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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G436120
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 109975007-109981772 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2823 bp · TkA04G436120|TK1151|cDNA

GCAAAACGTCCTTCATGAACCCTAAATTTTAAACATTCTTGACATTATTCTAGTCGGGAAGGGGTTCGCTATGACGTTTCGATCTGTGTTCGATGCTCCCTTCATTAGAACTGAATTCGATCAAGCTGGAATCAGTACTCAGTTCATCCCTACAATTTGGAAATACGTCGTACAGAATCCTAATTGCGAATGGCGAGATATCCCTTCACTGCCTTCCGCAGCTTACTCGTTACTTTCTTCCAAGTTCAAATCCTGCACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2346 bp · TkA04G436120|TK1151|CDS

ATGACGTTTCGATCTGTGTTCGATGCTCCCTTCATTAGAACTGAATTCGATCAAGCTGGAATCAGTACTCAGTTCATCCCTACAATTTGGAAATACGTCGTACAGAATCCTAATTGCGAATGGCGAGATATCCCTTCACTGCCTTCCGCAGCTTACTCGTTACTTTCTTCCAAGTTCAAATCCTGCACTTCTATCGTCGACTCCGTTTTCAACTCCACGGATCAAGTTACCACCAAACTCCTCATTAAGTTGCAGAATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

781 aa · TkA04G436120|TK1151|PROTEIN

MTFRSVFDAPFIRTEFDQAGISTQFIPTIWKYVVQNPNCEWRDIPSLPSAAYSLLSSKFKSCTSIVDSVFNSTDQVTTKLLIKLQNGESIEAVIMRYDSSLGKLNGKPRPGGPRSTLCISSQVGCKMGCKFCATGTMGFKSNLSTGEIVEQLVHASRISPIRNVVFMGMGEPLNNYNALVEAIRVMTAFPFQLSPKKITVSTVGIIPAIKKFHGDLPNLNLAVSLHAPVQDIRCKIMPAARAFPLERLMNALAEYQKKSQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G436120
TK1151 IDTkA04G436120
OH-1004 IDLXL04_038498
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G436120
位置Chr04:109975007-109981772 (+)
描述Similar to rlmN1: Dual-specificity RNA methyltransferase RlmN 1 (Myxococcus xanthus (strain DK 1622)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07570 可能的双功能激酶。
Novel protein kinase of Arabidopsis thaliana (APK1) that phosphorylates tyrosine, serine and threonine.1992 · DOI: 10.1007/bf00046450

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0110900 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中的 CERK1 下游发挥作用。
OsCERK1 and OsRLCK176 play important roles in peptidoglycan and chitin signaling in rice innate immunity.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12710
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038498 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0030488 tRNA methylation 生物过程
GO:0070475 rRNA base methylation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0000049 tRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
mxa:MXAN_1275
nmr:Nmar_1385
sfu:Sfum_4057
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.245
排名 1 · TkA04G436120 · TK1151
细胞核0.187
排名 2 · TkA04G436120 · TK1151
细胞膜0.185
排名 3 · TkA04G436120 · TK1151
质体0.161
排名 4 · TkA04G436120 · TK1151
内质网0.132
排名 5 · TkA04G436120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04055Radical_SAM120-278 aa
PF19238Radical_SAM_2121-133 aa
PF13353Fer4_12123-188 aa
PF19238Radical_SAM_2221-293 aa
PF10961SelK_SelG267-297 aa
PF10961SelK_SelG409-452 aa
PF25184YxzE414-451 aa
PF00069Pkinase476-745 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G436120PF04055Radical_SAM1202782.5e-1351.2
TkA04G436120PF19238Radical_SAM_21211330.2611.7
TkA04G436120PF13353Fer4_121231880.006217.6
TkA04G436120PF19238Radical_SAM_22212930.2611.7
TkA04G436120PF10961SelK_SelG2672970.003718.6
TkA04G436120PF10961SelK_SelG4094520.003718.6
TkA04G436120PF25184YxzE4144510.4612.2
TkA04G436120PF00069Pkinase4767455e-32112.0
TkA04G436120PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4797482.7e-40139.0
TkA04G436120PF01636APH5045960.1412.6
TkA04G436120PF01636APH5896120.1412.6
TkA04G436120PF04055Radical_SAM6036332.5e-1351.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q06548拟南芥sp|Q06548|PBL9_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL936.700%Swiss-Prot低置信
Q65XV8水稻sp|Q65XV8|RK176_ORYSJ Receptor-like cytoplasmic kinase 17635.300%Swiss-Prot低置信

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