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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G000640
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 167835-173409 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2590 bp · TkA05G000640|TK1151|cDNA

TTTCTATCTCTATTTCCTACGCTAACAGTTTAAGCTAACAACTTCGTGGCACACTCGTTGTGTTCGGCGCTTCTCGCCGGTTGCTGCCGCCCTACCTCCTTCCTACTCCGTCATTCACCCCAATCGGAAACAAATCACCTCCAAGGACTCTGTTTATTTCATTGATTCTATTTTATTTCCGATAATTAAGGTAGCATTTGATTATTTCAAGGAACATAAAATGGCAACCATTTCAGATATAACGGTATCAGCTGCCATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

2301 bp · TkA05G000640|TK1151|CDS

ATGGCAACCATTTCAGATATAACGGTATCAGCTGCCATTAACAGTCTATCAGCATTATTTTTCCTAATTGCATTTGCAATTTTACGCCTTCAACCCATAAACGACCGAGTTTATTTTCCAAAATGGTATCTCAAAGGCATAAGAGAAAATCCAAGTACTTCAGGACCTTTTGTAAAGAAATTTGTGAATCTTGATTTCAGAATGTATTTAAGATTCTTAAATTGGGTGCCTGCGGCTTTAAGAATGCCTCAACCCGAGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

766 aa · TkA05G000640|TK1151|PROTEIN

MATISDITVSAAINSLSALFFLIAFAILRLQPINDRVYFPKWYLKGIRENPSTSGPFVKKFVNLDFRMYLRFLNWVPAALRMPQPELIDHAGLDSAVYIRIYLLGLKIFVPIALVAFGVLLPVNYTAGNYQDIKVNMKDITFGEIDKFSISNVPPGSKRLIVHIVLAYVFTFWTCYILYKEYKIVTNMRLRFLASENRRPDQFTVLVRNVPPDPDETVSEHVEHFFIVNHPDQYLVHKVVHNANKLASMVEKSKDLHNRL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G000640
TK1151 IDTkA05G000640
OH-1004 IDLXL04_018838
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 49.676
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G000640
位置Chr05:167835-173409 (+)
描述Similar to At4g02900: CSC1-like protein At4g02900
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g02900 参与植物气孔免疫的钙可渗透通道。 暂无已核实直接文献
At3g21620 作为一种渗透敏感的钙可通透阳离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g22120 作为渗透敏感的钙渗透性阳离子通道。
OSCA/TMEM63 are an Evolutionarily Conserved Family of Mechanically Activated Ion Channels.2018 · DOI: 10.7554/elife.41844
Structure-guided mutagenesis of OSCAs reveals differential activation to mechanical stimuli.2024 · DOI: 10.7554/elife.93147
At4g04340 可能作为高渗透压门控的非选择性阳离子通道，允许 Ca²⁺ 通过。
OSCA1 mediates osmotic-stress-evoked Ca2+ increases vital for osmosensing in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1038/nature13593
OSCA/TMEM63 are an Evolutionarily Conserved Family of Mechanically Activated Ion Channels.2018 · DOI: 10.7554/elife.41844
At1g11960 在植物气孔免疫中起关键作用的钙渗透通道。
The calcium-permeable channel OSCA1.3 regulates plant stomatal immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2702-1

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018838 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005227 calcium-activated cation channel activity 分子功能
GO:0005262 calcium channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11960
ath:AT3G21620
ath:AT4G02900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.839
排名 1 · TkA05G000640 · TK1151
细胞质0.131
排名 2 · TkA05G000640 · TK1151
内质网0.064
排名 3 · TkA05G000640 · TK1151
溶酶体／液泡0.036
排名 4 · TkA05G000640 · TK1151
高尔基体0.036
排名 5 · TkA05G000640 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13967RSN1_TM7-181 aa
PF29236DUF852156-118 aa
PF14703PHM7_cyt202-364 aa
PF02714RSN1_7TM375-647 aa
PF13967RSN1_TM376-394 aa
PF14975DUF4512389-427 aa
PF29236DUF8521592-608 aa
PF13967RSN1_TM594-620 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G000640PF13967RSN1_TM71811e-41142.9
TkA05G000640PF29236DUF8521561180.212.3
TkA05G000640PF14703PHM7_cyt2023648e-45153.9
TkA05G000640PF02714RSN1_7TM3756478.3e-86288.5
TkA05G000640PF13967RSN1_TM3763941e-41142.9
TkA05G000640PF14975DUF45123894270.2912.5
TkA05G000640PF29236DUF85215926080.212.3
TkA05G000640PF13967RSN1_TM5946201e-41142.9
TkA05G000640PF29236DUF85216566910.212.3
TkA05G000640PF14975DUF45126607460.2912.5
TkA05G000640PF29236DUF85217097330.212.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SY14拟南芥sp|Q9SY14|OSC17_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.769.400%Swiss-Prot高置信
Q9LVE4拟南芥sp|Q9LVE4|OSC15_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.565.900%Swiss-Prot高置信
Q5XEZ5拟南芥sp|Q5XEZ5|OSC12_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.265.000%Swiss-Prot高置信
Q9XEA1拟南芥sp|Q9XEA1|OSC11_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.164.800%Swiss-Prot高置信
B5TYT3拟南芥sp|B5TYT3|OSC13_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.364.900%Swiss-Prot高置信

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