本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA05G169860
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 43620760-43625568 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1833 bp · TkA05G169860|TK1151|cDNA

ATGGAACAATGGTATGTGCATGCACATGCATGCATGGACATGGAAGCTTCTTGGAATGACTCTATGGGTGCTAAAACCGTCTATGACCAGCTAAGACCAAGTGGGATTGAAGATAGAATGGTTGGTATTCAGAAACCTGGTGGAGTGCTTGCTCTTCTGGATGAGGCTTGTTTTGAGCAGTTCTGCATTAATCTGACTAATGAGAAACTTCAGCAACATTTCAATCAGCATGTATTCAAGATGGAACAAGAAGAATATAC...

1833 bp · TkA05G169860|TK1151|CDS

ATGGAACAATGGTATGTGCATGCACATGCATGCATGGACATGGAAGCTTCTTGGAATGACTCTATGGGTGCTAAAACCGTCTATGACCAGCTAAGACCAAGTGGGATTGAAGATAGAATGGTTGGTATTCAGAAACCTGGTGGAGTGCTTGCTCTTCTGGATGAGGCTTGTTTTGAGCAGTTCTGCATTAATCTGACTAATGAGAAACTTCAGCAACATTTCAATCAGCATGTATTCAAGATGGAACAAGAAGAATATAC...

610 aa · TkA05G169860|TK1151|PROTEIN

MEQWYVHAHACMDMEASWNDSMGAKTVYDQLRPSGIEDRMVGIQKPGGVLALLDEACFEQFCINLTNEKLQQHFNQHVFKMEQEEYTREEIDWSYIQFEDNQDILDLIEKKPGGVLALLDEACFEQFCINLTNEKLQQHFNQHVFKMEQEEYTREEIDWSYIQFEDNQDILDLIEKKPGGVLALLDEACFEQFCINLTNEKLQQHFNQHVFNMEQEEYTREEIDWSYIQFEDNQDILDLIEKKPGGVLALLDEACMFPRA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G169860
TK1151 IDTkA05G169860
OH-1004 IDLXL04_006857
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 28.852 / OH-1004 32.117
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G169860
位置Chr05:43620760-43625568 (+)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08730 肌球蛋白重链,参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输,以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g54560 肌球蛋白重链,参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输,以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At1g04600 肌球蛋白重链,参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输,以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At2g33240 肌球蛋白重链,参与细胞周期调控的各种细胞器和蛋白质的运输,以实现它们的分隔。 暂无已核实直接文献
At5g43900 肌球蛋白重链,是细胞周期调节的各种细胞器和蛋白质分离所需的重链。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_006857 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.591
排名 1 · TkA05G169860 · TK1151
细胞核0.400
排名 2 · TkA05G169860 · TK1151
线粒体0.077
排名 3 · TkA05G169860 · TK1151
细胞膜0.062
排名 4 · TkA05G169860 · TK1151
内质网0.054
排名 5 · TkA05G169860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07422s48_4541-100 aa
PF30210YKR005C_N52-92 aa
PF00063Myosin_head53-123 aa
PF04798Baculo_1955-83 aa
PF23608Ig_ILCR155-89 aa
PF16512RhoGAP-FF156-88 aa
PF24899UBA_DHX2957-76 aa
PF25945DUF798462-92 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G169860PF07422s48_45411000.2212.8
TkA05G169860PF30210YKR005C_N52925.27.8
TkA05G169860PF00063Myosin_head531238.2e-94315.9
TkA05G169860PF04798Baculo_1955830.002118.3
TkA05G169860PF23608Ig_ILCR155890.7610.6
TkA05G169860PF16512RhoGAP-FF156880.08714.1
TkA05G169860PF24899UBA_DHX2957760.0001522.2
TkA05G169860PF25945DUF798462920.5610.8
TkA05G169860PF02815MIR661121.39.6
TkA05G169860PF18036Ubiquitin_467960.001219.5
TkA05G169860PF07435YycH_N741055.17.8
TkA05G169860PF12320SbcD_C811107.47.6
TkA05G169860PF26066MCM9_N981340.006817.1
TkA05G169860PF30210YKR005C_N1181585.27.8
TkA05G169860PF04798Baculo_191211490.002118.3
TkA05G169860PF07422s48_451211660.2212.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HXP9拟南芥sp|F4HXP9|MYO9_ARATH Myosin-964.300%Swiss-Prot低置信
F4HWY6拟南芥sp|F4HWY6|MYO11_ARATH Myosin-1164.300%Swiss-Prot低置信
F4I5Q6拟南芥sp|F4I5Q6|MYO7_ARATH Myosin-764.800%Swiss-Prot低置信
F4IVR7拟南芥sp|F4IVR7|MYO10_ARATH Myosin-1065.600%Swiss-Prot低置信
Q9LKB9拟南芥sp|Q9LKB9|MYO6_ARATH Myosin-665.600%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看