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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G443010
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 110683561-110684406 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

732 bp · TkA05G443010|TK1151|cDNA

ATGGCCGCCGCAGCACCACCACCACTGCCGACCACCACACCGGAACTCAACATGGATCTCCCGAACAACTACCCACTCTTCACCAGGATCCGCCTGGCCACCAGAACCGACGTCCCTGTCATCCACAAAATGATCTACCAAATGGCCGTATTCGAACGCCTCGCCAACGAATGCTCCGCCACCGAACCTTCCCTTGCCACTACCCTCTTCTCCAAAGACAACCCCTTCGAATCCTTCACCGTGTTCCTAATCGAAGCTTC...

732 bp · TkA05G443010|TK1151|CDS

ATGGCCGCCGCAGCACCACCACCACTGCCGACCACCACACCGGAACTCAACATGGATCTCCCGAACAACTACCCACTCTTCACCAGGATCCGCCTGGCCACCAGAACCGACGTCCCTGTCATCCACAAAATGATCTACCAAATGGCCGTATTCGAACGCCTCGCCAACGAATGCTCCGCCACCGAACCTTCCCTTGCCACTACCCTCTTCTCCAAAGACAACCCCTTCGAATCCTTCACCGTGTTCCTAATCGAAGCTTC...

243 aa · TkA05G443010|TK1151|PROTEIN

MAAAAPPPLPTTTPELNMDLPNNYPLFTRIRLATRTDVPVIHKMIYQMAVFERLANECSATEPSLATTLFSKDNPFESFTVFLIEASTKPFPPSSIGHHPKFTPIHKTLNLDYPISDPESEVFKSSTMEDGVIVAGFVLFFPNYSTFLAKPGFYIEDLFVRESYRRKGLGKMLLSAVARQAVAMGYGRVEWVVLDWNTNAIKFYEEMGANVMKEWRESERWIRVFWWWYNVNCLISPFPDVKT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G443010
TK1151 IDTkA05G443010
OH-1004 IDLXL04_022050
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G443010
位置Chr05:110683561-110684406 (-)
描述Similar to At2g39020: Probable acetyltransferase NATA1-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g39020 可能的蛋白乙酰转移酶,具有双特异性,可触发N-α-乙酰化(NTA)和ε-赖氨酸乙酰化(KA)。 暂无已核实直接文献
At2g39030 乙酰转移酶,可将鸟氨酸转化为 N5-乙酰鸟氨酸,可能用于植物防御。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022050 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006591 ornithine metabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009447 putrescine catabolic process 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0070458 cellular detoxification of nitrogen compound 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0004145 diamine N-acetyltransferase activity 分子功能
GO:0004596 protein-N-terminal amino-acid acetyltransferase activity 分子功能
GO:0008080 N-acetyltransferase activity 分子功能
GO:0050366 tyramine N-feruloyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G39020
ath:AT2G39030
nta:107789681
nta:107822189
spo:2543272
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.730
排名 1 · TkA05G443010 · TK1151
细胞核0.456
排名 2 · TkA05G443010 · TK1151
过氧化物酶体0.063
排名 3 · TkA05G443010 · TK1151
线粒体0.056
排名 4 · TkA05G443010 · TK1151
质体0.049
排名 5 · TkA05G443010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13302Acetyltransf_330-84 aa
PF00583Acetyltransf_1115-208 aa
PF13508Acetyltransf_7130-208 aa
PF13673Acetyltransf_10134-213 aa
PF08445FR47148-212 aa
PF17013Acetyltransf_15150-180 aa
PF14542Acetyltransf_CG154-186 aa
PF12568PanZ155-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G443010PF13302Acetyltransf_330840.008117.6
TkA05G443010PF00583Acetyltransf_11152081.2e-1868.2
TkA05G443010PF13508Acetyltransf_71302081.1e-1042.4
TkA05G443010PF13673Acetyltransf_101342132.5e-0834.7
TkA05G443010PF08445FR471482121.7e-0731.8
TkA05G443010PF17013Acetyltransf_151501800.3111.1
TkA05G443010PF14542Acetyltransf_CG1541860.0714.0
TkA05G443010PF12568PanZ1551820.00716.6
TkA05G443010PF13880Acetyltransf_131551830.04114.4
TkA05G443010PF13302Acetyltransf_31592090.008117.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV06拟南芥sp|Q9ZV06|GNAT8_ARATH GCN5-related N-acetyltransferase 864.900%Swiss-Prot高置信
Q9ZV05拟南芥sp|Q9ZV05|NATA1_ARATH L-ornithine N5-acetyltransferase NATA158.800%Swiss-Prot高置信

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