.500%Swiss-Prot低置信
Q9FFX6拟南芥sp|Q9FFX6|E70C2_ARATH Exocyst complex component EXO70C233.600%Swiss-Prot低置信

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