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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G031430
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 8273476-8278117 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2007 bp · TkA04G031430|TK1151|cDNA

AAAAATCTTATGGATGAAAGATAACATGGAATTCAAGCTCAGAGTACTCACCGCCTTAGGTTTCTTAGTTGGTGCCAAGGTAAGTACTAAATGTTCAGGTTCCATTCTTATTCAAGCTCGCTGTTGATTGGTTAACAACAGCATCAGGGAACCCTAGTACAATTTCTGAATTTGCAGCCTCAAATCCAACAGCTTTAGCTGTTTTCGTGAGTCCTGCTGCTGTTTTGATTGGTTATGGTATTGCAAGGACAGGGGCTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1365 bp · TkA04G031430|TK1151|CDS

ATGGTGTTCAATGTTGTTCCAACTGTGTTAGAGATTACAATGGTGGGAGGTATTCTCGCGTACAAATTTGGATCAGTGTTTGCAATAATTACATCTTTGTCTGTTGCTGCGTATGTTACCTTCACTTTGACTATAACACAATGGAGGACTAAATTCAGGAAGATAATGAACAAAGCTGATAATGATGCAAGCACAAGAGCAATTGATTCACTTATAAATTATGAAACTGTGAAGTATTTCAACAATGAACAATATGAAGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

454 aa · TkA04G031430|TK1151|PROTEIN

MVFNVVPTVLEITMVGGILAYKFGSVFAIITSLSVAAYVTFTLTITQWRTKFRKIMNKADNDASTRAIDSLINYETVKYFNNEQYEADEYDKYLKRYEDAALKTQRSLAILNFGQTLVFSTALSAAMVLTSNGILNGQMTVGDLVMVNGLLFQLSLPLNFLGSVYRETVQSLVDMKSMFQLLEEKAEVGDAVDAKPIKFGGGSIEFENVHFSYLPERKILDGISFVVPAGKSVAIVGTSGSGKSTILRMIFRFFDTNSGT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G031430
TK1151 IDTkA04G031430
OH-1004 IDLXL04_036663
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 61.376
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G031430
位置Chr04:8273476-8278117 (-)
描述Similar to ABCB25: ABC transporter B family member 25, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58270 通过介导 NFS1 和其他线粒体蛋白合成的 Fe/S 簇前体的输出，在细胞质铁硫蛋白的生成中发挥重要功能。
An allelic mutant series of ATM3 reveals its key role in the biogenesis of cytosolic iron-sulfur proteins in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.143651
A novel role for Arabidopsis mitochondrial ABC transporter ATM3 in molybdenum cofactor biosynthesis.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.068478
At4g28630 通过介导 NFS1 和其他线粒体蛋白合成的 Fe/S 簇前体的输出，在细胞质铁硫蛋白的生成中发挥重要功能。
A mutation of the mitochondrial ABC transporter Sta1 leads to dwarfism and chlorosis in the Arabidopsis mutant starik.2001 · DOI: 10.1105/tpc.13.1.89
At4g28620 通过介导由 NFS1 和其他线粒体蛋白合成的 Fe/S 群前体的输出，在细胞质铁硫蛋白生成中执行重要功能（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036663 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006777 Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process 生物过程
GO:0006826 iron ion transport 生物过程
GO:0006879 intracellular iron ion homeostasis 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0010288 response to lead ion 生物过程
GO:0010312 detoxification of zinc ion 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程
GO:0046686 response to cadmium ion 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0051276 chromosome organization 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G28620
ath:AT4G28630
ath:AT5G58270
dre:566515
ola:101168300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.250
排名 1 · TkA04G031430 · TK1151
细胞质0.239
排名 2 · TkA04G031430 · TK1151
线粒体0.220
排名 3 · TkA04G031430 · TK1151
溶酶体／液泡0.118
排名 4 · TkA04G031430 · TK1151
细胞膜0.111
排名 5 · TkA04G031430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00664ABC_membrane13-157 aa
PF13175AAA_1555-94 aa
PF01935DUF8758-99 aa
PF13173AAA_1473-98 aa
PF00485PRK75-98 aa
PF13476AAA_2378-104 aa
PF25199nSTAND_NTPase5201-250 aa
PF00158Sigma54_activat219-270 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G031430PF00664ABC_membrane131573e-2383.6
TkA04G031430PF13175AAA_1555940.0006820.0
TkA04G031430PF01935DUF8758990.01915.8
TkA04G031430PF13173AAA_1473980.04914.3
TkA04G031430PF00485PRK75980.2112.1
TkA04G031430PF13476AAA_23781040.03915.3
TkA04G031430PF25199nSTAND_NTPase52012500.0116.4
TkA04G031430PF00158Sigma54_activat2192700.1912.1
TkA04G031430PF00005ABC_tran2203693.2e-33115.9
TkA04G031430PF13481AAA_252222470.2611.6
TkA04G031430PF13555AAA_292292470.001718.8
TkA04G031430PF13191AAA_162303700.001220.1
TkA04G031430PF13479AAA_242302830.001618.9
TkA04G031430PF13476AAA_232302510.03915.3
TkA04G031430PF03193RsgA_GTPase2302610.07513.6
TkA04G031430PF06414Zeta_toxin2312710.0007419.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LVM1拟南芥sp|Q9LVM1|AB25B_ARATH ABC transporter B family member 25, mitochondrial81.700%Swiss-Prot高置信
Q9FUT3拟南芥sp|Q9FUT3|AB23B_ARATH ABC transporter B family member 23, mitochondrial77.200%Swiss-Prot高置信
Q9M0G9拟南芥sp|Q9M0G9|AB24B_ARATH ABC transporter B family member 24, mitochondrial74.900%Swiss-Prot高置信

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