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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G448430
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 112093691-112094869 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1179 bp · TkA05G448430|TK1151|cDNA

ATGGCTTCCGTCTCTTTCTTTCTTCCAATCATGATAGCATTTATCATCTTCTTCTTCTTCGTCTGCGTTGAATCAATTGAAGACAAGAAAACCAACGATGGAGCTGTTATTAATGTTACAAAACACTTCTCTTTCACTGATTTCAATACCCCAAGAACTGTTCATGATATCATGCTGCTGGGGAGCTCCGTCGTGGATAAAACCGGTCGAATTCAAATACCTGACACCACCCAGAACGACGTCGTCGATCTGAAGCACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1179 bp · TkA05G448430|TK1151|CDS

ATGGCTTCCGTCTCTTTCTTTCTTCCAATCATGATAGCATTTATCATCTTCTTCTTCTTCGTCTGCGTTGAATCAATTGAAGACAAGAAAACCAACGATGGAGCTGTTATTAATGTTACAAAACACTTCTCTTTCACTGATTTCAATACCCCAAGAACTGTTCATGATATCATGCTGCTGGGGAGCTCCGTCGTGGATAAAACCGGTCGAATTCAAATACCTGACACCACCCAGAACGACGTCGTCGATCTGAAGCACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

392 aa · TkA05G448430|TK1151|PROTEIN

MASVSFFLPIMIAFIIFFFFVCVESIEDKKTNDGAVINVTKHFSFTDFNTPRTVHDIMLLGSSVVDKTGRIQIPDTTQNDVVDLKHLVGRAVYAYPVRVFDPVTRTPASFETTFAFQIETTKTNESSGGGGGDGGGDGGSGFTLMITPDEFTVGRPGPWLGMLNDACDEQYKAVGIEFDTRENIQFGDPNDNHLGINLGSIVSTITVNVSEFGINLKDGEIHRAWVHYNSQNRFLDIRLDSDSRGYPSKLVFSGELDISE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G448430
TK1151 IDTkA05G448430
OH-1004 IDLXL04_022158
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 57.310
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G448430
位置Chr05:112093691-112094869 (+)
描述Similar to LECRK82: L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g55830 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At3g55550 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At5g06740 可能的L型凝集素结构域受体激酶 S.5。 暂无已核实直接文献
At1g70110 推定含L型凝集素结构域的受体激酶V.1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022158 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G53380
ath:AT3G55550
ath:AT5G03140
ath:AT5G06740
ath:AT5G55830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.618
排名 1 · TkA05G448430 · TK1151
内质网0.140
排名 2 · TkA05G448430 · TK1151
细胞质0.099
排名 3 · TkA05G448430 · TK1151
溶酶体／液泡0.092
排名 4 · TkA05G448430 · TK1151
细胞外0.078
排名 5 · TkA05G448430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05814Ac765-29 aa
PF06422PDR_CDR10-28 aa
PF25184YxzE10-31 aa
PF00139Lectin_legB41-295 aa
PF18483Lectin_L-type_dom109-282 aa
PF05268GP38112-141 aa
PF25184YxzE124-141 aa
PF05268GP38309-319 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G448430PF05814Ac765290.0514.3
TkA05G448430PF06422PDR_CDR10281.39.6
TkA05G448430PF25184YxzE10315.08.9
TkA05G448430PF00139Lectin_legB412951.7e-53182.4
TkA05G448430PF18483Lectin_L-type_dom1092822.2e-1041.5
TkA05G448430PF05268GP381121410.1413.0
TkA05G448430PF25184YxzE1241415.08.9
TkA05G448430PF05268GP383093190.1413.0
TkA05G448430PF25184YxzE3123185.08.9
TkA05G448430PF05814Ac763213500.0514.3
TkA05G448430PF25184YxzE3253505.08.9
TkA05G448430PF06422PDR_CDR3273551.39.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FHG4拟南芥sp|Q9FHG4|LRKS7_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.730.900%Swiss-Prot中等置信
Q9M2S4拟南芥sp|Q9M2S4|LRKS4_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.431.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FG33拟南芥sp|Q9FG33|LRKS5_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.530.800%Swiss-Prot中等置信
O04534拟南芥sp|O04534|LRK51_ARATH Putative L-type lectin-domain containing receptor kinase V.125.600%Swiss-Prot低置信

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