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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G084480
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 22121705-22129104 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2237 bp · TkA04G084480|TK1151|cDNA

ATTCCTGAATCCGTCCATGAGCATACCAAACCACCAAACCACAAAGACAAATGAATAGTCACCAAAATTCTCTAATTCTAATACTAAAGCCTTTGGGAAAAGTGTCGATTAGTCGATTACTTTATCTAAACTCTGTTGTGATGGACGGCAGAGAAAACTACGCACCGGCGATCGGCATCGACCTCGGAACAACGTACTCATGTGTCGCCGTTTGGAAACATGATCGCATCGAAATTATTCCGAATGATCAGGGCAACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1923 bp · TkA04G084480|TK1151|CDS

ATGAATAGTCACCAAAATTCTCTAATTCTAATACTAAAGCCTTTGGGAAAAGTGTCGATTAGTCGATTACTTTATCTAAACTCTGTTGTGATGGACGGCAGAGAAAACTACGCACCGGCGATCGGCATCGACCTCGGAACAACGTACTCATGTGTCGCCGTTTGGAAACATGATCGCATCGAAATTATTCCGAATGATCAGGGCAACAGAACCACACCCTCTTGTGTTGCTTTCGACGATACTGAACGCCTCATAGGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

640 aa · TkA04G084480|TK1151|PROTEIN

MNSHQNSLILILKPLGKVSISRLLYLNSVVMDGRENYAPAIGIDLGTTYSCVAVWKHDRIEIIPNDQGNRTTPSCVAFDDTERLIGDGAKNQAAMNPANTIYDAKRLIGRRFSDAKVQDDIKLWPFKVIEGSADTPKIVVSYKGQDKEFLAEEISSMILGKMKETAEAYLGKVVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVIRIINEPTAAAIAYGLDNKPNITGTINVLVFDLGGGTFDVSILSIEDGETFEVKAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G084480
TK1151 IDTkA04G084480
OH-1004 IDLXL04_036010
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.188 / OH-1004 41.785
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G084480
位置Chr04:22121705-22129104 (+)
描述Similar to HSP70: Heat shock cognate 70 kDa protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12580 与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。
Comprehensive expression profile analysis of the Arabidopsis Hsp70 gene family.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.789
Heat shock protein cognate 70-4 and an E3 ubiquitin ligase, CHIP, mediate plastid-destined precursor degradation through the ubiquitin-26S proteasome system in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071548
At3g09440 在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献
At5g02490 在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献
At1g16030 在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献
At5g02500 与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。
Physiological and molecular assessment of altered expression of Hsc70-1 in Arabidopsis. Evidence for pleiotropic consequences.2003 · DOI: 10.1104/pp.102.019398
Interaction between SGT1 and cytosolic/nuclear HSC70 chaperones regulates Arabidopsis immune responses.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.051896
WPP-domain proteins mimic the activity of the HSC70-1 chaperone in preventing mistargeting of RanGAP1-anchoring protein WIT1.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.143404
The cytosolic/nuclear HSC70 and HSP90 molecular chaperones are important for stomatal closure and modulate abscisic acid-dependent physiological responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.174425

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036010 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0090332 stomatal closure 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02500
sly:101247772
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.598
排名 1 · TkA04G084480 · TK1151
细胞核0.297
排名 2 · TkA04G084480 · TK1151
线粒体0.135
排名 3 · TkA04G084480 · TK1151
细胞膜0.078
排名 4 · TkA04G084480 · TK1151
内质网0.057
排名 5 · TkA04G084480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP7040-636 aa
PF06723MreB_Mbl40-55 aa
PF04010DUF357164-193 aa
PF06723MreB_Mbl172-419 aa
PF07318DUF1464342-430 aa
PF04010DUF357535-585 aa
PF14235DUF4337545-582 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G084480PF00012HSP70406361.7e-228760.5
TkA04G084480PF06723MreB_Mbl40552.8e-1660.0
TkA04G084480PF04010DUF3571641930.0315.0
TkA04G084480PF06723MreB_Mbl1724192.8e-1660.0
TkA04G084480PF07318DUF14643424300.1212.3
TkA04G084480PF04010DUF3575355850.0315.0
TkA04G084480PF14235DUF43375455820.1313.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHA8拟南芥sp|Q9LHA8|HS704_ARATH Heat shock 70 kDa protein 465.500%Swiss-Prot高置信
O65719拟南芥sp|O65719|HSP7C_ARATH Heat shock 70 kDa protein 365.300%Swiss-Prot高置信
P22954拟南芥sp|P22954|HS702_ARATH Heat shock 70 kDa protein 263.500%Swiss-Prot高置信
Q9S9N1拟南芥sp|Q9S9N1|HSP7E_ARATH Heat shock 70 kDa protein 560.600%Swiss-Prot高置信
P22953拟南芥sp|P22953|HS701_ARATH Heat shock 70 kDa protein 171.300%Swiss-Prot高置信

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