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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G142900
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 36950903-36952287 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1128 bp · TkA04G142900|TK1151|cDNA

ATGAAGAAAATGCTAAACTACTGCTTTTGCTGCACTTCTCCCGAAGATCAAGAACCAACGATCAGTGCCCCAAAGAAAACGGATTATCCATGGAATATGTACACCCTCAAAGAACTTGTGCACGGAACAAACAATTTCCATAACGATAACAAGATAGGTGAAGGAGGCTTTGGTAGTGTTTACTGGGGTCGAACTAGTAAATGCGCTGAGTTGGCAGTGAAACGACTCAAGTCAATAAACGCAAAAGCTGAAATGGAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1128 bp · TkA04G142900|TK1151|CDS

ATGAAGAAAATGCTAAACTACTGCTTTTGCTGCACTTCTCCCGAAGATCAAGAACCAACGATCAGTGCCCCAAAGAAAACGGATTATCCATGGAATATGTACACCCTCAAAGAACTTGTGCACGGAACAAACAATTTCCATAACGATAACAAGATAGGTGAAGGAGGCTTTGGTAGTGTTTACTGGGGTCGAACTAGTAAATGCGCTGAGTTGGCAGTGAAACGACTCAAGTCAATAAACGCAAAAGCTGAAATGGAATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

375 aa · TkA04G142900|TK1151|PROTEIN

MKKMLNYCFCCTSPEDQEPTISAPKKTDYPWNMYTLKELVHGTNNFHNDNKIGEGGFGSVYWGRTSKCAELAVKRLKSINAKAEMEFAVEVEILGRVQHKNLLGLKGFYAGGDERLIVYDYMPNHSLLTHLHGQLASDCLLDWPRRMNIAIGSAEGLAYLHHEVTPHIIHRDIKASNVLLDSDFQAKVADFGFAKLIPDGVTHMTTRVKGTLGYLAPEYAMWGKVSESCDVYSYGILVLEILSGKKPLEKLPGGIKRDII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G142900
TK1151 IDTkA04G142900
OH-1004 IDLXL04_028315
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)69.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 77.067 / OH-1004 28.004
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G142900
位置Chr04:36950903-36952287 (+)
描述Similar to At3g15890: PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g15890
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g15890 PTI1样酪氨酸蛋白激酶 At3g15890。 暂无已核实直接文献
At3g18810 推定的富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK6。 暂无已核实直接文献
At4g34440 蛋白激酶 PERK5，富含脯氨酸的受体样蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g60800 受体激酶，与其他CIK（如CIK1、CIK2、CIK3、CIK5和CIK6）冗余作用，作为CLV1、CLV2/CRN和RPK2的共受体，并需要通过磷酸化介导CLAVATA家族肽（如CLV3）信号；该信号调控原韧皮部分化以及维持芽顶分生组织（SAM）和根顶分生组织（RAM）稳态，并在BRX和OPS下游发挥作用。 暂无已核实直接文献
At2g42960 可能的受体样蛋白激酶 At2g42960。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028315 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004715 non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019901 protein kinase binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68690
ath:AT3G15890
ath:AT3G24550
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.683
排名 1 · TkA04G142900 · TK1151
细胞质0.252
排名 2 · TkA04G142900 · TK1151
细胞核0.225
排名 3 · TkA04G142900 · TK1151
内质网0.041
排名 4 · TkA04G142900 · TK1151
高尔基体0.029
排名 5 · TkA04G142900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase46-315 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr48-315 aa
PF03109ABC152-77 aa
PF03109ABC1158-197 aa
PF01636APH163-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G142900PF00069Pkinase463151.6e-44153.0
TkA04G142900PF07714PK_Tyr_Ser-Thr483158.8e-44150.5
TkA04G142900PF03109ABC152770.3210.8
TkA04G142900PF03109ABC11581970.3210.8
TkA04G142900PF01636APH1631960.2211.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LSC2拟南芥sp|Q9LSC2|Y3589_ARATH PTI1-like tyrosine-protein kinase At3g1589051.400%Swiss-Prot高置信
Q9LS95拟南芥sp|Q9LS95|PERK6_ARATH Putative proline-rich receptor-like protein kinase PERK643.900%Swiss-Prot中等置信
Q8GX23拟南芥sp|Q8GX23|PERK5_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK544.600%Swiss-Prot中等置信
Q93ZS4拟南芥sp|Q93ZS4|CIK1_ARATH Protein CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE 143.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SJG2拟南芥sp|Q9SJG2|Y2296_ARATH Probable receptor-like protein kinase At2g4296041.400%Swiss-Prot中等置信

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