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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G405710
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 100912749-100915543 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2261 bp · TkA05G405710|TK1151|cDNA

GGCCAATGGGGTCTTTGCTTTTCATCGATCAAAGTTGACGTGGCAAATTACAGCCATTCAGCGACACGATAGATATTTGTTTAGATTTTTTTGGTTCAGATATTTTGATTCATTTCATGTTTACAATAGATGATAACTTTTGCTTCTTTCAAACGAATCCAAGACATTTTGTAATCACCACAAACAAACAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCTTTTTTCTACACTTTTCTCGATCGGAAGTGAGTATGGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1908 bp · TkA05G405710|TK1151|CDS

ATGTTTACAATAGATGATAACTTTTGCTTCTTTCAAACGAATCCAAGACATTTTGTAATCACCACAAACAAACAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGCTCTCTTTTTTCTACACTTTTCTCGATCGGAAGTGAGTATGGGGGAAGCGTTAGTGAGCAGCAACGGCGGCGGGAAGATAGCTGACATGCCGGAGTTGTTGATGCGAAGTGAAGACAAGACGAACGATGGCGGTGGTGGTGACTCACCAACCACCGCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

635 aa · TkA05G405710|TK1151|PROTEIN

MFTIDDNFCFFQTNPRHFVITTNKQPLSLSLSLALFFLHFSRSEVSMGEALVSSNGGGKIADMPELLMRSEDKTNDGGGGDSPTTAIATATNVVRWEKFLPKMSLRVLLVEADDCTRQIITALLRKCSYKVVAVSDGLKAWEVLKGKSQHIDLILTEVELPSISGFALLTLITEHQVCKNIPVIMMSAQDSVSTVYKCMLRGAADFLVKPVRKNELKNLWQHVWRRQASTAGVNGHQEESEADAQQKVEATAENNATSNR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G405710
TK1151 IDTkA05G405710
OH-1004 IDLXL04_021557
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.756 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G405710
位置Chr05:100912749-100915543 (-)
描述Similar to APRR5: Two-component response regulator-like APRR5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24470 CCA1 和 LHY 的转录抑制因子，从而控制光周期开花反应。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043
At2g46790 CCA1 和 LHY 的转录抑制因子，以及 LWD1 和 LWD2 表达的正调节因子。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043
At5g60100 控制光周期开花反应。
Circadian waves of expression of the APRR1/TOC1 family of pseudo-response regulators in Arabidopsis thaliana: insight into the plant circadian clock.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd043

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0532400 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XFB7 控制光周期开花反应。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021557 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010218 response to far red light 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048511 rhythmic process 生物过程
GO:0051170 import into nucleus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G46790
ath:AT5G24470
dosa:Os09g0532400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.933
排名 1 · TkA05G405710 · TK1151
细胞质0.111
排名 2 · TkA05G405710 · TK1151
细胞膜0.054
排名 3 · TkA05G405710 · TK1151
内质网0.030
排名 4 · TkA05G405710 · TK1151
质体0.015
排名 5 · TkA05G405710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00788RA102-127 aa
PF00072Response_reg107-218 aa
PF02045CBFB_NFYA454-454 aa
PF00788RA566-592 aa
PF02045CBFB_NFYA572-621 aa
PF06203CCT575-617 aa
PF09425Jas_motif575-597 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G405710PF00788RA1021270.02315.9
TkA05G405710PF00072Response_reg1072184.7e-2279.0
TkA05G405710PF02045CBFB_NFYA4544544.88.2
TkA05G405710PF00788RA5665920.02315.9
TkA05G405710PF02045CBFB_NFYA5726214.88.2
TkA05G405710PF06203CCT5756171e-1764.6
TkA05G405710PF09425Jas_motif5755970.2711.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6LA42拟南芥sp|Q6LA42|APRR5_ARATH Two-component response regulator-like APRR540.000%Swiss-Prot中等置信
Q8L500拟南芥sp|Q8L500|APRR9_ARATH Two-component response regulator-like APRR938.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LVG4拟南芥sp|Q9LVG4|APRR3_ARATH Two-component response regulator-like APRR331.900%Swiss-Prot中等置信
Q689G6水稻sp|Q689G6|PRR95_ORYSJ Two-component response regulator-like PRR9535.400%Swiss-Prot中等置信
A2XFB7水稻sp|A2XFB7|PRR73_ORYSI Two-component response regulator-like PRR7348.900%Swiss-Prot低置信

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