TkA04G426010 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G426010

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 107503160-107506853 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2287 bp · TkA04G426010|TK1151|cDNA

ATTTGGTCCTATATTTTTGGTCGTTGCCTTTTCGAAAGAACCCTGTCGCAATTGGTAAAAACCCCAAATCATACATTCTCTCTCCCGATACTCTCATTTTCAGTGAATCAGGCCCTCTTGCTCCACCGAGATCGCCGACTAGTGACCGCCGTATTGTGCAGCCGTGTAGACTCAGGCGAGGCATTGAAACGTCTAGTGATGGTACTGCTGTTACTATCCTGATTGTACGTTTGGTAATGAGAAATTAGCTTCATGGTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1812 bp · TkA04G426010|TK1151|CDS

ATGGACAAACACATCCAAGACTGCCCATACCCCGGATGCTTCTTCTGTGTCATGAAAGAAGGAAACCCAAACAAACGAAGATCCAGCATCATGAAATTCTTCAGAGAACTCCCTTCACAAGACGATGATGGTCAAGTCCTCCCCATATCTGGTCTCTGGAACACCGCCATGGCGCACCCAAACGACCCCGAATTCATCGAACTAGGCATCTTCGAATGCATGTCAGCACTCATCTGGAAAGGCCTCAAAAACCGCAGATG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

603 aa · TkA04G426010|TK1151|PROTEIN

MDKHIQDCPYPGCFFCVMKEGNPNKRRSSIMKFFRELPSQDDDGQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMSALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEDFAETAVNAGVIPPLVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYATTFPSVANHGEILELCIQLAMSSLEIVYSHFYQYSDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKPEFLSVICKPEFIVKLPGMWGGLVN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G426010`
TK1151 ID	TkA04G426010
OH-1004 ID	LXL04_038413
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.367 / OH-1004 86.350 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA04G426010`
位置	Chr04:107503160-107506853 (+)
描述	Similar to Tomm34: Mitochondrial import receptor subunit TOM34
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_038413` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程 GO:0070098 chemokine-mediated signaling pathway 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分 GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0030674 protein-macromolecule adaptor activity 分子功能 GO:0031072 heat shock protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	hsa:10953 hsa:7265 mmu:67145 rno:311621 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.478

排名 1 · TkA04G426010 · TK1151

细胞核0.433

排名 2 · TkA04G426010 · TK1151

细胞膜0.105

排名 3 · TkA04G426010 · TK1151

内质网0.052

排名 4 · TkA04G426010 · TK1151

溶酶体／液泡0.051

排名 5 · TkA04G426010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26524ARM_77-244 aa

PF24768ARM_ARMC5112-188 aa

PF00514Arm116-132 aa

PF00514Arm140-151 aa

PF26535DSRM_CARF152-203 aa

PF24768ARM_ARMC5268-326 aa

PF26524ARM_7288-325 aa

PF00514Arm288-301 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA04G426010	`PF26524`	ARM_7	7	244	4.8e-117	390.3
TkA04G426010	`PF24768`	ARM_ARMC5	112	188	0.0076	16.4
TkA04G426010	`PF00514`	Arm	116	132	0.00078	20.1
TkA04G426010	`PF00514`	Arm	140	151	0.00078	20.1
TkA04G426010	`PF26535`	DSRM_CARF	152	203	0.23	12.2
TkA04G426010	`PF24768`	ARM_ARMC5	268	326	0.0076	16.4
TkA04G426010	`PF26524`	ARM_7	288	325	4.8e-117	390.3
TkA04G426010	`PF00514`	Arm	288	301	0.00078	20.1
TkA04G426010	`PF00514`	Arm	307	327	0.00078	20.1
TkA04G426010	`PF25575`	TPR_BSK1_C	411	480	0.0065	17.1
TkA04G426010	`PF07719`	TPR_2	416	442	2.3e-06	28.0
TkA04G426010	`PF00515`	TPR_1	418	442	0.0011	19.4
TkA04G426010	`PF13424`	TPR_12	418	439	0.035	15.0
TkA04G426010	`PF13414`	TPR_11	418	442	0.049	14.0
TkA04G426010	`PF13424`	TPR_12	451	506	0.035	15.0
TkA04G426010	`PF07719`	TPR_2	452	479	2.3e-06	28.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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