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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G165040
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 42638652-42641379 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1993 bp · TkA04G165040|TK1151|cDNA

GTAACTCCCAGCCACGTGTCCCAGGACCTGTTCAGTATCCAGTATAATTTCCCTTTCTCTTATTATATAATTCCCCTTTCTCTTTCCATATATACGGATCCCACAGAAGAAATTGTTCGCAGTCTTTCGATCCGATCTCAACGCCGTTCTGCAATTTTAAGCATCTGAATTTTTGCTTCGTAGAGAAGTTAATATAAAGTAATAGTCCACCACCTGGGAATGCGGAATGATGTGTTCAAACGTTGGTAATTCCTTACATA...

CDS

下载 CDS FASTA

1320 bp · TkA04G165040|TK1151|CDS

ATGGAGAATATGGGAAATATATTGATGCAAAAATATGAATTCGGGAAGATGCTTGGGCAAGGTAACTTTGCCAAAGTTTACCATGGTAGGGATTTAAAATCGGGCCAAAGTATAGCCATTAAAGTGATCGACAAAGAAAAGGTTTTAAAAGTTGGATTAATCGACCAAACAAAGCGAGAAATATCGGTGATGAAAACGGTCAAACACCCAAATATAATCCAACTTTACGAAGTCATGGCCACAAAATCCAAAATCTATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

439 aa · TkA04G165040|TK1151|PROTEIN

MENMGNILMQKYEFGKMLGQGNFAKVYHGRDLKSGQSIAIKVIDKEKVLKVGLIDQTKREISVMKTVKHPNIIQLYEVMATKSKIYFAMEYAKGGELFEKVSKGRLKEDVARKYFQQLILAVDHCHSRGVYHRDLKPENLLLDENGDLKVTDFGLSAHDTCTRLDGLFHTTCGTPAYVAPEVISRRGYDGGKSDIWSCGVILFVLLTGNLPFNDSNIIQMYRKITKADYKCPNWVTPETRRLLKKILDPNPLTRISIKKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G165040
TK1151 IDTkA04G165040
OH-1004 IDLXL04_035122
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.544 / OH-1004 71.522
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G165040
位置Chr04:42638652-42641379 (-)
描述Similar to CIPK2: CBL-interacting protein kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45820 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
Constitutive activation and transgenic evaluation of the function of an arabidopsis PKS protein kinase.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m205504200

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0332300 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0678600 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os03g0339900 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os01g0206700 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035122 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G45820
dosa:Os01g0206700
dosa:Os03g0339900
dosa:Os05g0332300
dosa:Os07g0678600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.569
排名 1 · TkA04G165040 · TK1151
细胞核0.369
排名 2 · TkA04G165040 · TK1151
细胞膜0.200
排名 3 · TkA04G165040 · TK1151
内质网0.054
排名 4 · TkA04G165040 · TK1151
高尔基体0.047
排名 5 · TkA04G165040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase12-266 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr13-262 aa
PF14531Kinase-like13-45 aa
PF03109ABC119-44 aa
PF07387Seadorna_VP733-69 aa
PF06293Kdo46-77 aa
PF03109ABC161-157 aa
PF14531Kinase-like97-215 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G165040PF00069Pkinase122669.7e-76255.3
TkA04G165040PF07714PK_Tyr_Ser-Thr132624.9e-38131.6
TkA04G165040PF14531Kinase-like13454.7e-0730.1
TkA04G165040PF03109ABC119442.1e-0627.8
TkA04G165040PF07387Seadorna_VP733690.1811.5
TkA04G165040PF06293Kdo46770.00517.0
TkA04G165040PF03109ABC1611572.1e-0627.8
TkA04G165040PF14531Kinase-like972154.7e-0730.1
TkA04G165040PF06293Kdo1061470.00517.0
TkA04G165040PF01636APH1191550.1312.8
TkA04G165040PF07387Seadorna_VP71221530.1811.5
TkA04G165040PF03822NAF3133681.3e-1970.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FJ54拟南芥sp|Q9FJ54|CIPKK_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 2058.000%Swiss-Prot高置信
Q5W736水稻sp|Q5W736|CIPKI_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1861.500%Swiss-Prot高置信
Q7X996水稻sp|Q7X996|CIPK2_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 262.100%Swiss-Prot高置信
Q10LQ2水稻sp|Q10LQ2|CIPKA_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1057.200%Swiss-Prot高置信
Q9LWM4水稻sp|Q9LWM4|CIPK5_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 558.600%Swiss-Prot高置信

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