RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G133660
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 34992872-34995165 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1608 bp · TkA05G133660|TK1151|cDNA

CACAACACATGTGTGATTCATTCCAAAAAAACATCCTTAAATCCCATACTTCTTTCTTCCACTTTATACAGTTTTGAAATTCATTTCTGGTACCTCGTAAAAGTACAACATCATGAGTGGAGGTGGTTTCTCCTCAAAATGGCGAAAACTAAGCGGAGAAGACAAATGGAATTCACTCTTGGAACCTCTCGACCTCGACCTAAGACGTTACCTCATGTTTTATGGTGAAAGGATTCAAGCCACCTACGACACTTTCATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1323 bp · TkA05G133660|TK1151|CDS

ATGAGTGGAGGTGGTTTCTCCTCAAAATGGCGAAAACTAAGCGGAGAAGACAAATGGAATTCACTCTTGGAACCTCTCGACCTCGACCTAAGACGTTACCTCATGTTTTATGGTGAAAGGATTCAAGCCACCTACGACACTTTCATTCTTGATCGTAGGTCAAAATACACGGGTGCAAGCAAATTCTCGCAAAGGAAATTCTTTTCACACCTAGGTCTCGATAAGGGCAACCCTATAAAATACAACGTCGTTAAGTTTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

440 aa · TkA05G133660|TK1151|PROTEIN

MSGGGFSSKWRKLSGEDKWNSLLEPLDLDLRRYLMFYGERIQATYDTFILDRRSKYTGASKFSQRKFFSHLGLDKGNPIKYNVVKFIYATSMTPDAPLSFLLKSIAKDPWLGQSNWMGYVAVSSHKSKGLLGRRDILVSWRGTIQISEWIENFDFPLTLASNVFPTSNCALVHAGFLSIYTSSNPNSRFNKTSARHQVLSTIKRLVEKYKDEDTSITVIGHSLGGALATLTGGDIAVNGYNKLTSQPTKSIPVTVFAFGN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G133660
TK1151 IDTkA05G133660
OH-1004 IDLXL04_020082
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G133660
位置Chr05:34992872-34995165 (+)
描述Similar to DSEL: Phospholipase A1-IIgamma
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18550 酰基水解酶，在 sn-1 位催化 1,3-二酰基甘油 和 1-单酰基甘油 水解。
AtDSEL, an Arabidopsis cytosolic DAD1-like acylhydrolase, is involved in negative regulation of storage oil mobilization during seedling establishment.2011 · DOI: 10.1016/j.jplph.2011.03.004
At2g31100 酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。 暂无已核实直接文献
At1g06250 酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2WT95 酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。 暂无已核实直接文献
Os01g0651100 酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020082 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0019915 lipid storage 生物过程
GO:0046340 diacylglycerol catabolic process 生物过程
GO:0052651 monoacylglycerol catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0008970 glycerophospholipid phospholipase A1 activity 分子功能
GO:0047372 monoacylglycerol lipase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06250
ath:AT2G31100
ath:AT4G18550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.413
排名 1 · TkA05G133660 · TK1151
溶酶体／液泡0.195
排名 2 · TkA05G133660 · TK1151
细胞核0.135
排名 3 · TkA05G133660 · TK1151
内质网0.104
排名 4 · TkA05G133660 · TK1151
质体0.097
排名 5 · TkA05G133660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26363Phospholipase-like131-162 aa
PF01764Lipase_3138-295 aa
PF05728UPF0227194-230 aa
PF20408Abhydrolase_11195-240 aa
PF05057DUF676196-267 aa
PF07819PGAP1197-230 aa
PF12697Abhydrolase_6198-239 aa
PF20434BD-FAE202-234 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G133660PF26363Phospholipase-like1311620.001119.0
TkA05G133660PF01764Lipase_31382951.2e-32113.5
TkA05G133660PF05728UPF02271942300.06813.8
TkA05G133660PF20408Abhydrolase_111952400.2711.6
TkA05G133660PF05057DUF6761962670.0004120.7
TkA05G133660PF07819PGAP11972300.0004820.7
TkA05G133660PF12697Abhydrolase_61982390.008817.4
TkA05G133660PF20434BD-FAE2022340.112.8
TkA05G133660PF26363Phospholipase-like2072300.001119.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49523拟南芥sp|O49523|DSEL_ARATH Phospholipase A1-IIgamma48.600%Swiss-Prot中等置信
O82274拟南芥sp|O82274|PLA19_ARATH Phospholipase A1-IIbeta47.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LNC2拟南芥sp|Q9LNC2|PLA18_ARATH Phospholipase A1-IIalpha43.800%Swiss-Prot中等置信
A2WT95水稻sp|A2WT95|PLA1_ORYSI Phospholipase A1-II 146.000%Swiss-Prot中等置信
A2ZW16水稻sp|A2ZW16|PLA1_ORYSJ Phospholipase A1-II 146.000%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看