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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G024810
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 6449147-6452233 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1803 bp · TkA04G024810|TK1151|cDNA

TTCCTCTCTCTATCTCACTTCTTACCCAACTTAATCCTACATAATCTCCTTTATTCTTATTCACTCTTCTTCCTAGAATCTTTTCTCCACATTTCTCCCATGGAACAACTCCAACACCACCCACAGCTCACGTTAGCCAAGAGCTCTCGTCACCACTATAATGAATGGATATTTCGCGATGTCCCCAGTGATATAACAATAGAAGTGAACGGTGTCACGTTTGCATTACATAAGTTTCCTCTCGTATCCCGTAGCGGACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1905 bp · TkA04G024810|TK1151|CDS

TTCCTCTCTCTATCTCACTTCTTACCCAACTTAATCCTACATAATCTCCTTTATTCTTATTCACTCTTCTTCCTAGAATCTTTTCTCCACATTTCTCCCATGGAACAACTCCAACACCACCCACAGCTCACGTTAGCCAAGAGCTCTCGTCACCACTATAATGAATGGATATTTCGCGATGTCCCCAGTGATATAACAATAGAAGTGAACGGTGTCACGTTTGCATTACATAAGTTTCCTCTCGTATCCCGTAGCGGACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

634 aa · TkA04G024810|TK1151|PROTEIN

FLSLSHFLPNLILHNLLYSYSLFFLESFLHISPMEQLQHHPQLTLAKSSRHHYNEWIFRDVPSDITIEVNGVTFALHKFPLVSRSGQIRKTVSENRDSVISRITLQNLPGGTEAFELAAKFCYGVNFEITPSNVAQLICVSDYLEMTDDFSNNNLGLRADEYLNNVVCQNLEMSVLVLQQCENLLPKADELKIVTRCIDAIASKACVEQIASSFSRLEYSSSGRLHMSRTKCELDWWIKDLSVLRIDLYQRVMSAMKCRG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G024810
TK1151 IDTkA04G024810
OH-1004 IDLXL04_036778
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.322 / OH-1004 99.007
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G024810
位置Chr04:6449147-6452233 (+)
描述Similar to At5g48800: BTB/POZ domain-containing protein At5g48800
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48800 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At1g03010 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At2g47860 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At3g08570 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At3g08660 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036778 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03010
ath:AT2G47860
ath:AT3G08570
ath:AT3G08660
ath:AT5G48800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.515
排名 1 · TkA04G024810 · TK1151
细胞质0.375
排名 2 · TkA04G024810 · TK1151
细胞膜0.159
排名 3 · TkA04G024810 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA04G024810 · TK1151
溶酶体／液泡0.047
排名 5 · TkA04G024810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16406DUF501433-82 aa
PF00651BTB63-148 aa
PF20331DUF6626144-189 aa
PF26052BRE1B224-251 aa
PF03000NPH3235-484 aa
PF26052BRE1B495-512 aa
PF14988DUF4515540-586 aa
PF05557MAD545-584 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G024810PF16406DUF501433820.1612.8
TkA04G024810PF00651BTB631483.9e-0627.7
TkA04G024810PF20331DUF66261441890.06714.3
TkA04G024810PF26052BRE1B2242516.37.3
TkA04G024810PF03000NPH32354841.5e-91307.3
TkA04G024810PF26052BRE1B4955126.37.3
TkA04G024810PF14988DUF45155405860.1113.2
TkA04G024810PF05557MAD5455840.06212.4
TkA04G024810PF06156YabA5465910.06914.5
TkA04G024810PF02183HALZ5475700.09213.6
TkA04G024810PF17078SHE35475940.3711.2
TkA04G024810PF26022CC_Liprin_beta5506010.2612.3
TkA04G024810PF26052BRE1B5505896.37.3
TkA04G024810PF29075NOCA1_mid5515900.03414.7
TkA04G024810PF25068ARM_TT21_4th5546020.1812.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKB6拟南芥sp|Q9FKB6|Y5880_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At5g4880073.400%Swiss-Prot高置信
Q9SA69拟南芥sp|Q9SA69|Y1301_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At1g0301047.000%Swiss-Prot中等置信
O82253拟南芥sp|O82253|SETH6_ARATH BTB/POZ domain-containing protein SETH647.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C9Z7拟南芥sp|Q9C9Z7|Y3857_ARATH BTB/POZ domain-containing protein At3g0857048.400%Swiss-Prot中等置信
Q9C9Z0拟南芥sp|Q9C9Z0|Y3866_ARATH Putative BTB/POZ domain-containing protein At3g0866047.300%Swiss-Prot中等置信

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