基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G076480
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 20116295-20120953
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3521 bp · TkA04G076480|TK1151|cDNA
ATTTTTCTCTCCACTTGATGATAATAAAAGGAATTTTGGAGTTGAATTATTATCATCGACTTATCCCACTCCCAACCGGTTCATATGGCCATGGTATCAAGATCTCATCCAATCATCCATCTTCTTCCATGGCTGCTTCTCCAGTTTGTTTTACTTATGATATTTTTCTAAGTTTTCGAGGTGAAGACACCCGTAAGACATTTACAGATTTTTTGTATGCCGCCATGAAGCAAGCAGGAATCCGCACTTTTAGGGATGAT...
CDS
下载 CDS FASTA3315 bp · TkA04G076480|TK1151|CDS
ATGATAATAAAAGGAATTTTGGAGTTGAATTATTATCATCGACTTATCCCACTCCCAACCGGTTCATATGGCCATGGTATCAAGATCTCATCCAATCATCCATCTTCTTCCATGGCTGCTTCTCCAGTTTGTTTTACTTATGATATTTTTCTAAGTTTTCGAGGTGAAGACACCCGTAAGACATTTACAGATTTTTTGTATGCCGCCATGAAGCAAGCAGGAATCCGCACTTTTAGGGATGATGATGCGTTGGAAAGAGG...
1104 aa · TkA04G076480|TK1151|PROTEIN
MIIKGILELNYYHRLIPLPTGSYGHGIKISSNHPSSSMAASPVCFTYDIFLSFRGEDTRKTFTDFLYAAMKQAGIRTFRDDDALERGKLLKPELKKAVQQSAISLIVFSKNYASSKWCLDEVSMIIEEHETLFSKHEVVPVFYNVDPSDVRHQKGSFKEAFDGFDDIIKAETNLEEKTRWLEKVGAWRDSLRKAANFAGMVSTDGYEAKFVNDIVNVIRKKLDYKTLYIEEKLVGINENVSVTESWLQDPSPNAVILFID...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G076480 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G076480 |
| OH-1004 ID | LXL04_001293 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 63.300 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 93.388 / OH-1004 98.941覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G076480 |
|---|---|
| 位置 | Chr04:20116295-20120953 (-) |
| 描述 | Similar to RUN1: Disease resistance protein RUN1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程 GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程 GO:0050832 defense response to fungus 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能 GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能 GO:0043531 ADP binding 分子功能 GO:0050135 NADP+ nucleosidase activity 分子功能 GO:0061809 NAD+ nucleosidase activity, cyclic ADP-ribose generating 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | 暂无功能描述 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.459
细胞核0.315
细胞膜0.299
内质网0.084
质体0.038
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01582TIR47-227 aaPF13676TIR_249-148 aaPF13173AAA_14107-125 aaPF24883NPHP3_N243-324 aaPF00931NB-ARC246-412 aaPF01637ATPase_2253-353 aaPF13191AAA_16255-348 aaPF13173AAA_14256-357 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G076480 | PF01582 | TIR | 47 | 227 | 2.6e-41 | 142.1 |
| TkA04G076480 | PF13676 | TIR_2 | 49 | 148 | 7.1e-14 | 53.1 |
| TkA04G076480 | PF13173 | AAA_14 | 107 | 125 | 0.035 | 14.8 |
| TkA04G076480 | PF24883 | NPHP3_N | 243 | 324 | 0.0004 | 21.3 |
| TkA04G076480 | PF00931 | NB-ARC | 246 | 412 | 4.7e-17 | 62.8 |
| TkA04G076480 | PF01637 | ATPase_2 | 253 | 353 | 0.00026 | 21.6 |
| TkA04G076480 | PF13191 | AAA_16 | 255 | 348 | 0.26 | 12.5 |
| TkA04G076480 | PF13173 | AAA_14 | 256 | 357 | 0.035 | 14.8 |
| TkA04G076480 | PF20720 | nSTAND3 | 256 | 296 | 0.045 | 14.1 |
| TkA04G076480 | PF24883 | NPHP3_N | 460 | 508 | 0.0004 | 21.3 |
| TkA04G076480 | PF23282 | WHD_ROQ1 | 481 | 549 | 4.3e-20 | 72.4 |
| TkA04G076480 | PF13855 | LRR_8 | 617 | 633 | 1.6e-09 | 38.1 |
| TkA04G076480 | PF23598 | LRR_14 | 617 | 681 | 3.6e-05 | 23.4 |
| TkA04G076480 | PF12799 | LRR_4 | 656 | 678 | 6.3e-10 | 39.7 |
| TkA04G076480 | PF23247 | LRR_RPS2 | 665 | 693 | 0.0025 | 18.5 |
| TkA04G076480 | PF25019 | LRR_R13L1-DRL21 | 665 | 723 | 0.0034 | 18.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
F4I594 | 拟南芥 | sp|F4I594|RLM1A_ARATH Disease resistance protein RML1A | 29.800% | Swiss-Prot | 低置信 |