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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G444640
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111189487-111193994 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2140 bp · TkA05G444640|TK1151|cDNA

TTTAAATAGCATTTATTCATGTGTATAGATCCAAGAGCACCACCAAACCGGTTCCTTCCCCTTCGTACAGGTTTTCTACGACTGGTGCCACATGTCCAAGCACGCCTTTTGGGTTCGGGTTGGTTGCAACCATCTCAACTGCTGATATCGGTTGTGTCTGATTTACCTTGAACCCTCATACACCAGAGTTCCCAACACACCGAGTACGACAGCGTTCCATTTCTGCCGTTTCCCTGTCGGCGAAACGTGCCGTTTGATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1461 bp · TkA05G444640|TK1151|CDS

ATGGGATCAGACAGTTGCAACTGGCATTCAGATTTGGACTATGACCAATGGGTTGCCCTTCCAGTAACTGGCCCACGACCATCATCTCGTTACAAGCATACTGCAGGCATCATTAATGAAAAGCTGTACATTGTTGGTGGAAGTCGTAATGGACGATATTTATCTGATGTTCAGGCACTTGATCTAAGAAACTTAATTTGGTCCACAATCAAATTAAAACCTCAGTCAGATCCTGATAACAAGAAAGATGGTAAATTATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

486 aa · TkA05G444640|TK1151|PROTEIN

MGSDSCNWHSDLDYDQWVALPVTGPRPSSRYKHTAGIINEKLYIVGGSRNGRYLSDVQALDLRNLIWSTIKLKPQSDPDNKKDGKLLEAFPATSGHSMVKWGNKLLLLGGHSKNTSDTVAVRFIDLESHVSGLIETTGKIPVARGGQSVTLIGSKLIMFGGEDKNRRLLNDVHVLDLETMIWNVAETTRTPPAPRFDHTAAVHGDRYLQIFGGCSHSTFFSDLHVLDLETLEWSQPQIQGNIVSPRAGHAGVSIDEKWFI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G444640
TK1151 IDTkA05G444640
OH-1004 IDLXL04_022096
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.553
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G444640
位置Chr05:111189487-111193994 (-)
描述Similar to ACBP6: Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g27630 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
At3g05420 以非常高的亲和力结合中链和长链酰基辅酶A酯。
ACBP4 and ACBP5, novel Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins with kelch motifs that bind oleoyl-CoA.2004 · DOI: 10.1007/s11103-004-0642-z
Arabidopsis acyl-CoA-binding proteins ACBP4 and ACBP5 are subcellularly localized to the cytosol and ACBP4 depletion affects membrane lipid composition.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9392-7

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0835600 以高亲和力结合中链和长链酰基辅酶 A 酯。
The rice acyl-CoA-binding protein gene family: phylogeny, expression and functional analysis.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03546.x
Subcellular localization of rice acyl-CoA-binding proteins (ACBPs) indicates that OsACBP6::GFP is targeted to the peroxisomes.2014 · DOI: 10.1111/nph.12809
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022096 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0010008 endosome membrane 细胞组分
GO:0000062 fatty-acyl-CoA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05420
ath:AT5G27630
bta:533613
ddi:DDB_G0268860
dosa:Os03g0835600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.509
排名 1 · TkA05G444640 · TK1151
细胞核0.284
排名 2 · TkA05G444640 · TK1151
高尔基体0.107
排名 3 · TkA05G444640 · TK1151
细胞膜0.101
排名 4 · TkA05G444640 · TK1151
过氧化物酶体0.086
排名 5 · TkA05G444640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13854Kelch_HCF8-47 aa
PF13964Beta-prop_Calicin8-70 aa
PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC79-74 aa
PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR110-149 aa
PF24996NANM14-61 aa
PF13415Beta-prop_FBX4216-73 aa
PF25210Kelch_FKB9527-77 aa
PF13418Beta-prop_TYW427-73 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G444640PF13854Kelch_HCF8473.1e-31109.6
TkA05G444640PF13964Beta-prop_Calicin8700.004916.6
TkA05G444640PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC79742.4e-68230.4
TkA05G444640PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR1101491.5e-51176.1
TkA05G444640PF24996NANM14619.9e-0831.9
TkA05G444640PF13415Beta-prop_FBX4216732.8e-51174.8
TkA05G444640PF25210Kelch_FKB9527771.2e-1455.3
TkA05G444640PF13418Beta-prop_TYW427737.9e-1246.3
TkA05G444640PF01344Kelch_130703.8e-29100.5
TkA05G444640PF07646Kelch_230628.6e-2173.5
TkA05G444640PF13854Kelch_HCF512133.1e-31109.6
TkA05G444640PF25210Kelch_FKB95672071.2e-1455.3
TkA05G444640PF24996NANM901259.9e-0831.9
TkA05G444640PF13415Beta-prop_FBX42922172.8e-51174.8
TkA05G444640PF13854Kelch_HCF932633.1e-31109.6
TkA05G444640PF01344Kelch_1931173.8e-29100.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWD9拟南芥sp|Q8RWD9|ACBP5_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 544.300%Swiss-Prot中等置信
Q9MA55拟南芥sp|Q9MA55|ACBP4_ARATH Acyl-CoA-binding domain-containing protein 443.200%Swiss-Prot中等置信
Q75LJ4水稻sp|Q75LJ4|ACBP6_ORYSJ Acyl-CoA-binding domain-containing protein 636.500%Swiss-Prot中等置信

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