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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G428870
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 108242972-108247111 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2415 bp · TkA04G428870|TK1151|cDNA

CAAAGATCATATTATCATCATGACTACAACTCCTCTCCTTCACCACCTCTTCTTCTTCCTCGCCATTCCTCTGTTACTTTCTTCCGTTTCTTCTCTCAACTCCGATGGCACCATTCTCCTATCTTTCAAAAACTCACTTCTCTCTCACCCATCTTCACTCCTTCAAAACTGGAACCATTCTGATCCCACCCCATGTTCATGGTCCGGCGTCACGTGTGCACCTCAATACGGTCATGTCACCAGTTTGCTACTCCCAAGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2172 bp · TkA04G428870|TK1151|CDS

ATGACTACAACTCCTCTCCTTCACCACCTCTTCTTCTTCCTCGCCATTCCTCTGTTACTTTCTTCCGTTTCTTCTCTCAACTCCGATGGCACCATTCTCCTATCTTTCAAAAACTCACTTCTCTCTCACCCATCTTCACTCCTTCAAAACTGGAACCATTCTGATCCCACCCCATGTTCATGGTCCGGCGTCACGTGTGCACCTCAATACGGTCATGTCACCAGTTTGCTACTCCCAAGCTCTCACCTTCTGGGTTCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

723 aa · TkA04G428870|TK1151|PROTEIN

MTTTPLLHHLFFFLAIPLLLSSVSSLNSDGTILLSFKNSLLSHPSSLLQNWNHSDPTPCSWSGVTCAPQYGHVTSLLLPSSHLLGSIPDDFGRLQHLRALDLSDNSINGTLPISLFNCSELQTLSLSSNFISGELPELISGLRSLRVLNLSHNGFVGKLPESFSFLKNLNEVTLNNNYFSGGVPGGFDSIEVLDLSSNLFNGTLPFDFGGGKLKYLNLSNNKLSGPVYQRFVENIPANAVVDLSFNSLTGQIPQMMSLSN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G428870
TK1151 IDTkA04G428870
OH-1004 IDLXL04_038439
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 71.784 / OH-1004 90.418
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G428870
位置Chr04:108242972-108247111 (-)
描述Similar to At4g34220: Receptor protein kinase-like protein At4g34220
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34220 受体蛋白激酶样蛋白At4g34220。 暂无已核实直接文献
At4g37250 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g37250。 暂无已核实直接文献
At2g01210 受体蛋白激酶，在早期合子发育过程中充当细胞内钙和异三聚体 G 蛋白信号与细胞外信号的整合器。 暂无已核实直接文献
At1g66830 可能是失活的富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶 At1g66830。 暂无已核实直接文献
At5g05160 可能的富含亮氨酸重复的受体类蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038439 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010069 zygote asymmetric cytokinesis in embryo sac 生物过程
GO:0010070 zygote asymmetric cell division 生物过程
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0062207 regulation of pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48480
ath:AT1G66830
ath:AT2G01210
ath:AT4G34220
ath:AT4G37250
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.868
排名 1 · TkA04G428870 · TK1151
内质网0.093
排名 2 · TkA04G428870 · TK1151
细胞质0.064
排名 3 · TkA04G428870 · TK1151
细胞核0.051
排名 4 · TkA04G428870 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA04G428870 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04478Mid224-42 aa
PF08263LRRNT_226-66 aa
PF23211LRR_LRWD171-131 aa
PF13855LRR_872-129 aa
PF00560LRR_173-94 aa
PF29594LRR_SKP278-152 aa
PF12799LRR_485-107 aa
PF23598LRR_1485-127 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G428870PF04478Mid224420.04814.2
TkA04G428870PF08263LRRNT_226664.8e-1349.8
TkA04G428870PF23211LRR_LRWD1711310.0007919.9
TkA04G428870PF13855LRR_8721296.1e-1555.4
TkA04G428870PF00560LRR_173941.8e-1863.3
TkA04G428870PF29594LRR_SKP2781520.0314.3
TkA04G428870PF12799LRR_4851074.6e-0936.9
TkA04G428870PF23598LRR_14851273.6e-0833.3
TkA04G428870PF23598LRR_14941743.6e-0833.3
TkA04G428870PF13516LRR_6951099.3e-0626.0
TkA04G428870PF00560LRR_1961181.8e-1863.3
TkA04G428870PF12799LRR_4961384.6e-0936.9
TkA04G428870PF24758LRR_At5g56370961520.1512.4
TkA04G428870PF24141LRR_ComC981140.02415.0
TkA04G428870PF24048LRR_NXF1-51051550.06113.7
TkA04G428870PF24141LRR_ComC1101630.02415.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94C77拟南芥sp|Q94C77|RPKL_ARATH Receptor protein kinase-like protein At4g3422047.300%Swiss-Prot中等置信
C0LGS3拟南芥sp|C0LGS3|Y4372_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3725053.100%Swiss-Prot高置信
Q9ZU46拟南芥sp|Q9ZU46|ZAR1_ARATH Receptor protein kinase-like protein ZAR138.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C9N5拟南芥sp|Q9C9N5|Y1668_ARATH Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g6683035.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FHK7拟南芥sp|Q9FHK7|Y5516_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g0516033.300%Swiss-Prot低置信

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