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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G019630
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 4907922-4910423 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1639 bp · TkA04G019630|TK1151|cDNA

CACCTCTTTAGGTGTCAATCTCTCATCCACCTTCCTCTCCTTTAAAACCCACCTCCACCACCATCACAATCCACCATCACAACCACCATGGCTAAGTTTCTCTCTCTTTCTCTAACCTTCCTCGTCGTCTTCCATGGCTGCCTCGCTCTCCGCCCTTTCCAGCAACAGCAACAAGACCAATGCCAGATTCAACGAATCAACGCCCTTGAACCCAACGAGCGAGTTCAATCCGAAGCTGGGTGGACCGATTTCTTTGATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1419 bp · TkA04G019630|TK1151|CDS

ATGGCTAAGTTTCTCTCTCTTTCTCTAACCTTCCTCGTCGTCTTCCATGGCTGCCTCGCTCTCCGCCCTTTCCAGCAACAGCAACAAGACCAATGCCAGATTCAACGAATCAACGCCCTTGAACCCAACGAGCGAGTTCAATCCGAAGCTGGGTGGACCGATTTCTTTGATTCCAGCAACCAGCAGTTCCAGTGTGCCGGAGTAGAAGTCATCCGCCACCATATTCAGCCTCAAGGACTCCTCTTACCTTCTTACATCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

472 aa · TkA04G019630|TK1151|PROTEIN

MAKFLSLSLTFLVVFHGCLALRPFQQQQQDQCQIQRINALEPNERVQSEAGWTDFFDSSNQQFQCAGVEVIRHHIQPQGLLLPSYINTPLMVYILQGRGYQGTMMPGCAETFQSSQQLQEGSGSSFQDRHQKIRHFQQGDVVVIPAGAAHWMYNDGQEEIIAVTLLDSTNSANQLDQFHRRFFLAGNPQQGQQQQQQGGRSWGRSQKRQSGQSQEEGAGNIFQGFDLEMLAEVFNVDQETAEKLQSPQDNRGHIVKVERG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G019630
TK1151 IDTkA04G019630
OH-1004 IDLXL04_036872
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G019630
位置Chr04:4907922-4910423 (-)
描述Similar to 11S globulin
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036872 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0048316 seed development 生物过程
GO:0070207 protein homotrimerization 生物过程
GO:0043245 extraorganismal space 细胞组分
GO:0019863 IgE binding 分子功能
GO:0019864 IgG binding 分子功能
GO:0045735 nutrient reservoir activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ghi:107916455
jre:108996042
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.509
排名 1 · TkA04G019630 · TK1151
内质网0.255
排名 2 · TkA04G019630 · TK1151
细胞外0.231
排名 3 · TkA04G019630 · TK1151
细胞质0.134
排名 4 · TkA04G019630 · TK1151
细胞膜0.062
排名 5 · TkA04G019630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04618HD-ZIP_N19-63 aa
PF00190Cupin_138-189 aa
PF07883Cupin_291-99 aa
PF04618HD-ZIP_N110-146 aa
PF05899Cupin_3127-148 aa
PF22200ExsA_N130-149 aa
PF12852Cupin_6132-165 aa
PF07883Cupin_2135-162 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G019630PF04618HD-ZIP_N19630.4711.7
TkA04G019630PF00190Cupin_1381891.5e-64216.9
TkA04G019630PF07883Cupin_291995.7e-0523.5
TkA04G019630PF04618HD-ZIP_N1101460.4711.7
TkA04G019630PF05899Cupin_31271480.003517.7
TkA04G019630PF22200ExsA_N1301490.03815.1
TkA04G019630PF12852Cupin_61321650.01615.7
TkA04G019630PF07883Cupin_21351625.7e-0523.5
TkA04G019630PF03079ARD1361660.01716.0
TkA04G019630PF04618HD-ZIP_N1842420.4711.7
TkA04G019630PF00190Cupin_12142411.5e-64216.9
TkA04G019630PF12852Cupin_62632920.01615.7
TkA04G019630PF00190Cupin_12974441.5e-64216.9
TkA04G019630PF12852Cupin_63313910.01615.7
TkA04G019630PF22200ExsA_N3534270.03815.1
TkA04G019630PF07883Cupin_23553915.7e-0523.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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