基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA04G017170
当前版本: TK1151
染色体: Chr04
坐标: 4268532-4272302
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1125 bp · TkA04G017170|TK1151|cDNA
ATGGACGATGCTTCTGGAAGCGGTAAAAGGTTCCGTGACGACGTCGTTGATAGCCGGATTTCCTCTTCGGTAAATGGGTTTCAAGGTCAGCCTATGGCTAACCCGGTTCAAACGGCTCCAAATCCACCGGCTGCCCGTCCGACTAGGGTCAGAGCTAGGCGAGGTCAGGCCACTGACCCACACAGTATTGCTGAGAGGCTTCGGCGAGAAAGAATAGCGGAGAGAATCAGAGCGTTACAAGAACTGGTTCCTAGTGTAAA...
CDS
下载 CDS FASTA639 bp · TkA04G017170|TK1151|CDS
ATGGACGATGCTTCTGGAAGCGGTAAAAGGTTCCGTGACGACGTCGTTGATAGCCGGATTTCCTCTTCGGTAAATGGGTTTCAAGGTCAGCCTATGGCTAACCCGGTTCAAACGGCTCCAAATCCACCGGCTGCCCGTCCGACTAGGGTCAGAGCTAGGCGAGGTCAGGCCACTGACCCACACAGTATTGCTGAGAGGCTTCGGCGAGAAAGAATAGCGGAGAGAATCAGAGCGTTACAAGAACTGGTTCCTAGTGTAAA...
212 aa · TkA04G017170|TK1151|PROTEIN
MDDASGSGKRFRDDVVDSRISSSVNGFQGQPMANPVQTAPNPPAARPTRVRARRGQATDPHSIAERLRRERIAERIRALQELVPSVNKTDRAAMLDEIVDYVKFLRLQVKVLSMSRLGGASAVAPLVTDIPISSVEEEGGEGGRNQPAWEKWSNDGTERQVAKLMEENVGAAMQFLQSKALCIMPISLASAIYHTQPPDSTSIVKPESEPPL
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA04G017170 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA04G017170 |
| OH-1004 ID | LXL04_003442 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 78.400 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 87.264 / OH-1004 62.585覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA04G017170 |
|---|---|
| 位置 | Chr04:4268532-4272302 (+) |
| 描述 | Similar to UNE12: Transcription factor UNE12 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0031347 regulation of defense response 生物过程 GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程 GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程 GO:0048767 root hair elongation 生物过程 GO:0055046 microgametogenesis 生物过程 GO:0080147 root hair cell development 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G03040 ath:AT2G24260 ath:AT4G02590 ath:AT4G30980 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.976
细胞质0.092
细胞膜0.023
内质网0.014
质体0.010
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00772DnaB53-103 aaPF00010HLH61-106 aaPF23177bHLH_IRO363-113 aaPF23173bHLH_SAC5165-108 aaPF26228RESC9_N65-112 aaPF04281Tom2266-103 aaPF23176bHLH_LHW69-106 aaPF00772DnaB116-133 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA04G017170 | PF00772 | DnaB | 53 | 103 | 0.2 | 12.4 |
| TkA04G017170 | PF00010 | HLH | 61 | 106 | 2.3e-08 | 34.4 |
| TkA04G017170 | PF23177 | bHLH_IRO3 | 63 | 113 | 0.0013 | 19.7 |
| TkA04G017170 | PF23173 | bHLH_SAC51 | 65 | 108 | 1.3e-05 | 25.7 |
| TkA04G017170 | PF26228 | RESC9_N | 65 | 112 | 0.21 | 10.9 |
| TkA04G017170 | PF04281 | Tom22 | 66 | 103 | 0.13 | 12.8 |
| TkA04G017170 | PF23176 | bHLH_LHW | 69 | 106 | 0.054 | 14.2 |
| TkA04G017170 | PF00772 | DnaB | 116 | 133 | 0.2 | 12.4 |
| TkA04G017170 | PF23176 | bHLH_LHW | 164 | 178 | 0.054 | 14.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O22768 | 拟南芥 | sp|O22768|UNE12_ARATH Transcription factor UNE12 | 81.300% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q93Y00 | 拟南芥 | sp|Q93Y00|BH007_ARATH Transcription factor bHLH7 | 76.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9ZUG9 | 拟南芥 | sp|Q9ZUG9|LRL1_ARATH Transcription factor LRL1 | 64.600% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LSQ3 | 拟南芥 | sp|Q9LSQ3|LRL3_ARATH Transcription factor LRL3 | 54.700% | Swiss-Prot | 高置信 |