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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G399020
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 99210170-99213743 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2251 bp · TkA05G399020|TK1151|cDNA

AGGACTCTCAAAAGCTTCGCGAACTTAAAACCCTTTGATTTAGGTCTCCTTTCCCTTCTCTCTTTCTGTGTTATCTATCCTCTTATCATTCCACCACGAACAAACCAACCTACACTTTCGATTTTATTTTGGAAAATCCGCCATAAATCTACCCCGTTTGCAGGTAGCTCCCATTAATCAACGTCAACAAAACATGGCATCTGCATCTCCCAATATTTGGGTTTTGCTGGGTTTGAGTTTGGCCGGAATACTGTTGATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1779 bp · TkA05G399020|TK1151|CDS

ATGGCATCTGCATCTCCCAATATTTGGGTTTTGCTGGGTTTGAGTTTGGCCGGAATACTGTTGATGGCGAAGAAGCTTAAGAAAGTCGTCAAAGCTGACTTTGGGGCATTCGTGGAGCGGTTTCAGTTACTACCTCCGCCGCAGCCGGCTCCTCCAAAAGCCCCTCATCCGCTCACTGGCCTCTCCTTTGCCGTCTCCGACCTATTCGACATCAATGGGTTTGTAACCGGATTCGGCACTCCAGACTGGGAAAGGACACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

592 aa · TkA05G399020|TK1151|PROTEIN

MASASPNIWVLLGLSLAGILLMAKKLKKVVKADFGAFVERFQLLPPPQPAPPKAPHPLTGLSFAVSDLFDINGFVTGFGTPDWERTHEAASQTSPVVSALVDGGATCVGKTVVDEMSFGISGENRHYDAPTNPVAPSRIPGGSCSGAAVAVAAKLVDFSLGVDTVGGVRQPAAHCGILGFKPSFGSVSHSGIIPISTSFDTVGWFAMDPSILRRVGQVLLQVPLTIQRNPRNVIIADDCFKLSKIPVDRLTQVVIKSTET...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G399020
TK1151 IDTkA05G399020
OH-1004 IDLXL04_017125
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)46.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.324 / OH-1004 60.142
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G399020
位置Chr05:99210170-99213743 (+)
描述Similar to OM64: Outer envelope protein 64, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g17970 伴侣受体介导 Hsp90 依赖性蛋白靶向叶绿体。
Toc64/OEP64 is not essential for the efficient import of proteins into chloroplasts in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03207.x
At5g09420 分子伴侣受体，介导Hsp90依赖的蛋白质靶向到线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g08980 酰胺酶参与生长素生物合成。
Molecular cloning and characterization of an amidase from Arabidopsis thaliana capable of converting indole-3-acetamide into the plant growth hormone, indole-3-acetic acid.2003 · DOI: 10.1016/s0031-9422(02)00563-0
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0118100 参与生长素生物合成的酰胺酶（可能性）。
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程
GO:0009684 indoleacetic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0030150 protein import into mitochondrial matrix 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08980
ath:AT3G17970
ath:AT5G09420
dosa:Os04g0118100
osa:4334958
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.451
排名 1 · TkA05G399020 · TK1151
细胞质0.252
排名 2 · TkA05G399020 · TK1151
过氧化物酶体0.196
排名 3 · TkA05G399020 · TK1151
细胞核0.100
排名 4 · TkA05G399020 · TK1151
质体0.098
排名 5 · TkA05G399020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13414TPR_115-15 aa
PF01425Amidase55-208 aa
PF23606HEAT_ULK4276-337 aa
PF01425Amidase349-441 aa
PF25575TPR_BSK1_C443-542 aa
PF29407CFAP70_TPR_C444-539 aa
PF07719TPR_2477-507 aa
PF13424TPR_12477-505 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G399020PF13414TPR_115152e-0628.1
TkA05G399020PF01425Amidase552084.7e-51174.9
TkA05G399020PF23606HEAT_ULK42763370.01315.6
TkA05G399020PF01425Amidase3494414.7e-51174.9
TkA05G399020PF25575TPR_BSK1_C4435427.6e-0626.5
TkA05G399020PF29407CFAP70_TPR_C4445390.004217.3
TkA05G399020PF07719TPR_24775071.3e-1350.6
TkA05G399020PF13424TPR_124775050.2212.4
TkA05G399020PF00515TPR_14805078.9e-1451.3
TkA05G399020PF13432TPR_164825404.2e-0524.6
TkA05G399020PF13428TPR_144835070.1413.6
TkA05G399020PF25063ARM_TT21_C4855740.2511.9
TkA05G399020PF13414TPR_114875242e-0628.1
TkA05G399020PF13371TPR_94875420.002518.5
TkA05G399020PF14559TPR_194875080.2112.7
TkA05G399020PF04212MIT4885050.2912.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LVH5拟南芥sp|Q9LVH5|OE64C_ARATH Outer envelope protein 64, chloroplastic65.300%Swiss-Prot高置信
F4KCL7拟南芥sp|F4KCL7|OE64M_ARATH Outer envelope protein 64, mitochondrial48.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FR37拟南芥sp|Q9FR37|AMI1_ARATH Amidase 148.900%Swiss-Prot中等置信
Q7XTK3水稻sp|Q7XTK3|AMI1_ORYSJ Amidase 147.800%Swiss-Prot中等置信

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