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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G055560
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 14753004-14758237 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3127 bp · TkA05G055560|TK1151|cDNA

GAAATTTAATGTAGAAATTAGTGATCTCAACTCTTTACAATAGAAATTTACATTTTTCAGCGTATAAAACAAACTCTGTTGAGTTTTCCCTCGCTGGTTCCCAACTACGTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAATTCAAGAAATGGAGAAGAAGAAAGGCATGAAGAACATCTTCAAGAAGTTGCACATAGGCAGCAATCACGATCCTAATCGAACATCCAACGATTCAACGCCATCGTCATCGTCATCGTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2628 bp · TkA05G055560|TK1151|CDS

ATGGAGAAGAAGAAAGGCATGAAGAACATCTTCAAGAAGTTGCACATAGGCAGCAATCACGATCCTAATCGAACATCCAACGATTCAACGCCATCGTCATCGTCATCGTCGTCGTCTTGCTCCACTGCCGACCACCGTACATCTTCAACTCTCGCTGGACAAACCTCCGTCCAGTCTCCATCTACCGCCGCAAGTCCTCCTCCAACGTCTCCGACTGTCAATGTAACCTCGCGTCAACAAGATTACTATTCGTCAGAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

875 aa · TkA05G055560|TK1151|PROTEIN

MEKKKGMKNIFKKLHIGSNHDPNRTSNDSTPSSSSSSSSCSTADHRTSSTLAGQTSVQSPSTAASPPPTSPTVNVTSRQQDYYSSEEEYQVQLALALSVSNSESRGDSDSDQIRAAKLLSLGQQSSNNHAPDRGDAAADKLSRQYWDYGLLDYDEKVVDGFYDVYGLSTEMSSQGKMPSLSDLETDPQSSGFEVIIVNRTIDPALEELFQVAHCIALDCPPAEVNLLVQRVAELVTEHMGGPVRDANIILGRWLERSTEL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G055560
TK1151 IDTkA05G055560
OH-1004 IDLXL04_025974
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)47.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.943 / OH-1004 84.099
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G055560
位置Chr05:14753004-14758237 (-)
描述Similar to SIS8: Probable serine/threonine-protein kinase SIS8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08720 参与调控MAP激酶级联的MAPKKK丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶；该级联可能包括MPK3和MPK6，负向调控水杨酸（SA）依赖的防御应答、脱落酸（ABA）信号及乙烯诱导的衰老。
Negative regulation of defense responses in plants by a conserved MAPKK kinase.2001 · DOI: 10.1073/pnas.98.1.373
Overexpression of a kinase-deficient form of the EDR1 gene enhances powdery mildew resistance and ethylene-induced senescence in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01482.x
Regulation of plant disease resistance, stress responses, cell death, and ethylene signaling in Arabidopsis by the EDR1 protein kinase.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.060400
Costs and benefits of priming for defense in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0510213103
Powdery mildew resistance conferred by loss of the ENHANCED DISEASE RESISTANCE1 protein kinase is suppressed by a missense mutation in KEEP ON GOING, a regulator of abscisic acid signaling.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.127605
Mitogen-activated protein kinases 3 and 6 are required for full priming of stress responses in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.062158
The KEEP ON GOING protein of Arabidopsis recruits the ENHANCED DISEASE RESISTANCE1 protein to trans-Golgi network/early endosome vesicles.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.171785
Arabidopsis ENHANCED DISEASE RESISTANCE 1 is required for pathogen-induced expression of plant defensins in nonhost resistance, and acts through interference of MYC2-mediated repressor function.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04651.x
Negative regulation of defence signalling pathways by the EDR1 protein kinase.2011 · DOI: 10.1111/j.1364-3703.2011.00708.x
An Arabidopsis mutant with enhanced resistance to powdery mildew.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.6.947
At1g73660 作为耐盐负调节剂。
The genetic locus At1g73660 encodes a putative MAPKKK and negatively regulates salt tolerance in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s11103-008-9306-8
SIS8, a putative mitogen-activated protein kinase kinase kinase, regulates sugar-resistant seedling development in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12404
At5g03730 在乙烯反应途径中充当负调节剂。
CTR1 phosphorylates the central regulator EIN2 to control ethylene hormone signaling from the ER membrane to the nucleus in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1214848109
Unsaturation of very-long-chain ceramides protects plant from hypoxia-induced damages by modulating ethylene signaling in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1005143
CTR1, a negative regulator of the ethylene response pathway in Arabidopsis, encodes a member of the raf family of protein kinases.1993 · DOI: 10.1016/0092-8674(93)90119-b

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025974 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009686 gibberellin biosynthetic process 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08720
ath:AT1G73660
ath:AT5G03730
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.440
排名 1 · TkA05G055560 · TK1151
细胞质0.393
排名 2 · TkA05G055560 · TK1151
细胞核0.231
排名 3 · TkA05G055560 · TK1151
高尔基体0.088
排名 4 · TkA05G055560 · TK1151
内质网0.061
排名 5 · TkA05G055560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase35-80 aa
PF14381EDR1_CTR1_ARMC3_pept138-336 aa
PF12330Haspin_kinase602-633 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr605-854 aa
PF00069Pkinase606-852 aa
PF01636APH615-658 aa
PF01636APH721-750 aa
PF14531Kinase-like722-833 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G055560PF12330Haspin_kinase35800.006416.3
TkA05G055560PF14381EDR1_CTR1_ARMC3_pept1383366.1e-74248.9
TkA05G055560PF12330Haspin_kinase6026330.006416.3
TkA05G055560PF07714PK_Tyr_Ser-Thr6058542.9e-62211.0
TkA05G055560PF00069Pkinase6068523.6e-50171.5
TkA05G055560PF01636APH6156580.01615.7
TkA05G055560PF01636APH7217500.01615.7
TkA05G055560PF14531Kinase-like7228330.04613.7
TkA05G055560PF12330Haspin_kinase7257540.006416.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FPR3拟南芥sp|Q9FPR3|EDR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase EDR152.100%Swiss-Prot高置信
Q9C9U5拟南芥sp|Q9C9U5|SIS8_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase SIS840.700%Swiss-Prot中等置信
Q05609拟南芥sp|Q05609|CTR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CTR137.400%Swiss-Prot中等置信

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