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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G143180
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 37018196-37020364 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1599 bp · TkA04G143180|TK1151|cDNA

AACGACCCCACAAGTGTACAATCTGAGACTTTATTCTTAGAGTTCAGCTGTCACGTGTCAGCTCCCATCGTCGTTTATCGCCATCTAAATTGACCTCGATTCTACGTGGCAACATCATAGAAGCAACTAGTCGGCTTTCAGGGGCACCGTGAGCAGCCGCCCCTTCCGTTGCCTCCTTTATATTCTTCAACGAAAGGAAATTGTTTTCACTTTTGCCAACTTCTTTAGAGACGATGGTTAGTGTTAGATTTCTCGAGATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1182 bp · TkA04G143180|TK1151|CDS

ATGAAGCGTGTGTATGGCAGTCGCAAGAGTATGCTACCGATTGACGAGGATGTTGATTCGCCCGTTAAATGCAGGGAGCGACGTCGTCGTCGGATTGAGATGAGGCGGAGGTTGTCGTCAGTTTCCGCTGTTGCCGGAACTGATAACTTCGGTGGTCCGAAGCCAGCAGCCGCGGCGGAGTTGGAGAATGAGAACGCTGAGCCGTCGATTAGGAATGAGGAAACGCCGGAGTCACTGCTGTACGGGTCGATGTCGGTGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

393 aa · TkA04G143180|TK1151|PROTEIN

MKRVYGSRKSMLPIDEDVDSPVKCRERRRRRIEMRRRLSSVSAVAGTDNFGGPKPAAAAELENENAEPSIRNEETPESLLYGSMSVVGRAREMEDEISVQMNLCRPEINGYRPVHFFGVFDGHGGHHVSALCKENMHVIMEDELMRVKPTGDKLNRGEVEELWRTAIDRSFERMDEMALSLCQCNGLENLKMCRYHPQLSLVGSTAVVSLLTDEFIIVANCGDSRAVLCHNGKTVPLSVDHKPDREDERNRIEASGGRVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G143180
TK1151 IDTkA04G143180
OH-1004 IDLXL04_035317
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G143180
位置Chr04:37018196-37020364 (-)
描述Similar to AHG1: Probable protein phosphatase 2C 75
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g51760 种子萌发过程中脱落酸 (ABA) 反应的负调控因子。
ABA-Hypersensitive Germination1 encodes a protein phosphatase 2C, an essential component of abscisic acid signaling in Arabidopsis seed.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03107.x
At2g29380 可能的蛋白质磷酸酶 2C 24。 暂无已核实直接文献
At1g07430 通过去磷酸化作用参与K(+)钾通道AKT1的负调控，与CIPK蛋白（如CIPK23）相反。 暂无已核实直接文献
At5g59220 作为叶片中脱落酸(ABA)信号导致气孔关闭的负调控因子，并控制叶片衰老期间的水分流失。
An ABA-regulated and Golgi-localized protein phosphatase controls water loss during leaf senescence in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04821.x
An abscisic acid-AtNAP transcription factor-SAG113 protein phosphatase 2C regulatory chain for controlling dehydration in senescing Arabidopsis leaves.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.190876
Selective inhibition of clade A phosphatases type 2C by PYR/PYL/RCAR abscisic acid receptors.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188623
Unique drought resistance functions of the highly ABA-induced clade A protein phosphatase 2Cs.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.202408
At3g11410 种子萌发和冷驯化过程中脱落酸 反应的主要负调节因子。
Antisense inhibition of protein phosphatase 2C accelerates cold acclimation in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01048.x
Physical and functional interaction of the Arabidopsis K(+) channel AKT2 and phosphatase AtPP2CA.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000943
ABA-hypersensitive germination3 encodes a protein phosphatase 2C (AtPP2CA) that strongly regulates abscisic acid signaling during germination among Arabidopsis protein phosphatase 2Cs.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070128
The protein phosphatase AtPP2CA negatively regulates abscisic acid signal transduction in Arabidopsis, and effects of abh1 on AtPP2CA mRNA.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070318
ABA-Hypersensitive Germination1 encodes a protein phosphatase 2C, an essential component of abscisic acid signaling in Arabidopsis seed.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03107.x
ABI1 and PP2CA phosphatases are negative regulators of Snf1-related protein kinase1 signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.114066

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035317 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0048838 release of seed from dormancy 生物过程
GO:1902039 negative regulation of seed dormancy process 生物过程
GO:1902531 regulation of intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07430
ath:AT2G29380
ath:AT5G51760
dosa:Os01g0846300
dosa:Os09g0325700
osa:4346736
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.759
排名 1 · TkA04G143180 · TK1151
细胞质0.278
排名 2 · TkA04G143180 · TK1151
细胞膜0.068
排名 3 · TkA04G143180 · TK1151
内质网0.035
排名 4 · TkA04G143180 · TK1151
线粒体0.024
排名 5 · TkA04G143180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11830DUF335017-28 aa
PF02272DHHA122-71 aa
PF11830DUF335058-77 aa
PF00481PP2C81-371 aa
PF11830DUF3350137-168 aa
PF13672PP2C_2171-242 aa
PF02272DHHA1340-348 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G143180PF11830DUF335017280.4411.5
TkA04G143180PF02272DHHA122710.01316.6
TkA04G143180PF11830DUF335058770.4411.5
TkA04G143180PF00481PP2C813713.4e-56191.5
TkA04G143180PF11830DUF33501371680.4411.5
TkA04G143180PF13672PP2C_21712420.02614.8
TkA04G143180PF02272DHHA13403480.01316.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLI3拟南芥sp|Q9FLI3|P2C75_ARATH Probable protein phosphatase 2C 7548.100%Swiss-Prot中等置信
Q9ZW21拟南芥sp|Q9ZW21|P2C24_ARATH Probable protein phosphatase 2C 2447.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LNW3拟南芥sp|Q9LNW3|P2C03_ARATH Protein phosphatase 2C 344.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FIF5拟南芥sp|Q9FIF5|P2C78_ARATH Probable protein phosphatase 2C 7847.200%Swiss-Prot中等置信
P49598拟南芥sp|P49598|P2C37_ARATH Protein phosphatase 2C 3746.300%Swiss-Prot中等置信

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