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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G402120
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 100088683-100092374 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3430 bp · TkA05G402120|TK1151|cDNA

AAGAACACCCTGGAGATGGACCCACTTTTTGAATAATTGATGTACCCTCTTATTAATCAATCATCACTCACCTCCCTCACTCCATGAGAAGAACACAAACACCACGGATTTCATCACCTCCGTCATCTCCTCCGATTCAACATGAAACTTCACATGTAAACTCATCGGAATCATATCATTCATACTCTTTCATTCCCAGAAATGGAATCCCGTATGATCACCTATCTAAACTGCACTTGCATTGCCTTCCTTCTTCTCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2889 bp · TkA05G402120|TK1151|CDS

ATGGAATCCCGTATGATCACCTATCTAAACTGCACTTGCATTGCCTTCCTTCTTCTCCTTCCTCTGTTTTTTGCTGACGGAAAAGTTTTAATTTCCGCGCCCAATGATGAAATCTCGTCACTCCTCTCTATCAAATCCGCCATTGTCGATTCTTTAAGCTATCTCGCAGACTGGAACTCGTCGTCGCCGTCAATTTCTTCATCGCACTGCAACTGGACTGGAGTTTCATGCAATGAAGATGGCTTTGTTGAAAAGCTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

962 aa · TkA05G402120|TK1151|PROTEIN

MESRMITYLNCTCIAFLLLLPLFFADGKVLISAPNDEISSLLSIKSAIVDSLSYLADWNSSSPSISSSHCNWTGVSCNEDGFVEKLDLSSMNLTGNISDDFQNFHHLSFLNISTNGFSTTLPKSFANLTSLVTMDVSENNFVGEFPEGFGIGATRLKTVNASSNNFSGFLPEYLANATSLETLDFRGSFFVGSIPKSYRNLRNLKFLGLSGNNLTGEIPPEIGELSSLEVIIIGYNGFEGSIPPEIGNLSNLQYLDLAVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G402120
TK1151 IDTkA05G402120
OH-1004 IDLXL04_021532
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.792 / OH-1004 87.035
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G402120
位置Chr05:100088683-100092374 (+)
描述Similar to PXL1: Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At1g08590 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。 暂无已核实直接文献
At5g61480 与CLE41p、CLE44p肽构成配体-受体对，参与维管组织发育中的信号转导，调控原形成层的维持及极性。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献
At5g65700 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021532 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010223 secondary shoot formation 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08590
ath:AT3G49670
ath:AT4G28650
ath:AT5G61480
ath:AT5G65700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.865
排名 1 · TkA05G402120 · TK1151
内质网0.091
排名 2 · TkA05G402120 · TK1151
细胞质0.056
排名 3 · TkA05G402120 · TK1151
细胞核0.036
排名 4 · TkA05G402120 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA05G402120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_235-78 aa
PF00560LRR_184-104 aa
PF13855LRR_884-141 aa
PF12799LRR_484-121 aa
PF25013LRR_Zer-184-108 aa
PF23598LRR_1486-184 aa
PF24048LRR_NXF1-597-120 aa
PF29870YDR417C103-123 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G402120PF08263LRRNT_235787.3e-1039.7
TkA05G402120PF00560LRR_1841044.1e-58181.4
TkA05G402120PF13855LRR_8841417.4e-45151.3
TkA05G402120PF12799LRR_4841211.2e-37127.7
TkA05G402120PF25013LRR_Zer-1841089.1e-0626.6
TkA05G402120PF23598LRR_14861841.5e-36126.6
TkA05G402120PF24048LRR_NXF1-5971201.19.6
TkA05G402120PF29870YDR417C1031230.0004321.0
TkA05G402120PF00560LRR_11061284.1e-58181.4
TkA05G402120PF23286LRR_131191386.5e-0626.7
TkA05G402120PF25013LRR_Zer-11191439.1e-0626.6
TkA05G402120PF12799LRR_41231451.2e-37127.7
TkA05G402120PF29870YDR417C1281540.0004321.0
TkA05G402120PF00560LRR_11301504.1e-58181.4
TkA05G402120PF12799LRR_41541931.2e-37127.7
TkA05G402120PF00560LRR_11551764.1e-58181.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M0G7拟南芥sp|Q9M0G7|MIK1_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 163.600%Swiss-Prot低置信
Q9FRS6拟南芥sp|Q9FRS6|PXL1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL160.300%Swiss-Prot低置信
Q9FII5拟南芥sp|Q9FII5|TDR_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR43.200%Swiss-Prot低置信
Q9M2Z1拟南芥sp|Q9M2Z1|BAME2_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM248.600%Swiss-Prot低置信
O49545拟南芥sp|O49545|BAME1_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM145.800%Swiss-Prot低置信

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