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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G040380
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 10811490-10813831 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1870 bp · TkA04G040380|TK1151|cDNA

CAAACGCGTATTCGCGCGCTTTCTTATCATCTTCCTGGATCTTTCGCTCAACGCCCAATCTGCTTTTCTATATAAATTACTCTTCAAATCACTCATCTCTTTCTCGATTTATACAAAAATTCCACCTGTTAGAAAGAGAAAGAGAAAAAGAAAGAGAGATACATCTTGATCTTGCTACGGAATCTGTTACAGTAAACTAATGGCGGACTTGAACGGAGGAGTTCAGTACACGGACTTTCCGGCGGTGTCGACATACGGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1119 bp · TkA04G040380|TK1151|CDS

ATGGCGGACTTGAACGGAGGAGTTCAGTACACGGACTTTCCGGCGGTGTCGACATACGGAGGCCAGTTCGTTCGGTACAACATATTCAGTAATGAATTCGAGATCACAGCCAAATACGTTCCTCCTATTATGCCTATTGGCCGTGGTGCTTATGGAATCGTCTGCTCGATGTTGAATTCGGAGACGAATGAGATGGTTGCTATGAAGAAGATCATGAATGCTTTTGACAATTACATGGATGCTAAGAGAACGCTTCGTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

372 aa · TkA04G040380|TK1151|PROTEIN

MADLNGGVQYTDFPAVSTYGGQFVRYNIFSNEFEITAKYVPPIMPIGRGAYGIVCSMLNSETNEMVAMKKIMNAFDNYMDAKRTLREIKLLRHLDHENVVALKDVVPPPVRREFSDVYIATELMDTDLHQIIRSNQNLSEEHCQYFLYQLLRGLKYIHSAKVIHRDLKPSNLLLNANCDLKICDFGLARPNADNDFMTEYVVTRWYRAPELLLNSSDYSAAIDVWSVGCIYMELMNRKPLFPGKDHVHQMRLLTELLGTP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G040380
TK1151 IDTkA04G040380
OH-1004 IDLXL04_036503
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G040380
位置Chr04:10811490-10813831 (-)
描述Similar to MPK3: Mitogen-activated protein kinase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g45640 参与氧化应激介导的信号级联。
MAP kinase signalling cascade in Arabidopsis innate immunity.2002 · DOI: 10.1038/415977a
RNA interference-based (RNAi) suppression of AtMPK6, an Arabidopsis mitogen-activated protein kinase, results in hypersensitivity to ozone and misregulation of AtMPK3.2005 · DOI: 10.1016/j.envpol.2005.04.017
Stomatal development and patterning are regulated by environmentally responsive mitogen-activated protein kinases in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.048298
Dual control of nuclear EIN3 by bifurcate MAPK cascades in C2H4 signalling.2008 · DOI: 10.1038/nature06543
A fungal-responsive MAPK cascade regulates phytoalexin biosynthesis in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0711301105
The Arabidopsis protein kinase Pto-interacting 1-4 is a common target of the oxidative signal-inducible 1 and mitogen-activated protein kinases.2011 · DOI: 10.1111/j.1742-4658.2011.08033.x
Arabidopsis MKK4 mediates osmotic-stress response via its regulation of MPK3 activity.2011 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2011.07.064
A MAPK cascade downstream of ERECTA receptor-like protein kinase regulates Arabidopsis inflorescence architecture by promoting localized cell proliferation.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.104695
Arabidopsis LIP5, a positive regulator of multivesicular body biogenesis, is a critical target of pathogen-responsive MAPK cascade in plant basal defense.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004243
The BASL polarity protein controls a MAPK signaling feedback loop in asymmetric cell division.2015 · DOI: 10.1016/j.devcel.2015.02.022

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XFC8 参与抗病性和非生物胁迫耐受信号通路。 暂无已核实直接文献
Os03g0285800 参与抗病性和非生物胁迫耐受信号通路。
Disease resistance and abiotic stress tolerance in rice are inversely modulated by an abscisic acid-inducible mitogen-activated protein kinase.2003 · DOI: 10.1105/tpc.008714
Direct phosphorylation and activation of a mitogen-activated protein kinase by a calcium-dependent protein kinase in rice.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.126441
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036503 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009875 pollen-pistil interaction 生物过程
GO:0010120 camalexin biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G45640
cann:107873437
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.631
排名 1 · TkA04G040380 · TK1151
细胞质0.587
排名 2 · TkA04G040380 · TK1151
细胞膜0.061
排名 3 · TkA04G040380 · TK1151
线粒体0.039
排名 4 · TkA04G040380 · TK1151
内质网0.027
排名 5 · TkA04G040380 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21766Dit_C5-79 aa
PF00069Pkinase45-326 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr46-237 aa
PF06293Kdo75-178 aa
PF01636APH81-160 aa
PF01163RIO183-186 aa
PF14531Kinase-like84-100 aa
PF04281Tom2297-120 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G040380PF21766Dit_C5790.02115.3
TkA04G040380PF00069Pkinase453267e-71239.4
TkA04G040380PF07714PK_Tyr_Ser-Thr462376.6e-32111.5
TkA04G040380PF06293Kdo751782.5e-0524.5
TkA04G040380PF01636APH811600.03414.6
TkA04G040380PF01163RIO1831860.03614.4
TkA04G040380PF14531Kinase-like841000.06613.2
TkA04G040380PF04281Tom22971200.2811.7
TkA04G040380PF13095FTA21071870.2111.9
TkA04G040380PF03109ABC11341910.001318.7
TkA04G040380PF14531Kinase-like1372280.06613.2
TkA04G040380PF01636APH1621880.03414.6
TkA04G040380PF12330Haspin_kinase1631940.01515.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39023拟南芥sp|Q39023|MPK3_ARATH Mitogen-activated protein kinase 380.600%Swiss-Prot高置信
A2XFC8水稻sp|A2XFC8|MPK5_ORYSI Mitogen-activated protein kinase 572.900%Swiss-Prot高置信
Q10N20水稻sp|Q10N20|MPK5_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 572.900%Swiss-Prot高置信

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