TkA05G011580 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G011580

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 3307690-3310173 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

749 bp · TkA05G011580|TK1151|cDNA

CTTTATTTGGCTCCTGCCAAAATACTCCACAAAAAAAATATGGTCTTCTTCTTTCTTGTTCCTGGCCTCCTGACGACGCAAGCACAAATTTTTTTTCTGCCGCTGCACTTCTTGCCGGCAATTTTCACATTGATTCTCACCGGAGGAGCAACAACACCGTCACCTCCGGCATCTTCTTCTGGGATCACCAGCCTTCCATGGAAGGATATAAAAGCGAGGAAGCTTGGGATTCGGGAAATAATTGAGAAGAAATCATCAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

441 bp · TkA05G011580|TK1151|CDS

ATGGTCTTCTTCTTTCTTGTTCCTGGCCTCCTGACGACGCAAGCACAAATTTTTTTTCTGCCGCTGCACTTCTTGCCGGCAATTTTCACATTGATTCTCACCGGAGGAGCAACAACACCGTCACCTCCGGCATCTTCTTCTGGGATCACCAGGTTGTCATTGAATAAGTGTGGCCACCAACCACACTTAGACTTTGAGATTCCAACACTTAGAGGAAGCCTTCCATGGAAGGATATAAAAGCGAGGAAGCTTGGGATTCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

146 aa · TkA05G011580|TK1151|PROTEIN

MVFFFLVPGLLTTQAQIFFLPLHFLPAIFTLILTGGATTPSPPASSSGITRLSLNKCGHQPHLDFEIPTLRGSLPWKDIKARKLGIREIIEKKSSTPIELLCESQAVEFASYLHYCQSLRFDQRPDYGFLKSLFRELFTREDRKEW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G011580`
TK1151 ID	TkA05G011580
OH-1004 ID	LXL04_019017
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 49.315 / OH-1004 13.585 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G011580

位置 Chr05:3307690-3310173 (+)

描述 Similar to CKL3: Casein kinase 1-like protein 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g28860`	蛋白激酶，通过磷酸化 CRY2 来降低其稳定性，参与蓝光反应（如下胚轴伸长和开花）。	暂无已核实直接文献
`At4g28880`	蛋白激酶，通过磷酸化 CRY2 来降低其稳定性，参与蓝光反应（如下胚轴伸长和开花）。	暂无已核实直接文献
`At5g44100`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	暂无已核实直接文献
`At5g57015`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	暂无已核实直接文献
`At3g23340`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0622100`	酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白作为底物来定义。	Roles of OsCKI1, a rice casein kinase I, in root development and plant hormone sensitivity.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01866.x Rice LTG1 is involved in adaptive growth and fitness under low ambient temperature.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12487

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019017 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006897 endocytosis 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009637 response to blue light 生物过程

GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程

GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程

GO:0009785 blue light signaling pathway 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0009850 auxin metabolic process 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0048364 root development 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G03930

ath:AT4G28860

ath:AT4G28880

ath:AT5G44100

dosa:Os02g0622100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.445

排名 1 · TkA05G011580 · TK1151

细胞核0.353

排名 2 · TkA05G011580 · TK1151

线粒体0.150

排名 3 · TkA05G011580 · TK1151

内质网0.113

排名 4 · TkA05G011580 · TK1151

细胞膜0.106

排名 5 · TkA05G011580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8LPI7`	拟南芥	sp\|Q8LPI7\|CKL4_ARATH Casein kinase 1-like protein 4	67.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q93Z18`	拟南芥	sp\|Q93Z18\|CKL3_ARATH Casein kinase 1-like protein 3	66.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FFH8`	拟南芥	sp\|Q9FFH8\|CKL7_ARATH Casein kinase 1-like protein 7	60.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8VYK9`	拟南芥	sp\|Q8VYK9\|CKL12_ARATH Casein kinase 1-like protein 12	59.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LW62`	拟南芥	sp\|Q9LW62\|CKL10_ARATH Casein kinase 1-like protein 10	56.300%	Swiss-Prot	低置信
`Q6K9N1`	水稻	sp\|Q6K9N1\|CKI1_ORYSJ Casein kinase 1	58.100%	Swiss-Prot	中等置信

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