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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G500530
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 126383906-126388919 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2181 bp · TkA04G500530|TK1151|cDNA

ATGGGTGCAACGATAGGGCAACTACTTCTCACCATTTTCATCCAATTTTTATTTGCAGCAGCACAAAACAATGATTATACATATCTGCGAGCTCTCAAAGATGGCTGGGATAATACACCGCCCATTGGGAAGATAACTCCGACCCCTGTAGTGGTTGGGACGGAATCAGGTGCTCAAACGGCCGTGTCACCTCCATGGCAGTTGTCTGAACTGCAAATTCTAGATCTTTCTTACAATGTGGGTTTGACCGGGTCTCTTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2181 bp · TkA04G500530|TK1151|CDS

ATGGGTGCAACGATAGGGCAACTACTTCTCACCATTTTCATCCAATTTTTATTTGCAGCAGCACAAAACAATGATTATACATATCTGCGAGCTCTCAAAGATGGCTGGGATAATACACCGCCCATTGGGAAGATAACTCCGACCCCTGTAGTGGTTGGGACGGAATCAGGTGCTCAAACGGCCGTGTCACCTCCATGGCAGTTGTCTGAACTGCAAATTCTAGATCTTTCTTACAATGTGGGTTTGACCGGGTCTCTTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

726 aa · TkA04G500530|TK1151|PROTEIN

MGATIGQLLLTIFIQFLFAAAQNNDYTYLRALKDGWDNTPPIGKITPTPVVVGTESGAQTAVSPPWQLSELQILDLSYNVGLTGSLVPAIGNLKKLTNLSLNSNGFTGPIPPSIGNIENLYWLDLADNRLSGSIPVSSGRTPGLDKLIHAKHFHFGRNRLTGTLPAQLFSSNMTLIHLRLDRNGFTGRVPSNINNLTGVFEMFLSNNRLTGPVPNLTGLGVLNYLKMSNTNLEGVLPVDLFSIPQLQNVDLSGNRLNGTL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G500530
TK1151 IDTkA04G500530
OH-1004 IDLXL04_028750
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)53.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.587 / OH-1004 99.587
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G500530
位置Chr04:126383906-126388919 (-)
描述Similar to At5g49770: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49760 富含亮氨酸的重复受体蛋白激酶，充当细胞外过氧化氢的传感器。
Hydrogen peroxide sensor HPCA1 is an LRR receptor kinase in Arabidopsis.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2032-3
At5g49770 可能的富含亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At5g49770。 暂无已核实直接文献
At5g37450 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g37450。 暂无已核实直接文献
At1g06840 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g06840。 暂无已核实直接文献
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028750 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009593 detection of chemical stimulus 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06840
ath:AT5G37450
ath:AT5G49760
ath:AT5G49770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.843
排名 1 · TkA04G500530 · TK1151
内质网0.088
排名 2 · TkA04G500530 · TK1151
细胞质0.076
排名 3 · TkA04G500530 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA04G500530 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA04G500530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_1467-137 aa
PF13855LRR_868-105 aa
PF23211LRR_LRWD168-115 aa
PF12799LRR_470-105 aa
PF00560LRR_171-93 aa
PF13516LRR_671-80 aa
PF24141LRR_ComC84-137 aa
PF23952LRR_EndoS92-95 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G500530PF23598LRR_14671370.0002320.7
TkA04G500530PF13855LRR_8681051.7e-0938.0
TkA04G500530PF23211LRR_LRWD1681150.1112.9
TkA04G500530PF12799LRR_4701055.4e-1143.1
TkA04G500530PF00560LRR_171933.4e-1553.6
TkA04G500530PF13516LRR_671804.38.3
TkA04G500530PF24141LRR_ComC841370.00218.6
TkA04G500530PF23952LRR_EndoS92950.05414.4
TkA04G500530PF13516LRR_6941084.38.3
TkA04G500530PF00560LRR_1951163.4e-1553.6
TkA04G500530PF13855LRR_8951471.7e-0938.0
TkA04G500530PF00560LRR_11191373.4e-1553.6
TkA04G500530PF12799LRR_41221475.4e-1143.1
TkA04G500530PF13516LRR_61231314.38.3
TkA04G500530PF23211LRR_LRWD11471760.1112.9
TkA04G500530PF24141LRR_ComC1501660.00218.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GZ99拟南芥sp|Q8GZ99|HPCA1_ARATH Leucine-rich repeat receptor protein kinase HPCA143.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LT96拟南芥sp|Q9LT96|Y5977_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g4977058.000%Swiss-Prot中等置信
C0LGU1拟南芥sp|C0LGU1|Y5374_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g3745043.400%Swiss-Prot低置信
C0LGD7拟南芥sp|C0LGD7|Y1684_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0684051.700%Swiss-Prot低置信
Q3E8W4拟南芥sp|Q3E8W4|ANX2_ARATH Receptor-like protein kinase ANXUR247.800%Swiss-Prot低置信

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