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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G332990
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 81989179-81991003 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1656 bp · TkA05G332990|TK1151|cDNA

TTGCACTAAAATTGTAAATTAAACGAAAGTGTTAGGACCAATTTTGTAACTTACTAAAGATATTAATTCTCAGTCGTCGTTTGCACTACTCAACCCACCAAACTCCATCTTGACAAAATTGAATCTCCGGCGATCATGGGTGGCACAACGACTTCCCCGACGGCGGACGCTACTGCCTTTGACGACTCCGAATCACCATCGCTCCCGCTCCTTCCAGAGCCCAACGCCAAAGCCCCCGAAGACTCGTACCATTTAGCCTA...

1260 bp · TkA05G332990|TK1151|CDS

ATGGGTGGCACAACGACTTCCCCGACGGCGGACGCTACTGCCTTTGACGACTCCGAATCACCATCGCTCCCGCTCCTTCCAGAGCCCAACGCCAAAGCCCCCGAAGACTCGTACCATTTAGCCTACATAATCTACTTCATCCTTGGCATCGGTTACTTGATTCCATGGAACGCATTCATCACAGCCGTCGATTACTTCTCATATCTCTACCCCGATGCCTCCGTCGATCGTGTTTTCGCCGTCGTTTACATGGTTGTAGG...

419 aa · TkA05G332990|TK1151|PROTEIN

MGGTTTSPTADATAFDDSESPSLPLLPEPNAKAPEDSYHLAYIIYFILGIGYLIPWNAFITAVDYFSYLYPDASVDRVFAVVYMVVGLVSLFIIIFYANKSHSFVRINVGLGLFVVSLLVVPVMDVTYIKGQVGVYGGFYVSVAAIALSGVADALAQGGVIGAAGEMPERYMQAVVAGTAASGVLISILRIFTKAVYSQDASGLRKSANLYFIVSIIVMIICIVLHNLAHRLPVIKHYKELKIQAVNTEKEEKGAVTGAG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G332990
TK1151 IDTkA05G332990
OH-1004 IDLXL04_028055
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)45.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 91.885 / OH-1004 96.701
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G332990
位置Chr05:81989179-81991003 (+)
描述Similar to ETN8: Equilibrative nucleotide transporter 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_028055 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0015858 nucleoside transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005337 nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02630
ath:AT1G61630
ath:AT1G70330
ath:AT3G09990
ath:AT4G05130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.377
排名 1 · TkA05G332990 · TK1151
溶酶体/液泡0.318
排名 2 · TkA05G332990 · TK1151
内质网0.166
排名 3 · TkA05G332990 · TK1151
细胞质0.115
排名 4 · TkA05G332990 · TK1151
高尔基体0.096
排名 5 · TkA05G332990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29155DDB_G028114528-96 aa
PF083957tm_740-98 aa
PF01733Nucleoside_tran88-123 aa
PF29155DDB_G0281145107-148 aa
PF01733Nucleoside_tran144-253 aa
PF083957tm_7175-304 aa
PF29155DDB_G0281145201-225 aa
PF01733Nucleoside_tran262-419 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G332990PF29155DDB_G028114528960.04515.0
TkA05G332990PF083957tm_740980.002218.1
TkA05G332990PF01733Nucleoside_tran881237.6e-72243.0
TkA05G332990PF29155DDB_G02811451071480.04515.0
TkA05G332990PF01733Nucleoside_tran1442537.6e-72243.0
TkA05G332990PF083957tm_71753040.002218.1
TkA05G332990PF29155DDB_G02811452012250.04515.0
TkA05G332990PF01733Nucleoside_tran2624197.6e-72243.0
TkA05G332990PF29155DDB_G02811453043480.04515.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VXY7拟南芥sp|Q8VXY7|ENT1_ARATH Equilibrative nucleotide transporter 168.200%Swiss-Prot高置信
Q84XI3拟南芥sp|Q84XI3|ENT8_ARATH Equilibrative nucleotide transporter 844.000%Swiss-Prot中等置信
Q9SR64拟南芥sp|Q9SR64|ENT2_ARATH Equilibrative nucleotide transporter 229.500%Swiss-Prot低置信

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