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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G121280
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 31496687-31499439 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1341 bp · TkA04G121280|TK1151|cDNA

CTTGACGAATAATTTAGTACAGAAAGGTCCTGTTTGACGTGGCATGGGTCCCACAAACGTCTTTAATATTCGAACTCCGATTTATGTCACTTCTTCACGTCACTCCGTTTCCATTACAAACAACTCCCATTGCCGGAAAACTCGAAACACTTTGGACAATCTATGGCTACTGCCGGCGCCGGTCCCGCCTTTGACTTCTCTGCCGTCAGAGTCCGTGGCAATTCTTCTTTCAGACTTACCGGTTTTGAATTTTCATCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

870 bp · TkA04G121280|TK1151|CDS

ATGGCTACTGCCGGCGCCGGTCCCGCCTTTGACTTCTCTGCCGTCAGAGTCCGTGGCAATTCTTCTTTCAGACTTACCGGTTTTGAATTTTCATCATCGACGATTCCTCAACTTTCTCCGTTCAAGTCGTCTTCACCTCACCTCGCTTTCTCTCCGCGTGGATCATCTCATTTTGCTAGAAAGAATATTTTTCAAGCTTCCATCGATGGCGTGGACTCACTTGGTGATGCGGACAACATCCCTACTCCAATTGTTTTAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

289 aa · TkA04G121280|TK1151|PROTEIN

MATAGAGPAFDFSAVRVRGNSSFRLTGFEFSSSTIPQLSPFKSSSPHLAFSPRGSSHFARKNIFQASIDGVDSLGDADNIPTPIVLIDQGSDPSATIVHVSFGDRLGALIDTMKSLKDLGLDVAKGTVTTEGSVIETIFFITRLSTGRKVEDPDLLERIRLTIINNLLKYHPESSSRLAMGEAFGIEAPIKKLDVDIETHIHVKDAGPKRSLLCVETEDRPGLLLEIVKIMSDVNVTMESAEIDTEGLIAKDKFHVSYRG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G121280
TK1151 IDTkA04G121280
OH-1004 IDLXL04_035608
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G121280
位置Chr04:31496687-31499439 (+)
描述Similar to ACR12: ACT domain-containing protein ACR12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g04740 可能参与氨基酸代谢的反馈调控。
The ACR11 encodes a novel type of chloroplastic ACT domain repeat protein that is coordinately expressed with GLN2 in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1186/1471-2229-11-118
At1g16880 可能参与氨基酸代谢的反馈调控。
The ACR11 encodes a novel type of chloroplastic ACT domain repeat protein that is coordinately expressed with GLN2 in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1186/1471-2229-11-118

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: P83643 含ACT结构域蛋白DS12，叶绿体。 暂无已核实直接文献
Os08g0242700 含ACT结构域蛋白DS12，叶绿体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035608 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0010319 stromule 细胞组分
GO:0016597 amino acid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16880
ath:AT5G04740
ath:AT5G65890
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.944
排名 1 · TkA04G121280 · TK1151
细胞核0.051
排名 2 · TkA04G121280 · TK1151
线粒体0.044
排名 3 · TkA04G121280 · TK1151
细胞质0.035
排名 4 · TkA04G121280 · TK1151
过氧化物酶体0.022
排名 5 · TkA04G121280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01842ACT84-117 aa
PF24931ACT_ACR9_3rd85-162 aa
PF26956ACT_ACR_D191-164 aa
PF24914ACR10_N94-146 aa
PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant97-140 aa
PF13291ACT_498-131 aa
PF01842ACT116-142 aa
PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant202-243 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G121280PF01842ACT841172.4e-0524.7
TkA04G121280PF24931ACT_ACR9_3rd851624.3e-1040.2
TkA04G121280PF26956ACT_ACR_D1911642.3e-1453.7
TkA04G121280PF24914ACR10_N941460.02414.7
TkA04G121280PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant971400.0007320.3
TkA04G121280PF13291ACT_4981310.001619.7
TkA04G121280PF01842ACT1161422.4e-0524.7
TkA04G121280PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant2022430.0007320.3
TkA04G121280PF24931ACT_ACR9_3rd2072444.3e-1040.2
TkA04G121280PF26956ACT_ACR_D12112582.3e-1453.7
TkA04G121280PF24914ACR10_N2112480.02414.7
TkA04G121280PF01842ACT2152482.4e-0524.7
TkA04G121280PF13291ACT_42152510.001619.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZ23拟南芥sp|Q9LZ23|ACR12_ARATH ACT domain-containing protein ACR1268.900%Swiss-Prot高置信
Q9FZ47拟南芥sp|Q9FZ47|ACR11_ARATH ACT domain-containing protein ACR1161.300%Swiss-Prot高置信
P83643水稻sp|P83643|UP12_ORYSI ACT domain-containing protein DS12, chloroplastic58.100%Swiss-Prot高置信
Q0J709水稻sp|Q0J709|UP12_ORYSJ ACT domain-containing protein DS12, chloroplastic58.100%Swiss-Prot高置信

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