TkA04G106330 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA04G106330

当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 27680423-27681108 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

531 bp · TkA04G106330|TK1151|cDNA

ATATAAACCTCAATCTTGATCAAACCCTAGTATAGTAACTATCAATCAAGAATTAAAGATATGTCCGGTGTTTGGGTGTTCAAGAATGGTGTGATTCGATTGGTGGAGAACATCGCAAGTGATTCCTTTCAGAGTCGACGTAAGGTGCTGGTTCATGTAGCCACAAACGAAGTGGTGACTTCATACGAAGTTCTTGAAAGAATCTTGTTGTCATTCGGATGGGAGAGGTACTACCATGATGTCGATCTTTTTCAGTTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

327 bp · TkA04G106330|TK1151|CDS

ATGTCCGGTGTTTGGGTGTTCAAGAATGGTGTGATTCGATTGGTGGAGAACATCGCAAGTGATTCCTTTCAGAGTCGACGTAAGGTGCTGGTTCATGTAGCCACAAACGAAGTGGTGACTTCATACGAAGTTCTTGAAAGAATCTTGTTGTCATTCGGATGGGAGAGGTACTACCATGATGTCGATCTTTTTCAGTTTCATAAAAGGTCAAATGTGCACCTAATTTCTCTCCCTAAAGAGTTCAAAAAGTTCAAGTCCAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

108 aa · TkA04G106330|TK1151|PROTEIN

MSGVWVFKNGVIRLVENIASDSFQSRRKVLVHVATNEVVTSYEVLERILLSFGWERYYHDVDLFQFHKRSNVHLISLPKEFKKFKSMHMYDIVVKNRNVFEYSHDKVS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA04G106330`
TK1151 ID	TkA04G106330
OH-1004 ID	LXL04_035809
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	93.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.519 / OH-1004 93.578 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA04G106330

位置 Chr04:27680423-27681108 (-)

描述 Similar to Os02g0460200: Flowering-promoting factor 1-like protein 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g24860`	调节顶端分生组织的开花能力。	FPF1 modulates the competence to flowering in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1999.00461.x FPF1 promotes flowering in Arabidopsis.1997 · DOI: 10.1105/tpc.9.8.1327
`At5g10625`	调节顶端分生组织的开花能力。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0460200`	类似促进开花因子1的蛋白3。	暂无已核实直接文献
`Os01g0257300`	GTP 结合蛋白，在根系统发育中发挥作用，由生长素介导。	Overexpression of OsRAA1 causes pleiotropic phenotypes in transgenic rice plants, including altered leaf, flower, and root development and root response to gravity.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.041996 Biochemical character of the purified OsRAA1, a novel rice protein with GTP-binding activity, and its expression pattern in Oryza sativa.2005 · DOI: 10.1016/j.jplph.2004.12.001 Rice ROOT ARCHITECTURE ASSOCIATED1 binds the proteasome subunit RPT4 and is degraded in a D-box and proteasome-dependent manner.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.125294

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035809 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程

GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程

GO:0045841 negative regulation of mitotic metaphase/anaphase transition 生物过程

GO:2000280 regulation of root development 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005525 GTP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G10625

ath:AT5G24860

dosa:Os01g0257300

dosa:Os02g0460200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.572

排名 1 · TkA04G106330 · TK1151

细胞质0.453

排名 2 · TkA04G106330 · TK1151

线粒体0.048

排名 3 · TkA04G106330 · TK1151

细胞膜0.032

排名 4 · TkA04G106330 · TK1151

内质网0.030

排名 5 · TkA04G106330 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23624`	拟南芥	sp\|O23624\|FPF1_ARATH Flowering-promoting factor 1	65.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LXB5`	拟南芥	sp\|Q9LXB5\|FLP2_ARATH Flowering-promoting factor 1-like protein 2	60.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q0E1D7`	水稻	sp\|Q0E1D7\|FLP3_ORYSJ Flowering-promoting factor 1-like protein 3	59.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LGE3`	水稻	sp\|Q9LGE3\|FLP1_ORYSJ Flowering-promoting factor 1-like protein 1	58.700%	Swiss-Prot	高置信

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