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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G123180
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 32029463-32034429 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2388 bp · TkA04G123180|TK1151|cDNA

TTTCGATTATTGAACCAACTACTGTCGTCTTTTTGAGCGCCGAAGAATCAAAACCCCTCTGGTCCACGACTGAAGAACGAGAATCAGAGGTGAATGATCGATGGCTCTTTTACGACTTCGACATCATCCGGTGATCTCACGAGCACCTTCGCTACTTAGGGCTCGCCTCCTTTCTTCCACCTCCAGATCCATTTCCCGCTATTCCAGATTGCAGAATTCCATACTCGATGATGGTGGCACTTTGTTAAGGCCCAAACTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1914 bp · TkA04G123180|TK1151|CDS

ATGGCTCTTTTACGACTTCGACATCATCCGGTGATCTCACGAGCACCTTCGCTACTTAGGGCTCGCCTCCTTTCTTCCACCTCCAGATCCATTTCCCGCTATTCCAGATTGCAGAATTCCATACTCGATGATGGTGGCACTTTGTTAAGGCCCAAACTTTTTTTTGCATTCAATGGCGTCCATGACCATTCTACACTAAAGTCTCTGAGTGGTATCAGATGCTACTCATCTGCAGAACCCCCTGCACATATAGTGATTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

637 aa · TkA04G123180|TK1151|PROTEIN

MALLRLRHHPVISRAPSLLRARLLSSTSRSISRYSRLQNSILDDGGTLLRPKLFFAFNGVHDHSTLKSLSGIRCYSSAEPPAHIVIGMPALSPTMTQGNIAKWWKKEGDKIEVGDIICEIETDKATLEFESLEEGFLAKILVPAGAKDVPVGQPIAITVEEAENLHNIPDSVLGGSEVKETESTQANVKTEDTVTESTSGKVDASNLPPHILIEMPALSPTMDQGNIARWLKKEGDKIEVGDIICEIETDKATLEFECLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G123180
TK1151 IDTkA04G123180
OH-1004 IDLXL04_035567
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G123180
位置Chr04:32029463-32034429 (+)
描述Similar to LTA3: Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component 1 of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g52200 丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸总体转化为乙酰辅酶A和CO₂。 暂无已核实直接文献
At3g13930 丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸总体转化为乙酰辅酶A和CO₂。 暂无已核实直接文献
At1g54220 丙酮酸脱氢酶复合体催化丙酮酸总体转化为乙酰辅酶A和CO₂。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035567 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006006 glucose metabolic process 生物过程
GO:0006086 pyruvate decarboxylation to acetyl-CoA 生物过程
GO:0006099 tricarboxylic acid cycle 生物过程
GO:0042867 pyruvate catabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0045254 pyruvate dehydrogenase complex 细胞组分
GO:0120212 sperm head-tail coupling apparatus 细胞组分
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
GO:0004742 dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G52200
bta:512723
hsa:1737
mmu:235339
rno:81654
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.810
排名 1 · TkA04G123180 · TK1151
质体0.098
排名 2 · TkA04G123180 · TK1151
细胞质0.088
排名 3 · TkA04G123180 · TK1151
过氧化物酶体0.050
排名 4 · TkA04G123180 · TK1151
细胞核0.038
排名 5 · TkA04G123180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00364Biotin_lipoyl86-156 aa
PF02749QRPTase_N86-123 aa
PF25984BSH_YknX94-132 aa
PF26018BSH_RND_rel96-138 aa
PF25997BSH_YhbJ96-159 aa
PF25917BSH_RND97-139 aa
PF07831PYNP_C105-121 aa
PF16537T2SSB106-130 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G123180PF00364Biotin_lipoyl861562e-36124.4
TkA04G123180PF02749QRPTase_N861230.001419.5
TkA04G123180PF25984BSH_YknX941320.0001422.3
TkA04G123180PF26018BSH_RND_rel961382e-1041.1
TkA04G123180PF25997BSH_YhbJ961593.4e-0937.3
TkA04G123180PF25917BSH_RND971390.004917.4
TkA04G123180PF07831PYNP_C1051210.06713.6
TkA04G123180PF16537T2SSB1061300.1812.2
TkA04G123180PF03293Pox_RNA_pol1101360.06613.5
TkA04G123180PF00364Biotin_lipoyl1751962e-36124.4
TkA04G123180PF00364Biotin_lipoyl2132832e-36124.4
TkA04G123180PF25984BSH_YknX2213570.0001422.3
TkA04G123180PF25997BSH_YhbJ2232863.4e-0937.3
TkA04G123180PF26018BSH_RND_rel2242802e-1041.1
TkA04G123180PF25917BSH_RND2252800.004917.4
TkA04G123180PF02749QRPTase_N2272490.001419.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WQF7拟南芥sp|Q0WQF7|ODP21_ARATH Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component 1 of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial61.300%Swiss-Prot高置信
Q8RWN9拟南芥sp|Q8RWN9|ODP22_ARATH Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component 2 of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial44.000%Swiss-Prot中等置信
Q5M729拟南芥sp|Q5M729|ODP23_ARATH Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component 3 of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial42.600%Swiss-Prot中等置信

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