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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G425280
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 107298409-107305292 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2062 bp · TkA04G425280|TK1151|cDNA

CGATAACGAGATATGAATTACAGACAAGCAAGCAGAAAGCAAAGCTTAGCTAACACAACACGACGCCTACTTATCTTCCATTAATGCTCACTTATATATTACCTTTGTACACCAGGCATTCAGTAAAGCGAAAATGTTAGGGTTCTTAGTGAGAAGTGCAAAATCAACCTCACTATCATCTCCATATCGATGGCGTTCATCAATCAGCTTCGGTATGATCACGCCATCAAGCAATCGCGATTTCAGCATCCAATCACCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1992 bp · TkA04G425280|TK1151|CDS

ATGATCACGCCATCAAGCAATCGCGATTTCAGCATCCAATCACCAGGACACAATGTCCTCCCCGATGGTATCGACCGGACCTCTGATTCATTTATTCGAAACTCTAAGGAAATGGAATCTGTCATTTCTCAACTTCATTCTCGTATCTATCAGGTGACCCAAGGTGGAGGAGCAGAAGCTATAAAGAGGCATAGAAGTAGAAACAAACTGCTTCCAAGGGAGAGAATCGATCGCTTACTGGATTCTTCTTCTTCCTTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

663 aa · TkA04G425280|TK1151|PROTEIN

MITPSSNRDFSIQSPGHNVLPDGIDRTSDSFIRNSKEMESVISQLHSRIYQVTQGGGAEAIKRHRSRNKLLPRERIDRLLDSSSSFLELSQLAGHELYEESLPSGGIITGIGPVHGKLCMFIANDATVKGGTYYPITVKKHLRAQEIASKCRLPCIYLVDSGGAFLPKQAEVFPDKENFGRVFYNQAIMSSEGIPQIALVLGSCTAGGAYIPAMADESVMVKGNGTIFLAGPPLVKAAIGEEVSSEDLGGADVHCKISGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G425280
TK1151 IDTkA04G425280
OH-1004 IDLXL04_038401
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 83.560 / OH-1004 94.863
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G425280
位置Chr04:107298409-107305292 (+)
描述Similar to MCCB: Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34030 3-甲基丁烯酰辅酶A羧化酶的羧基转移酶亚基，一种催化3-甲基丁烯酰辅酶A转化为3-甲基戊烯酰辅酶A的酶，这是亮氨酸和异戊酸分解代谢的关键步骤。 暂无已核实直接文献
At2g15570 维持分生组织共质体通透性所必需的硫醇-二硫化物氧化还原酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0430800 可能的硫醇-二硫键氧化还原酶，可能参与叶绿体酶的氧化还原调控。 暂无已核实直接文献
Os12g0188700 硫醇二硫化物氧化还原酶可能参与叶绿体酶的氧化还原调节。
Abnormal chloroplast development and growth inhibition in rice thioredoxin m knock-down plants.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123547
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038401 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程
GO:0007563 regulation of eclosion 生物过程
GO:0015936 coenzyme A metabolic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:1905202 methylcrotonoyl-CoA carboxylase complex 细胞组分
GO:0004485 methylcrotonoyl-CoA carboxylase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0050897 cobalt ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G34030
cel:CELE_F02A9.10
dme:Dmel_CG3267
mmu:78038
rno:361884
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.649
排名 1 · TkA04G425280 · TK1151
细胞核0.206
排名 2 · TkA04G425280 · TK1151
线粒体0.152
排名 3 · TkA04G425280 · TK1151
过氧化物酶体0.110
排名 4 · TkA04G425280 · TK1151
细胞膜0.053
排名 5 · TkA04G425280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03255ACCA35-222 aa
PF01039Carboxyl_trans64-545 aa
PF06833MdcE147-209 aa
PF03255ACCA377-441 aa
PF06833MdcE386-477 aa
PF00085Thioredoxin452-472 aa
PF26422Halo_JAB_MPN531-582 aa
PF00085Thioredoxin557-655 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G425280PF03255ACCA352222.8e-1557.0
TkA04G425280PF01039Carboxyl_trans645451.7e-161538.9
TkA04G425280PF06833MdcE1472092.7e-0524.7
TkA04G425280PF03255ACCA3774412.8e-1557.0
TkA04G425280PF06833MdcE3864772.7e-0524.7
TkA04G425280PF00085Thioredoxin4524721.2e-2383.7
TkA04G425280PF26422Halo_JAB_MPN5315820.3311.7
TkA04G425280PF00085Thioredoxin5576551.2e-2383.7
TkA04G425280PF08534Redoxin5616170.005117.3
TkA04G425280PF13899Thioredoxin_75705930.00218.9
TkA04G425280PF13098Thioredoxin_25726570.0001722.6
TkA04G425280PF14595Thioredoxin_95796500.02615.1
TkA04G425280PF07449HyaE5936430.1113.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDD8拟南芥sp|Q9LDD8|MCCB_ARATH Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial78.100%Swiss-Prot高置信
Q9SEU7拟南芥sp|Q9SEU7|TRXM3_ARATH Thioredoxin M3, chloroplastic62.500%Swiss-Prot高置信
Q7XQQ2水稻sp|Q7XQQ2|TRXM3_ORYSJ Thioredoxin M3, chloroplastic55.100%Swiss-Prot中等置信
Q9ZP20水稻sp|Q9ZP20|TRXM5_ORYSJ Thioredoxin M5, chloroplastic51.000%Swiss-Prot中等置信

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