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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G314220
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 79150088-79152319 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1359 bp · TkA04G314220|TK1151|cDNA

CCCTCACGTGCCCCCCGAGATATTTCAGTAGCTTTCTATCGCTATATAACAACACACTTCACTCACCTTCTTCATACAAACCAACCTTCAATCTCCTTAATCTCTTCAACAATGGCGTCAATGGCTACAACCTTTGCTTCTTCTCTCTCCACCAAGGTTAGAACCTCTTTCCTAGATCAATCATCCTTCCATGGCGTTCCGGTGGCTTCTCCGACCAGAATCCAACCAGTCAAATGCAAAAACACGCCGATCACCATGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1170 bp · TkA04G314220|TK1151|CDS

CCCTCACGTGCCCCCCGAGATATTTCAGTAGCTTTCTATCGCTATATAACAACACACTTCACTCACCTTCTTCATACAAACCAACCTTCAATCTCCTTAATCTCTTCAACAATGGCGTCAATGGCTACAACCTTTGCTTCTTCTCTCTCCACCAAGGTTAGAACCTCTTTCCTAGATCAATCATCCTTCCATGGCGTTCCGGTGGCTTCTCCGACCAGAATCCAACCAGTCAAATGCAAAAACACGCCGATCACCATGTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

389 aa · TkA04G314220|TK1151|PROTEIN

PSRAPRDISVAFYRYITTHFTHLLHTNQPSISLISSTMASMATTFASSLSTKVRTSFLDQSSFHGVPVASPTRIQPVKCKNTPITMSATPYDLGSFTFSPIKESIVSREMTRRYMTDMITYADTDVVVVGAGSAGLSCAYELSKNPNVQVAIIEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMVVRKPAHLFLDELEIEYDEQEDYVVIKHAALFTSTIMSKLLARPNVKLFNAVAAEDLIIKGDRVSGVVTNWALVTMNHDTQSCMDPN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G314220
TK1151 IDTkA04G314220
OH-1004 IDLXL04_030955
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)82.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.172 / OH-1004 88.453
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G314220
位置Chr04:79150088-79152319 (-)
描述Similar to THI1-1: Thiamine thiazole synthase 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g54770 参与硫胺素前体噻唑的生物合成。
Point mutation is responsible for Arabidopsis tz-201 mutant phenotype affecting thiamin biosynthesis.2003 · DOI: 10.1093/pcp/pcg104
THI1, a protein involved in the biosynthesis of thiamin in Arabidopsis thaliana: structural analysis of THI1(A140V) mutant.2014 · DOI: 10.1016/j.bbapap.2014.03.005
THI1, a Thiamine Thiazole Synthase, Interacts with Ca2+-Dependent Protein Kinase CPK33 and Modulates the S-Type Anion Channels and Stomatal Closure in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01649
Thi1, a thiamine biosynthetic gene in Arabidopsis thaliana, complements bacterial defects in DNA repair.1996 · DOI: 10.1007/bf00042231

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030955 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0009228 thiamine biosynthetic process 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0052837 thiazole biosynthetic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009579 thylakoid 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G54770
cit:102626594
vvi:100260728
vvi:100265774
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.955
排名 1 · TkA04G314220 · TK1151
线粒体0.069
排名 2 · TkA04G314220 · TK1151
细胞质0.027
排名 3 · TkA04G314220 · TK1151
细胞核0.022
排名 4 · TkA04G314220 · TK1151
细胞膜0.013
排名 5 · TkA04G314220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03486HI0933_like10-77 aa
PF27806HxsD10-60 aa
PF13454NAD_binding_9104-120 aa
PF01946Thi4107-340 aa
PF01494FAD_binding_3123-155 aa
PF00890FAD_binding_2125-161 aa
PF01266DAO125-170 aa
PF07992Pyr_redox_2125-200 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G314220PF03486HI0933_like10770.0003720.8
TkA04G314220PF27806HxsD10600.1612.7
TkA04G314220PF13454NAD_binding_91041200.0009719.9
TkA04G314220PF01946Thi41073401.5e-113378.6
TkA04G314220PF01494FAD_binding_31231550.009815.9
TkA04G314220PF00890FAD_binding_21251612.5e-0937.6
TkA04G314220PF01266DAO1251707.4e-0936.3
TkA04G314220PF07992Pyr_redox_21252003.2e-0627.5
TkA04G314220PF12831FAD_oxidored1252428.1e-0522.8
TkA04G314220PF01134GIDA1251560.0002121.2
TkA04G314220PF05834Lycopene_cycl1251590.0002321.1
TkA04G314220PF03486HI0933_like1251600.0003720.8
TkA04G314220PF21799MurD-like_N1251640.07614.0
TkA04G314220PF00070Pyr_redox1261560.5211.6
TkA04G314220PF13454NAD_binding_91271680.0009719.9
TkA04G314220PF13738Pyr_redox_31271560.002617.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38814拟南芥sp|Q38814|THI4_ARATH Thiamine thiazole synthase, chloroplastic77.600%Swiss-Prot高置信

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