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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G267320
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 67562591-67567609 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2369 bp · TkA04G267320|TK1151|cDNA

CTCAATGAGACTATATAGGATTGATCTTGTTATGTTTTTAGTTGAAAAAAATATATATTTCAGATGTACAGACCTCACTAAACACCAATCAGTTTCACAATTATCTAATTCGGGTCTGCCATGGATTCCGGGAGCCAAGATGAAATCGAGGATTTGTCAACTTTATCTCCTCCTCCATTGGGTCCCTTACAGATAACAGGCAACAACAATGGGTTTGTTCATGACTTCGATCTCATGGCTGCTCAAACTTACCTCAGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2073 bp · TkA04G267320|TK1151|CDS

ATGGATTCCGGGAGCCAAGATGAAATCGAGGATTTGTCAACTTTATCTCCTCCTCCATTGGGTCCCTTACAGATAACAGGCAACAACAATGGGTTTGTTCATGACTTCGATCTCATGGCTGCTCAAACTTACCTCAGAAACAGATCAAGCTCACAGATCGATATCCAAGACGACACATTCCCGACTAAAGATCGCCCACTTCCCATTTTTCTTAAGTTTGAAGATATAGAGTTTAAGGTGAAAGTGAGCAAAGCAACACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

690 aa · TkA04G267320|TK1151|PROTEIN

MDSGSQDEIEDLSTLSPPPLGPLQITGNNNGFVHDFDLMAAQTYLRNRSSSQIDIQDDTFPTKDRPLPIFLKFEDIEFKVKVSKATPGNPVKAVMSRIVLKPKTEEDNYKQILKGITGSLGPGEILALMGPSGSGKTTLLKVIGGRLGENVKGTVTYNDVPYSPALKRRIGFVTQDDVLYPQLTVEETLIFAASLRLSGTMSQKQKYERVEVILKELGLERCRKTRVGGGFISGISGGERKRTSIGYEILVDPSLLLLDE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G267320
TK1151 IDTkA04G267320
OH-1004 IDLXL04_037276
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G267320
位置Chr04:67562591-67567609 (-)
描述Similar to ABCG26: ABC transporter G family member 26
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g13220 介导孢子花粉素前体穿过绒毡层质膜进入花药室，在发育中的小孢子壁上聚合，因此是雄性生育能力和花粉外壁形成以及绒毡层程序性细胞死亡之前的图案化所必需的。
ATP-binding cassette transporter G26 is required for male fertility and pollen exine formation in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.161968
WBC27, an adenosine tri-phosphate-binding cassette protein, controls pollen wall formation and patterning in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2010.01010.x
An ABCG/WBC-type ABC transporter is essential for transport of sporopollenin precursors for exine formation in developing pollen.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04412.x
Arabidopsis mutant of AtABCG26, an ABC transporter gene, is defective in pollen maturation.2011 · DOI: 10.1016/j.jplph.2011.05.014
ABCG26-mediated polyketide trafficking and hydroxycinnamoyl spermidines contribute to pollen wall exine formation in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.130484
At5g06530 ABC 转运蛋白 G 家族成员 22。 暂无已核实直接文献
At3g52310 ABC转运蛋白G家族成员27。 暂无已核实直接文献
At1g31770 植物生长的正调节剂，充当外排泵，参与主要的根到芽长距离细胞分裂素通过木质部汁液的运输。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins.2014 · DOI: 10.1038/ncomms4274
Arabidopsis ABCG14 is essential for the root-to-shoot translocation of cytokinin.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1321519111
Cytokinin Response Factor 6 Represses Cytokinin-Associated Genes during Oxidative Stress.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00415
A Role of Cytokinin Transporter in Arabidopsis Immunity.2017 · DOI: 10.1094/mpmi-01-17-0011-r
At3g25620 ABC 转运蛋白 G 家族成员 21。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037276 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0010222 stem vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0030638 polyketide metabolic process 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31770
ath:AT3G13220
ath:AT3G25620
ath:AT5G06530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.766
排名 1 · TkA04G267320 · TK1151
细胞质0.135
排名 2 · TkA04G267320 · TK1151
内质网0.087
排名 3 · TkA04G267320 · TK1151
溶酶体／液泡0.072
排名 4 · TkA04G267320 · TK1151
高尔基体0.055
排名 5 · TkA04G267320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02367TsaE106-149 aa
PF00931NB-ARC110-143 aa
PF03193RsgA_GTPase111-151 aa
PF00005ABC_tran113-263 aa
PF13481AAA_25116-140 aa
PF25199nSTAND_NTPase5121-159 aa
PF01637ATPase_2121-156 aa
PF03215Rad17122-153 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G267320PF02367TsaE1061490.007616.9
TkA04G267320PF00931NB-ARC1101430.07613.3
TkA04G267320PF03193RsgA_GTPase1111510.03614.6
TkA04G267320PF00005ABC_tran1132631.8e-29103.8
TkA04G267320PF13481AAA_251161400.1612.3
TkA04G267320PF25199nSTAND_NTPase51211590.02415.2
TkA04G267320PF01637ATPase_21211560.05414.0
TkA04G267320PF03215Rad171221530.03214.9
TkA04G267320PF13191AAA_161231680.002519.1
TkA04G267320PF02463SMC_N1241494.7e-0523.7
TkA04G267320PF13401AAA_221241550.01316.6
TkA04G267320PF00437T2SSE1241590.1311.6
TkA04G267320PF13304AAA_211251433.2e-0834.6
TkA04G267320PF13555AAA_291251400.1412.7
TkA04G267320PF02492cobW1261590.3511.2
TkA04G267320PF05729NACHT1261430.4611.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK50拟南芥sp|Q9LK50|AB26G_ARATH ABC transporter G family member 2670.800%Swiss-Prot高置信
Q93YS4拟南芥sp|Q93YS4|AB22G_ARATH ABC transporter G family member 2245.600%Swiss-Prot中等置信
Q9FT51拟南芥sp|Q9FT51|AB27G_ARATH ABC transporter G family member 2744.700%Swiss-Prot中等置信
Q9C6W5拟南芥sp|Q9C6W5|AB14G_ARATH ABC transporter G family member 1444.200%Swiss-Prot中等置信
Q7XA72拟南芥sp|Q7XA72|AB21G_ARATH ABC transporter G family member 2144.400%Swiss-Prot中等置信

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