RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G457740
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 115434519-115436554 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1529 bp · TkA04G457740|TK1151|cDNA

AATCCATCCAAAACCGGCAAACTATTTTTTTTACTTTTTATAGAATCATAGAAAGAAAATTTGGACACGCATCTACCCGTGACCATCCCCTGCCGGCTTTCTTAGACAGGCATTAACACGTGAAAAATGACAAAACTACCCTCACTATTTGTGACTTTAAATCCGCCAAACAAGGACACAACCGTCCATACAGTCTATTTTTCTCTCTCTCCGTTTTTTCTATCTCTAAAAATGGTTTCTGTATTCGTATAACTTCCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

774 bp · TkA04G457740|TK1151|CDS

ATGGCGTCGTCGAAGGTGATGGCATCATCATCGCCGGCGAATCAGGATCTACAACGTCATCAGGCATTCGCGCATACCGTCGGTCTCACCGATCACAACAACAATTTAATTTCTATGAATATGGACGATATCCTAAAGAACGTTTACGAGGATTCGCGTCAGGCGCCGGGGAGTTTTCCCGCCAGTGGTGGAAAGACGATGGATGAAAGTTGGAAGGAGATCGTGGATGGAAGCGGTGGTGATCCAGAAATGACTCTAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

257 aa · TkA04G457740|TK1151|PROTEIN

MASSKVMASSSPANQDLQRHQAFAHTVGLTDHNNNLISMNMDDILKNVYEDSRQAPGSFPASGGKTMDESWKEIVDGSGGDPEMTLEDFLTKAGAVREEDVVKLPPVSASAVVSEYSGVVDPIICAGAGAVDAASFQVMPQQHMQFGSAIGTSAGTSGGVRGKRKVVVEDPPVDKATQQKQRRMIKNRESAARSRERKQAYTVELEALVTQLEEEHARLLKEVDELNKERLKQLMKNLVPVLEKRRPPKVLRRTNSM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G457740
TK1151 IDTkA04G457740
OH-1004 IDLXL04_038706
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G457740
位置Chr04:115434519-115436554 (+)
描述Similar to BZIP12: bZIP transcription factor 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g03970 结合rbcS-1A基因启动子的G盒基序（5′-CCACGTGG-3′）。
Isolation and characterization of a fourth Arabidopsis thaliana G-box-binding factor, which has similarities to Fos oncoprotein.1994 · DOI: 10.1073/pnas.91.7.2522
At2g36270 作为 ABA 生长抑制的主要介质，参与种子发育和随后的营养阶段 ABA 调节的基因表达。
A postgermination developmental arrest checkpoint is mediated by abscisic acid and requires the ABI5 transcription factor in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1073/pnas.081594298
Regulation of Arabidopsis thaliana Em genes: role of ABI5.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01295.x
The homologous ABI5 and EEL transcription factors function antagonistically to fine-tune gene expression during late embryogenesis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000869
Regulation and role of the Arabidopsis abscisic acid-insensitive 5 gene in abscisic acid, sugar, and stress response.2002 · DOI: 10.1104/pp.005793
ABI5 acts downstream of ABI3 to execute an ABA-dependent growth arrest during germination.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01430.x
Mitogen-activated protein kinase signaling in postgermination arrest of development by abscisic acid.2002 · DOI: 10.1073/pnas.242607499
Interactions of abscisic acid and sugar signalling in the regulation of leaf senescence.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1279-5
Transcriptional regulation of ABI3- and ABA-responsive genes including RD29B and RD29A in seeds, germinating embryos, and seedlings of Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1007/s11103-005-2418-5
Monomerization of abscisic acid receptors through CARKs-mediated phosphorylation.2022 · DOI: 10.1111/nph.18149
At2g41070 结合胚胎特异元件和Dc3基因启动子的ABA响应元件（ABRE），以及Em1基因启动子的ABRE。 暂无已核实直接文献
At3g56850 结合到胚胎特异性元件和 Dc3 基因启动子的 ABA 响应元件 (ABRE)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0867300 转录激活因子，在体外结合ABA响应元件（ABREs）。
The bZIP transcription factor OsABF1 is an ABA responsive element binding factor that enhances abiotic stress signaling in rice.2010 · DOI: 10.1007/s11103-009-9592-9
Phosphorylation of D-allose by hexokinase involved in regulation of OsABF1 expression for growth inhibition in Oryza sativa L.2013 · DOI: 10.1007/s00425-013-1853-9
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038706 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010182 sugar mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03970
ath:AT2G36270
ath:AT3G56850
dosa:Os01g0867300
dosa:Os06g0211200
osa:4325078
osa:4340462
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA04G457740 · TK1151
细胞质0.091
排名 2 · TkA04G457740 · TK1151
细胞膜0.026
排名 3 · TkA04G457740 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA04G457740 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA04G457740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03131bZIP_Maf34-48 aa
PF10915DUF2709124-220 aa
PF09660DUF2397176-253 aa
PF00170bZIP_1177-237 aa
PF07716bZIP_2178-229 aa
PF03131bZIP_Maf180-233 aa
PF12210Hrs_helical180-246 aa
PF12867DinB_2182-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G457740PF03131bZIP_Maf34480.001819.5
TkA04G457740PF10915DUF27091242200.1512.1
TkA04G457740PF09660DUF23971762530.02814.0
TkA04G457740PF00170bZIP_11772372.8e-1453.7
TkA04G457740PF07716bZIP_21782294.4e-1143.4
TkA04G457740PF03131bZIP_Maf1802330.001819.5
TkA04G457740PF12210Hrs_helical1802460.05114.8
TkA04G457740PF12867DinB_21822510.1813.0
TkA04G457740PF24904RVE62142390.2712.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P42777拟南芥sp|P42777|GBF4_ARATH G-box-binding factor 445.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SJN0拟南芥sp|Q9SJN0|ABI5_ARATH Protein ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 532.600%Swiss-Prot中等置信
Q9C5Q2拟南芥sp|Q9C5Q2|AI5L3_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 336.300%Swiss-Prot中等置信
Q9LES3拟南芥sp|Q9LES3|AI5L2_ARATH ABSCISIC ACID-INSENSITIVE 5-like protein 233.300%Swiss-Prot中等置信
Q0JHF1水稻sp|Q0JHF1|BZP12_ORYSJ bZIP transcription factor 1235.700%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看