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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G433560
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 108207267-108218526 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1787 bp · TkA05G433560|TK1151|cDNA

ATAAAAGCCCTATACAACCACAAAAAAAACATAAAACACTTTGAAAACAAAGCATGTGTAAAGAGAGTTTTAAGAGGTTATATGTTCGTACCAAGCCTTTTATACTCATGATCCTCTTGCAAACTTCGTATGCTGTTAATGGTTTAGTTGTCAAGTCAGCCCTAAACAAGGGCTTAAATCATTATACTTTCGCTGTATACCGAAACGCTATTGCAGCTCTCTTCTTTGCTCCTTTCGCTTTCTTCCTTGAAAGGAAAGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1140 bp · TkA05G433560|TK1151|CDS

ATGTGTAAAGAGAGTTTTAAGAGGTTATATGTTCGTACCAAGCCTTTTATACTCATGATCCTCTTGCAAACTTCGTATGCTGTTAATGGTTTAGTTGTCAAGTCAGCCCTAAACAAGGGCTTAAATCATTATACTTTCGCTGTATACCGAAACGCTATTGCAGCTCTCTTCTTTGCTCCTTTCGCTTTCTTCCTTGAAAGGAAAGTAAATAGGCCAGCAATGAAAGTCTCCATCTTCCTGAAGATCATGTTACTAGGATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

379 aa · TkA05G433560|TK1151|PROTEIN

MCKESFKRLYVRTKPFILMILLQTSYAVNGLVVKSALNKGLNHYTFAVYRNAIAALFFAPFAFFLERKVNRPAMKVSIFLKIMLLGLLEPVIDQNLFYAGMKFTTATFATSMCNIVPAIAFVMAWIFRLEKVNIRSFHSQGKIIGTIVTIGGAMIMTFIRGPSFQFPWAHHHTLHHQSTIATMSTQDQIKGSLMITVGCFCWASFVILQAVTLKSYTASLSLTTLICMMGALEGSILTLVAENGNASVWAVNWDIKLFAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G433560
TK1151 IDTkA05G433560
OH-1004 IDLXL04_021962
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G433560
位置Chr05:108207267-108218526 (+)
描述Similar to At2g39510: WAT1-related protein At2g39510
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g39510 WAT1 相关蛋白 At2g39510。 暂无已核实直接文献
At2g37460 与WAT1相关的蛋白At2g37460。 暂无已核实直接文献
At5g13670 WAT1 相关蛋白 At5g13670。 暂无已核实直接文献
At4g08290 WAT1相关蛋白At4g08290。 暂无已核实直接文献
At2g37450 与 WAT1 相关的蛋白质 At2g37450。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021962 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0048316 seed development 生物过程
GO:0098712 L-glutamate import across plasma membrane 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0015186 L-glutamine transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21890
ath:AT2G37460
ath:AT2G39510
ath:AT4G08290
ath:AT5G13670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.488
排名 1 · TkA05G433560 · TK1151
溶酶体／液泡0.189
排名 2 · TkA05G433560 · TK1151
内质网0.177
排名 3 · TkA05G433560 · TK1151
细胞质0.074
排名 4 · TkA05G433560 · TK1151
高尔基体0.072
排名 5 · TkA05G433560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17591UL41A6-18 aa
PF00892EamA16-156 aa
PF05653Mg_trans_NIPA35-49 aa
PF05653Mg_trans_NIPA86-162 aa
PF19360TadB_TadC_N101-126 aa
PF04226Transgly_assoc120-159 aa
PF00892EamA190-329 aa
PF17591UL41A193-217 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G433560PF17591UL41A6180.1812.6
TkA05G433560PF00892EamA161561.1e-2694.5
TkA05G433560PF05653Mg_trans_NIPA35490.0003220.7
TkA05G433560PF05653Mg_trans_NIPA861620.0003220.7
TkA05G433560PF19360TadB_TadC_N1011260.6710.5
TkA05G433560PF04226Transgly_assoc1201591.59.9
TkA05G433560PF00892EamA1903291.1e-2694.5
TkA05G433560PF17591UL41A1932170.1812.6
TkA05G433560PF19360TadB_TadC_N2012190.6710.5
TkA05G433560PF04226Transgly_assoc2763061.59.9
TkA05G433560PF05653Mg_trans_NIPA2853380.0003220.7
TkA05G433560PF04226Transgly_assoc3123241.59.9
TkA05G433560PF19360TadB_TadC_N3143440.6710.5
TkA05G433560PF28880T2SSM_N3153560.07213.9
TkA05G433560PF17591UL41A3153600.1812.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80638拟南芥sp|O80638|WTR14_ARATH WAT1-related protein At2g3951053.000%Swiss-Prot高置信
Q9ZUS1拟南芥sp|Q9ZUS1|WTR13_ARATH WAT1-related protein At2g3746056.000%Swiss-Prot高置信
Q9FNA5拟南芥sp|Q9FNA5|WTR39_ARATH WAT1-related protein At5g1367048.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SUF1拟南芥sp|Q9SUF1|WTR31_ARATH WAT1-related protein At4g0829043.500%Swiss-Prot中等置信
F4IQX1拟南芥sp|F4IQX1|WTR12_ARATH WAT1-related protein At2g3745048.400%Swiss-Prot中等置信

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