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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA04G008710
当前版本: TK1151 染色体: Chr04 坐标: 2085388-2087184 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1278 bp · TkA04G008710|TK1151|cDNA

GGTTTTGTTTAGTTTTTCCATAAGCTCTTTCTTCTATCAATCATTTGATATCAAAAAGAGAGCTTCATCACCCCACCAACAATGGCTTTCCCTACCCATCTCTTACCTTCTATTTTTGGCATTCTTGGCAACATTATCTCATTTTGTGTGTTCTTAGCGCCACTGCCAACTTTCTATCGAATCTACAAGAAGAAATCGACTGAAGGGTTTCAGTCAGTACCATATTCAGTCGCATTATTCAGCTGCATGTTGCTTTTATA...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · TkA04G008710|TK1151|CDS

ATGGCTTTCCCTACCCATCTCTTACCTTCTATTTTTGGCATTCTTGGCAACATTATCTCATTTTGTGTGTTCTTAGCGCCACTGCCAACTTTCTATCGAATCTACAAGAAGAAATCGACTGAAGGGTTTCAGTCAGTACCATATTCAGTCGCATTATTCAGCTGCATGTTGCTTTTATACTACGGCTATCTCAAAACCGAAAACGGCATGATGATCATCACCATCAACTCAATTGGATGCGTCATCGAAACAATTTACAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

299 aa · TkA04G008710|TK1151|PROTEIN

MAFPTHLLPSIFGILGNIISFCVFLAPLPTFYRIYKKKSTEGFQSVPYSVALFSCMLLLYYGYLKTENGMMIITINSIGCVIETIYIALFLIYATKESLMSTVKLLALFNILSYGLIVVTTRFATDKGPERVAVVGWICAVFSVCVFAAPLSIIRMVIKTKSVEYMPFSLSFFLTLCAVMWFFYGLLIKDYYVATPNVLGFIFGIAQMILYMIYKDKNKQVKSKVQQEDVPATTVVDLGAILEMQEKGAMELGIILEIQE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA04G008710
TK1151 IDTkA04G008710
OH-1004 IDLXL04_037044
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.990 / OH-1004 92.628
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA04G008710
位置Chr04:2085388-2087184 (-)
描述Similar to SWEET15: Bidirectional sugar transporter SWEET15
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13170 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。
An Arabidopsis senescence-associated protein SAG29 regulates cell viability under high salinity.2011 · DOI: 10.1007/s00425-010-1293-8

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BKP4 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
Os11g0508600 介导糖跨质膜的低亲和力摄取和流出。
Sugar transporters for intercellular exchange and nutrition of pathogens.2010 · DOI: 10.1038/nature09606
Five phylogenetically close rice SWEET genes confer TAL effector-mediated susceptibility to Xanthomonas oryzae pv. oryzae.2013 · DOI: 10.1111/nph.12411
UniProt: A2X5B4 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
Os02g0513100 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037044 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0015770 sucrose transport 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0071446 cellular response to salicylic acid stimulus 生物过程
GO:0071470 cellular response to osmotic stress 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008515 sucrose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G13170
dosa:Os02g0513100
dosa:Os11g0508600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.709
排名 1 · TkA04G008710 · TK1151
内质网0.136
排名 2 · TkA04G008710 · TK1151
溶酶体／液泡0.093
排名 3 · TkA04G008710 · TK1151
细胞质0.082
排名 4 · TkA04G008710 · TK1151
高尔基体0.054
排名 5 · TkA04G008710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03083MtN3_slv11-97 aa
PF04193PQ-loop13-65 aa
PF12669FeoB_associated18-39 aa
PF19727DUF621923-38 aa
PF19727DUF621951-93 aa
PF04193PQ-loop75-89 aa
PF03083MtN3_slv134-218 aa
PF04193PQ-loop134-147 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA04G008710PF03083MtN3_slv11971.4e-55186.0
TkA04G008710PF04193PQ-loop13650.0002521.4
TkA04G008710PF12669FeoB_associated18390.09313.8
TkA04G008710PF19727DUF621923389.86.8
TkA04G008710PF19727DUF621951939.86.8
TkA04G008710PF04193PQ-loop75890.0002521.4
TkA04G008710PF03083MtN3_slv1342181.4e-55186.0
TkA04G008710PF04193PQ-loop1341470.0002521.4
TkA04G008710PF22258DUF69491351937.7e-0523.5
TkA04G008710PF12669FeoB_associated1441610.09313.8
TkA04G008710PF04193PQ-loop1541870.0002521.4
TkA04G008710PF03650MPC1602270.1313.2
TkA04G008710PF12669FeoB_associated1992190.09313.8
TkA04G008710PF04193PQ-loop2002130.0002521.4
TkA04G008710PF19727DUF62192122179.86.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FY94拟南芥sp|Q9FY94|SWT15_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1559.100%Swiss-Prot高置信
B8BKP4水稻sp|B8BKP4|SWT14_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET1461.100%Swiss-Prot高置信
Q2R3P9水稻sp|Q2R3P9|SWT14_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET1461.100%Swiss-Prot高置信
A2X5B4水稻sp|A2X5B4|SWT15_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET1561.300%Swiss-Prot高置信
Q6K602水稻sp|Q6K602|SWT15_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET1561.300%Swiss-Prot高置信

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