TkA05G391450 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G391450

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 97271372-97274124 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1878 bp · TkA05G391450|TK1151|cDNA

TTAATTTATACAGAATGTTTGAGATATTTCTAAGCAAATAATTGTTCATATTTTACCAATCGTTATACCTATATGTAGTTAAACAAAAAAGCCGCCATATAAATGTTATGCACACTATAATAATGGCCTGAAAGAATTTTACCGCCCAAATTACTCATACATATTTAAACAAAAAAAACTTAAATATGACAAATCGTACCATATAGGCAGGTGTAAGGAGCATTTAAGGCTCATCAAATGCAACGTCATGAATGCGCCTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1392 bp · TkA05G391450|TK1151|CDS

ATGGAATCTGCGGTGGCTGATTTGGACGGCTGGCGTAATCTGAGGGTGGTGGAAACCATCTACGAGGAGGATTCCGGTGACTCTTCTTCCTCCACTACCCCTTCTCTCTCCTCTCCTCCGCCTCCCTCCTCCCCTTCCACAACCTCTCTCCGCTCCCGAGTTAAAGCTTGGTCCTTCAATAATGGAGTTGAAACCAATGTGATGGTACATGTTCAAGAGTCAACTTTTCACTTGCACAAGGATCCTCTGGCGCGATGCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

463 aa · TkA05G391450|TK1151|PROTEIN

MESAVADLDGWRNLRVVETIYEEDSGDSSSSTTPSLSSPPPPSSPSTTSLRSRVKAWSFNNGVETNVMVHVQESTFHLHKDPLARCSRYLKRQLTESSEVSLSPPLKITPHTFTLVADYCYGGNLFITPFNLASLLLAAELLEMHDGPENVENLRRKTEAYYQRTVAVDRDYATVVLKSCMELLPDVETKTGLLTRCVEALSLNRDGGHVLSMFDGVQKLSGEEFRLVVGALHQKVAGSHDLLYRIIDFYFKEVGGKMTE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G391450`
TK1151 ID	TkA05G391450
OH-1004 ID	LXL04_006700
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G391450

位置 Chr05:97271372-97274124 (+)

描述 Similar to At3g49900: BTB/POZ domain-containing protein At3g49900

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g49900`	可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。	暂无已核实直接文献
`At3g50840`	可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。	暂无已核实直接文献
`At5g13600`	可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。	暂无已核实直接文献
`At5g48130`	可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。	暂无已核实直接文献
`At3g03510`	可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006700 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009638 phototropism 生物过程

GO:0009904 chloroplast accumulation movement 生物过程

GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30520

ath:AT3G49900

ath:AT5G67385

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.502

排名 1 · TkA05G391450 · TK1151

细胞核0.387

排名 2 · TkA05G391450 · TK1151

细胞膜0.234

排名 3 · TkA05G391450 · TK1151

内质网0.045

排名 4 · TkA05G391450 · TK1151

溶酶体／液泡0.035

排名 5 · TkA05G391450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00651BTB59-153 aa

PF26725TPR_INTS8_369-103 aa

PF11822BTB_SANBR72-146 aa

PF19111DUF5798149-173 aa

PF03000NPH3219-278 aa

PF26725TPR_INTS8_3260-379 aa

PF16689APC_N_CC341-378 aa

PF19111DUF5798346-378 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G391450	`PF00651`	BTB	59	153	3.6e-11	43.9
TkA05G391450	`PF26725`	TPR_INTS8_3	69	103	0.25	11.7
TkA05G391450	`PF11822`	BTB_SANBR	72	146	0.018	16.0
TkA05G391450	`PF19111`	DUF5798	149	173	0.0027	18.6
TkA05G391450	`PF03000`	NPH3	219	278	7.4e-08	33.1
TkA05G391450	`PF26725`	TPR_INTS8_3	260	379	0.25	11.7
TkA05G391450	`PF16689`	APC_N_CC	341	378	0.21	12.5
TkA05G391450	`PF19111`	DUF5798	346	378	0.0027	18.6
TkA05G391450	`PF11822`	BTB_SANBR	351	376	0.018	16.0
TkA05G391450	`PF14077`	WDR18_C	356	376	0.12	13.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M2W8`	拟南芥	sp\|Q9M2W8\|Y3990_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At3g49900	41.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8LPQ3`	拟南芥	sp\|Q8LPQ3\|Y3084_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At3g50840	32.500%	Swiss-Prot	低置信
`Q9FNB3`	拟南芥	sp\|Q9FNB3\|Y5360_ARATH Putative BTB/POZ domain-containing protein At5g13600	33.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q9LUB9`	拟南芥	sp\|Q9LUB9\|Y5813_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At5g48130	30.400%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SRQ5`	拟南芥	sp\|Q9SRQ5\|Y3351_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At3g03510	35.400%	Swiss-Prot	低置信

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