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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G436890
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 109086566-109088778 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1423 bp · TkA05G436890|TK1151|cDNA

TTTTTCTTTAACAGTTCACTGAATGTTTTGTAAAATAAATTTTTTCATGCCATAAACTTTGGATTAATATTGATTGTGGTTTCCTATAAAAAACATCAGAATTCGAGGCTTGATAACAACAATATATACATATTTTCTCGGTTGCACTTTCTTCAATATTATTATTGGGAGCTCCTAGGCCTAGCTAACCAATAGTTCCCTAATCCAATGGGCCGTTAAATACATGAATTACCTCACTCACTACCTTTTAGAGCATTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

642 bp · TkA05G436890|TK1151|CDS

ATGGCGATCGAGATCTGCTGCAAAGCTGCTACCGGAGCTCCTGACGTTCTTGGAGACTGTCCGTTTTGTCAAAGGGTTCTTTTGACTCTGGAAGAGAAGAAAGTAACTTACACCACCCATCTGATTAATCTGGACAACAAACCTCAATGGTTTCTCGAAGTGAACCCCGACGGGAAAGTTCCGTTGATAAAATTCGACGACAAATGGATTTCCGATTCAGACGTTATCGTGGGTTTGATCGAAGAGAAGTTCCCTGAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

213 aa · TkA05G436890|TK1151|PROTEIN

MAIEICCKAATGAPDVLGDCPFCQRVLLTLEEKKVTYTTHLINLDNKPQWFLEVNPDGKVPLIKFDDKWISDSDVIVGLIEEKFPEPSLSSSPEFASVGSKIFPKFVAFVKSKDTNDGSEQALIDELKSLDEHLKDHGPYVNGEKITAVDLSLAPKLYHLEVALGHFKKWTVPENLTHVHNYTKALFALESFEKTKAAKEHMIAGWAPKVNNA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G436890
TK1151 IDTkA05G436890
OH-1004 IDLXL04_021979
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.208
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G436890
位置Chr05:109086566-109088778 (-)
描述Similar to DHAR2: Glutathione S-transferase DHAR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g75270 显示双重功能。
Functional divergence in the glutathione transferase superfamily in plants. Identification of two classes with putative functions in redox homeostasis in Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m202919200
Cytosolic dehydroascorbate reductase is important for ozone tolerance in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1093/pcp/pci246
At1g19570 显示双重功能。
A plant homolog of animal chloride intracellular channels (CLICs) generates an ion conductance in heterologous systems.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m607241200
At5g36270 具有谷胱甘肽依赖的巯基转移酶和脱氢抗坏血酸（DHA）还原酶活性。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0116100 参与抗坏血酸稳态。
Scavenging reactive oxygen species by rice dehydroascorbate reductase alleviates oxidative stresses in Escherichia coli.2008 · PMID: 19011360
Homologous expression of cytosolic dehydroascorbate reductase increases grain yield and biomass under paddy field conditions in transgenic rice (Oryza sativa L. japonica).2013 · DOI: 10.1007/s00425-013-1862-8
Structural understanding of the recycling of oxidized ascorbate by dehydroascorbate reductase (OsDHAR) from Oryza sativa L. japonica.2016 · DOI: 10.1038/srep19498
Os06g0232600 参与抗坏血酸稳态。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021979 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0010731 protein glutathionylation 生物过程
GO:0019852 L-ascorbic acid metabolic process 生物过程
GO:0033355 ascorbate glutathione cycle 生物过程
GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程
GO:0043903 regulation of biological process involved in symbiotic interaction 生物过程
GO:0070301 cellular response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0080151 positive regulation of salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19570
ath:AT1G75270
dosa:Os05g0116100
dosa:Os06g0232600
osa:4337622
osa:4340581
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.795
排名 1 · TkA05G436890 · TK1151
细胞核0.244
排名 2 · TkA05G436890 · TK1151
线粒体0.111
排名 3 · TkA05G436890 · TK1151
细胞膜0.076
排名 4 · TkA05G436890 · TK1151
内质网0.063
排名 5 · TkA05G436890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22441CLIC-like_N3-85 aa
PF13417GST_N_319-87 aa
PF00462Glutaredoxin19-68 aa
PF13409GST_N_220-82 aa
PF02798GST_N20-77 aa
PF17172GST_N_421-89 aa
PF10568Tom3753-86 aa
PF00043GST_C103-189 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G436890PF22441CLIC-like_N3851.5e-0938.6
TkA05G436890PF13417GST_N_319872.7e-1763.6
TkA05G436890PF00462Glutaredoxin19680.001719.3
TkA05G436890PF13409GST_N_220821.7e-1867.7
TkA05G436890PF02798GST_N20778.4e-0729.9
TkA05G436890PF17172GST_N_421890.003218.8
TkA05G436890PF10568Tom3753860.1912.8
TkA05G436890PF00043GST_C1031890.0007720.4
TkA05G436890PF14497GST_C_31181820.001819.2
TkA05G436890PF13410GST_C_21201848.3e-0729.8
TkA05G436890PF17172GST_N_41231380.003218.8
TkA05G436890PF21972Arc1p_N_like1241610.08114.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FRL8拟南芥sp|Q9FRL8|DHAR2_ARATH Glutathione S-transferase DHAR272.600%Swiss-Prot高置信
Q9FWR4拟南芥sp|Q9FWR4|DHAR1_ARATH Glutathione S-transferase DHAR1, mitochondrial67.500%Swiss-Prot高置信
Q9FG59拟南芥sp|Q9FG59|DHAR4_ARATH Probable glutathione S-transferase DHAR466.700%Swiss-Prot高置信
Q65XA0水稻sp|Q65XA0|DHAR1_ORYSJ Probable glutathione S-transferase DHAR1, cytosolic67.900%Swiss-Prot高置信
Q67UK9水稻sp|Q67UK9|DHAR2_ORYSJ Probable glutathione S-transferase DHAR2, chloroplastic60.600%Swiss-Prot高置信

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