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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G005170
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 1522651-1527154 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3357 bp · TkA05G005170|TK1151|cDNA

GGGAGGTTCTGGTCCAATAACAAAGAATCCTGAATTAACGATGAGCACATCATCTAGACATCTACTGTTTATTACTCCATTTGCGGTTCCTTTTACGAATGCGCATTGGACACGACACATTACATTACACATCAATCAAAGATTCCATCGTCATGCGCCTACACAAAGTCTATCACCGCTTCTCTCTCTTTTCCCTCACTTCGCCCCCTTTTCTTCTTCCTCCATCTTCAACCTTCTTCTCTTCTTATTCCCCCTCTTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2883 bp · TkA05G005170|TK1151|CDS

ATGCGCATTGGACACGACACATTACATTACACATCAATCAAAGATTCCATCGTCATGCGCCTACACAAAGTCTATCACCGCTTCTCTCTCTTTTCCCTCACTTCGCCCCCTTTTCTTCTTCCTCCATCTTCAACCTTCTTCTCTTCTTATTCCCCCTCTTCCAAAAGCTGTCGAATTTCATCATCATCAACGCCTTCCACCCCCAAGCCTTTTCTCCAAACCATGTCTACCTCAAGATTACACAATCTGGTCCCTGTTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

960 aa · TkA05G005170|TK1151|PROTEIN

MRIGHDTLHYTSIKDSIVMRLHKVYHRFSLFSLTSPPFLLPPSSTFFSSYSPSSKSCRISSSSTPSTPKPFLQTMSTSRLHNLVPVAAIATEDAAGPNGSTASPEDDELDSGYRLPPAEIRDIVDAPPLPALSFSPQRDKILFLKRRSLPPLSELAKPEDKLAGVRIDGKSNTRSRMSFYTGIGIHDLRDDGTLGPEKLIHGFPAGSKLNFVTWSTDGRHLAFSIRQDQDDDGGSKLRVWVADVETGKAKPLFQSPDVFL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G005170
TK1151 IDTkA05G005170
OH-1004 IDLXL04_018948
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.125 / OH-1004 96.327
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G005170
位置Chr05:1522651-1527154 (+)
描述Similar to GEP: Probable glutamyl endopeptidase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g47390 体外活性丝氨酸型蛋白酶，可作用于LHCII N端。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0307100 体外活性丝氨酸型蛋白酶，可作用于LHCII N端。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018948 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0043171 peptide catabolic process 生物过程
GO:0051603 proteolysis involved in protein catabolic process 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0004175 endopeptidase activity 分子功能
GO:0004177 aminopeptidase activity 分子功能
GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0008239 dipeptidyl-peptidase activity 分子功能
GO:0042277 peptide binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G47390
cel:CELE_F44B9.1
dosa:Os03g0307100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.872
排名 1 · TkA05G005170 · TK1151
细胞质0.088
排名 2 · TkA05G005170 · TK1151
线粒体0.068
排名 3 · TkA05G005170 · TK1151
过氧化物酶体0.050
排名 4 · TkA05G005170 · TK1151
细胞核0.042
排名 5 · TkA05G005170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00561Abhydrolase_1199-209 aa
PF02897Peptidase_S9_N210-286 aa
PF02897Peptidase_S9_N472-592 aa
PF02129Peptidase_S15601-639 aa
PF02129Peptidase_S15664-808 aa
PF00756Esterase668-691 aa
PF01738DLH750-899 aa
PF12146Hydrolase_4752-809 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G005170PF00561Abhydrolase_11992090.009816.3
TkA05G005170PF02897Peptidase_S9_N2102860.001118.6
TkA05G005170PF02897Peptidase_S9_N4725920.001118.6
TkA05G005170PF02129Peptidase_S156016390.0001122.8
TkA05G005170PF02129Peptidase_S156648080.0001122.8
TkA05G005170PF00756Esterase6686910.009616.4
TkA05G005170PF01738DLH7508990.004817.2
TkA05G005170PF12146Hydrolase_47528090.001718.4
TkA05G005170PF02230Abhydrolase_27528100.0116.4
TkA05G005170PF10230LIDHydrolase7567970.3611.2
TkA05G005170PF00326Peptidase_S97599127.5e-2381.9
TkA05G005170PF12697Abhydrolase_67619140.0001323.3
TkA05G005170PF00756Esterase7738610.009616.4
TkA05G005170PF00561Abhydrolase_17748240.009816.3
TkA05G005170PF00561Abhydrolase_18218580.009816.3
TkA05G005170PF02129Peptidase_S158298860.0001122.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZF3拟南芥sp|Q8VZF3|CGEP_ARATH Probable glutamyl endopeptidase, chloroplastic74.500%Swiss-Prot高置信
Q10MJ1水稻sp|Q10MJ1|CGEP_ORYSJ Probable glutamyl endopeptidase, chloroplastic77.700%Swiss-Prot高置信

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