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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G015110
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 4245970-4249916 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2250 bp · TkA05G015110|TK1151|cDNA

TTGAAATCTGACAGCTCGCTCCCGTCCCCATTGTTTGGCCTCTGCTTCCCCTGAAATAGTGAGAGCTTCAGTCATTTGGAAAGAGAAAAACATCATTCTAGAGAGAGAAATTGATCTCGTTTCTCTTCTCTGAGTTTGATTTTTAGTTCGTCATCAAGCAGATAAGGTTAACATTTATGGCAAGTAATTACTTCGGTGTTTTGGTATCAGATCCATGGCTACAGAATCAATTTACACAAGTCGAGCTTCGGAGCTTAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1989 bp · TkA05G015110|TK1151|CDS

ATGGCAAGTAATTACTTCGGTGTTTTGGTATCAGATCCATGGCTACAGAATCAATTTACACAAGTCGAGCTTCGGAGCTTAAAATCTTATTTTCTGACGATGAGGAGGGAAAGTGGAAGTCTCACGCTTGGTGATTTGCCATCGAAAATGTCCAAACTGAAAAACGTTGGAGAGAATCTTACCGAGGAAGAACGAGCTGCGTTTCTTCACGATTCTTATCAAAATTTAGGCGATGAAGTTGATTTCGAACTTTTTCTTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

662 aa · TkA05G015110|TK1151|PROTEIN

MASNYFGVLVSDPWLQNQFTQVELRSLKSYFLTMRRESGSLTLGDLPSKMSKLKNVGENLTEEERAAFLHDSYQNLGDEVDFELFLRVYLNLQSHATSRMGKGAKTSSAFLKSPTSTLLHTISESEKASYVGHINNYLGEDTFLKKFLPIDPSTNDLFEVAKDGVLICKLINVAVPGTIDERAINTKTVLNPWERNENHTLCLNSAKAIGCTVVNIGTQDFIEGRRHLVLGVISQIIKIQLLADLDLKKTPQLVELVGDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G015110
TK1151 IDTkA05G015110
OH-1004 IDLXL04_019051
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G015110
位置Chr05:4245970-4249916 (+)
描述Similar to FIM2: Fimbrin-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48460 交联肌动蛋白丝（F-肌动蛋白）。 暂无已核实直接文献
At5g35700 以不依赖于钙的方式交联肌动蛋白丝。
Arabidopsis FIMBRIN5, an actin bundling factor, is required for pollen germination and pollen tube growth.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.080283
At4g26700 以不依赖于钙的方式交联肌动蛋白丝。
AtFim1 is an actin filament crosslinking protein from Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00907.x
Fluorescently-labeled fimbrin decorates a dynamic actin filament network in live plant cells.2001 · DOI: 10.1007/s004250000494
At5g55400 交联肌动蛋白丝（F-肌动蛋白）。 暂无已核实直接文献
At2g04750 交联肌动蛋白丝（F-肌动蛋白）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019051 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0030036 actin cytoskeleton organization 生物过程
GO:0051017 actin filament bundle assembly 生物过程
GO:0051639 actin filament network formation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005884 actin filament 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0032432 actin filament bundle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G04750
ath:AT4G26700
ath:AT5G35700
ath:AT5G48460
ath:AT5G55400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.602
排名 1 · TkA05G015110 · TK1151
细胞膜0.218
排名 2 · TkA05G015110 · TK1151
细胞核0.159
排名 3 · TkA05G015110 · TK1151
高尔基体0.146
排名 4 · TkA05G015110 · TK1151
溶酶体／液泡0.095
排名 5 · TkA05G015110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28809FtsQ_DivIB_C_rel8-56 aa
PF28809FtsQ_DivIB_C_rel123-147 aa
PF06294CH_2148-180 aa
PF11971CAMSAP_CH149-190 aa
PF00307CH152-238 aa
PF00307CH270-371 aa
PF06294CH_2276-316 aa
PF11971CAMSAP_CH288-315 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G015110PF28809FtsQ_DivIB_C_rel8560.1812.9
TkA05G015110PF28809FtsQ_DivIB_C_rel1231470.1812.9
TkA05G015110PF06294CH_21481802e-0731.6
TkA05G015110PF11971CAMSAP_CH1491903.8e-0833.8
TkA05G015110PF00307CH1522381.4e-82273.7
TkA05G015110PF00307CH2703711.4e-82273.7
TkA05G015110PF06294CH_22763162e-0731.6
TkA05G015110PF11971CAMSAP_CH2883153.8e-0833.8
TkA05G015110PF00307CH3964981.4e-82273.7
TkA05G015110PF06294CH_24034962e-0731.6
TkA05G015110PF11971CAMSAP_CH4104743.8e-0833.8
TkA05G015110PF00307CH5196221.4e-82273.7
TkA05G015110PF06294CH_25435942e-0731.6
TkA05G015110PF11971CAMSAP_CH5445873.8e-0833.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O50064拟南芥sp|O50064|FIMB2_ARATH Fimbrin-277.400%Swiss-Prot高置信
Q9FKI0拟南芥sp|Q9FKI0|FIMB5_ARATH Fimbrin-568.200%Swiss-Prot高置信
Q7G188拟南芥sp|Q7G188|FIMB1_ARATH Fimbrin-168.300%Swiss-Prot高置信
Q9FJ70拟南芥sp|Q9FJ70|FIMB3_ARATH Fimbrin-367.600%Swiss-Prot高置信
Q9SJ84拟南芥sp|Q9SJ84|FIMB4_ARATH Fimbrin-466.200%Swiss-Prot高置信

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