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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G022830
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 5805792-5811512 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3114 bp · TkA04G022830|TK1151|cDNA

CCCCACCTTACTCGCAGAGACCCCCTCCCTCTTTTCATCTCCCCTGTTTCTTCTCCAGCTGAAGACTGTCATTACTTCCTCATCTCTCTCTCACACACACAACACGCAAAACCCTTTTTCTTCAATACTCTTCAAGATCTAACAACTGTTTTTTTCTCACTAGATCTCCGTATCTGTATCTATCTCACTCGGTTTCTGTCTGAAACCCGTTTGCATCTGATTTTCGCCGCAGTTTATGGATCTACATTGCGGATTCGAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2133 bp · TkA04G022830|TK1151|CDS

ATGTCAATGAGCACAAGATTTCCATCTATATCATCACACACACATCCTTCATATGTACCTGCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCAACAATTCAAGGCCCTGTTGCTAGCCCTCGAAGAAAGCGACATCGCCATCATTTTCGTCATGGGAAGATCACCCATTCAATCTCTCCATCTCCATCTCCTGTACCAGGTTGTGACCAAACGTGCTCGGAACCACTGACTTCAACTCCACTGGGATCACCATGCGGTTGTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

710 aa · TkA04G022830|TK1151|PROTEIN

MSMSTRFPSISSHTHPSYVPASSPSPSPSPTIQGPVASPRRKRHRHHFRHGKITHSISPSPSPVPGCDQTCSEPLTSTPLGSPCGCVFPMKVKLLLQVSVYAVFPVVNELEIEIATGTYLTQSQVVITGASADSQNQEKTAVDINLVPLGEKFDNTTALLTYDKIWRKKLSLNRTLFGDYEVVYIIYPGLPSSPPYGGQPGSGPDASPGNRQFPITATFVGKTQKMNPKTIFVITLSAVVLLVVCLAAISVFLKYRKIGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G022830
TK1151 IDTkA04G022830
OH-1004 IDLXL04_036814
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.708
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G022830
位置Chr04:5805792-5811512 (+)
描述Similar to ALE2: Receptor-like serine/threonine-protein kinase ALE2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g20300 在原胚层分化为芽表皮和角质层期间需要。
Novel receptor-like kinase ALE2 controls shoot development by specifying epidermis in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1242/dev.003533
At1g68690 可能参与根生长的负调控。 暂无已核实直接文献
At1g20650 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At3g20530 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0372100 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中充当 CERK1 的直接下游信号传导伴侣。
A receptor-like cytoplasmic kinase targeted by a plant pathogen effector is directly phosphorylated by the chitin receptor and mediates rice immunity.2013 · DOI: 10.1016/j.chom.2013.02.007
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036814 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002758 innate immune response-activating signaling pathway 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010068 protoderm histogenesis 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0071323 cellular response to chitin 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68690
ath:AT2G20300
ath:AT3G20530
ath:AT5G18610
dosa:Os05g0372100
osa:4338592
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.817
排名 1 · TkA04G022830 · TK1151
细胞质0.105
排名 2 · TkA04G022830 · TK1151
细胞核0.090
排名 3 · TkA04G022830 · TK1151
内质网0.079
排名 4 · TkA04G022830 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkA04G022830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23180ALE2_N73-191 aa
PF23041DUF703696-178 aa
PF08445FR47261-285 aa
PF00069Pkinase321-591 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr323-592 aa
PF03109ABC1324-354 aa
PF01636APH428-467 aa
PF03109ABC1434-474 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G022830PF23180ALE2_N731917.6e-55184.9
TkA04G022830PF23041DUF7036961780.1613.3
TkA04G022830PF08445FR472612850.06513.9
TkA04G022830PF00069Pkinase3215914.1e-45155.0
TkA04G022830PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3235928.2e-48163.7
TkA04G022830PF03109ABC13243540.02514.5
TkA04G022830PF01636APH4284670.03214.7
TkA04G022830PF03109ABC14344740.02514.5
TkA04G022830PF01636APH5105510.03214.7
TkA04G022830PF08445FR475685930.06513.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWW0拟南芥sp|Q8RWW0|ALE2_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase ALE269.800%Swiss-Prot高置信
Q9SX31拟南芥sp|Q9SX31|PERK9_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK955.900%Swiss-Prot低置信
Q9LDZ5拟南芥sp|Q9LDZ5|PBL21_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2152.700%Swiss-Prot低置信
F4JEQ2拟南芥sp|F4JEQ2|PBL23_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL2352.000%Swiss-Prot低置信
Q6I5Q6水稻sp|Q6I5Q6|RK185_ORYSJ Receptor-like cytoplasmic kinase 18553.200%Swiss-Prot低置信

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