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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G076880
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 20258604-20260055 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1355 bp · TkA04G076880|TK1151|cDNA

GATACTCTCTTCATCCAACCGCCACAATTTCCTCGCTTATCTCATCCCTTCACACCTCCAACTCTATACATCACGCCACACTCCTCCTCACCCACTACACACAACCCACCACCACCAATGGCAACCACCACCGCCGCCGCCGCCTCCTCCTTCATCGGAACCCGTCTCCCAGACCGACATTCCAACTCCGGCAGAGTTTCATCCAGATTCGGATTCGGAAAGAAGAAAGCCGCCCCCAAAAAAGCAGCCAGAACCGTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

978 bp · TkA04G076880|TK1151|CDS

GATACTCTCTTCATCCAACCGCCACAATTTCCTCGCTTATCTCATCCCTTCACACCTCCAACTCTATACATCACGCCACACTCCTCCTCACCCACTACACACAACCCACCACCACCAATGGCAACCACCACCGCCGCCGCCGCCTCCTCCTTCATCGGAACCCGTCTCCCAGACCGACATTCCAACTCCGGCAGAGTTTCATCCAGATTCGGATTCGGAAAGAAGAAAGCCGCCCCCAAAAAAGCAGCCAGAACCGTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

325 aa · TkA04G076880|TK1151|PROTEIN

DTLFIQPPQFPRLSHPFTPPTLYITPHSSSPTTHNPPPPMATTTAAAASSFIGTRLPDRHSNSGRVSSRFGFGKKKAAPKKAARTVTSDRPLWYPGAKAPEYLDGSLVGDYGFDPFGLGKPAEYLQFDLDSLDQNLAKNLAGDVIGTRFEDSDVKSTPFQPYSEVFGLQRFRECELIHGRWAMLATLGALTVESVTGVTWQDAGKVELIDGSSYLGQPLPFSITTLIWIEVLIIGYIEFQRNAELEPEKRLYPGGPFDPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G076880
TK1151 IDTkA04G076880
OH-1004 IDLXL04_036090
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.231 / OH-1004 96.853
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G076880
位置Chr04:20258604-20260055 (+)
描述Similar to LHCB4.2: Chlorophyll a-b binding protein CP29.2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g01530 光合捕光复合体（LHC）作为光受体，捕获并将激发能量传递给它密切相关的光系统。 暂无已核实直接文献
At3g08940 光合捕光复合体（LHC）作为光受体，捕获并将激发能量传递给它密切相关的光系统。 暂无已核实直接文献
At2g40100 光合捕光复合体（LHC）作为光受体，捕获并将激发能量传递给它密切相关的光系统。 暂无已核实直接文献
At4g10340 光合捕光复合体（LHC）作为光受体，捕获并将激发能量传递给它密切相关的光系统。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036090 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009645 response to low light intensity stimulus 生物过程
GO:0009765 photosynthesis, light harvesting 生物过程
GO:0009768 photosynthesis, light harvesting in photosystem I 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009503 thylakoid light-harvesting complex 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009522 photosystem I 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40100
ath:AT3G08940
ath:AT3G54890
ath:AT5G01530
cre:CHLRE_17g720250v5
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.987
排名 1 · TkA04G076880 · TK1151
线粒体0.021
排名 2 · TkA04G076880 · TK1151
细胞质0.012
排名 3 · TkA04G076880 · TK1151
细胞核0.010
排名 4 · TkA04G076880 · TK1151
细胞膜0.008
排名 5 · TkA04G076880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00504Chloroa_b-bind99-294 aa
PF31213HliA174-197 aa
PF31213HliA275-300 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G076880PF00504Chloroa_b-bind992943.5e-42145.4
TkA04G076880PF31213HliA1741970.0001222.7
TkA04G076880PF31213HliA2753000.0001222.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q07473拟南芥sp|Q07473|CB4A_ARATH Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic84.500%Swiss-Prot高置信
Q9XF88拟南芥sp|Q9XF88|CB4B_ARATH Chlorophyll a-b binding protein CP29.2, chloroplastic85.100%Swiss-Prot高置信
Q9S7W1拟南芥sp|Q9S7W1|CB4C_ARATH Chlorophyll a-b binding protein CP29.3, chloroplastic70.800%Swiss-Prot高置信
Q9XF89拟南芥sp|Q9XF89|CB5_ARATH Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic35.200%Swiss-Prot中等置信

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