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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G515900
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 129413723-129417485 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2345 bp · TkA03G515900|TK1151|cDNA

CTCATTTGCAGTCACGTCTACAAGACTTTCCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGAGCCCATTCTCTCTCTAGAGTCTAGATGCTTAAGGTTCTGAAAGTGGAAAGGATTCAGATTACAGAGTGAATTTCAGAGAGAGAACATTCAGTTCGTGAGAGAGAAAGTGCAAGATTGCAAAAGGATTCGAGACGACGATGCTGAGGCCAATATCACTGCACATCTTCCTCCTTGTTTTCCTTGCAGCTTTCACACCTTCTTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1887 bp · TkA03G515900|TK1151|CDS

ATGCTGAGGCCAATATCACTGCACATCTTCCTCCTTGTTTTCCTTGCAGCTTTCACACCTTCTTACCAAGCACCATATGCTCTGAGAATAAGCTGTGGAGCTCGCAAAGACGTCCACACAGCACCGACAAATACATTTTGGTACAGAGATTTCGGTTACAGCGGAGGCCAATTAGGTAATGCAACTCGTCCAAGCTACATCACTCCTCCTCTCACCACACTTCGCTACTTCCCTCTATCTGCGGGTCCCGAAAACTGCTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

628 aa · TkA03G515900|TK1151|PROTEIN

MLRPISLHIFLLVFLAAFTPSYQAPYALRISCGARKDVHTAPTNTFWYRDFGYSGGQLGNATRPSYITPPLTTLRYFPLSAGPENCYHIDRVPHGHYSVRVFFALVKDPTFDNEPLFDVSVEGTLVYSLSSGWSNHDDEQAFVEALVFLEDSTASICLHSTGHGDPAILSIEVLQVGNNAYNFGPGWGRGTILRTHKRLSCGAKDPKFDADYSGNHWGGDRFWNSITTFGQNSDKPLTTKTNIKLSPKVPNYYPEALYQT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G515900
TK1151 IDTkA03G515900
OH-1004 IDLXL04_010259
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G515900
位置Chr03:129413723-129417485 (+)
描述Similar to RLP4: Receptor-like protein 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g28340 类受体蛋白4。 暂无已核实直接文献
At1g51820 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g51820。 暂无已核实直接文献
At3g21340 可能的受体，具有双特异性激酶活性，可作用于含丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸的底物。 暂无已核实直接文献
At1g51800 负向调控脱落酸 (ABA) 信号通路。
An Arabidopsis (malectin-like) leucine-rich repeat receptor-like kinase contributes to downy mildew disease.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02390.x
The receptor kinase IMPAIRED OOMYCETE SUSCEPTIBILITY1 attenuates abscisic acid responses in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1104/pp.114.248518
The Arabidopsis Malectin-Like/LRR-RLK IOS1 Is Critical for BAK1-Dependent and BAK1-Independent Pattern-Triggered Immunity.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00313
At1g05700 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g05700。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010259 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0042545 cell wall modification 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0031252 cell leading edge 细胞组分
GO:0031254 cell trailing edge 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28340
ath:AT1G51820
ath:AT2G14510
ath:AT3G21340
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.697
排名 1 · TkA03G515900 · TK1151
细胞外0.123
排名 2 · TkA03G515900 · TK1151
细胞质0.099
排名 3 · TkA03G515900 · TK1151
内质网0.094
排名 4 · TkA03G515900 · TK1151
溶酶体／液泡0.059
排名 5 · TkA03G515900 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_211-20 aa
PF12819Malectin_like30-364 aa
PF17829GH115_C76-124 aa
PF11721Malectin92-129 aa
PF11721Malectin203-357 aa
PF17829GH115_C263-323 aa
PF00560LRR_1274-282 aa
PF08263LRRNT_2375-412 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G515900PF08263LRRNT_211200.002119.0
TkA03G515900PF12819Malectin_like303643.2e-52178.6
TkA03G515900PF17829GH115_C761240.2112.1
TkA03G515900PF11721Malectin921295.2e-2072.8
TkA03G515900PF11721Malectin2033575.2e-2072.8
TkA03G515900PF17829GH115_C2633230.2112.1
TkA03G515900PF00560LRR_12742821.6e-1142.7
TkA03G515900PF08263LRRNT_23754120.002119.0
TkA03G515900PF00560LRR_14264441.6e-1142.7
TkA03G515900PF23598LRR_144265001.1e-0525.0
TkA03G515900PF13855LRR_84374807.2e-1555.2
TkA03G515900PF23211LRR_LRWD14425050.01715.5
TkA03G515900PF13516LRR_64444580.09513.5
TkA03G515900PF13855LRR_84465057.2e-1555.2
TkA03G515900PF00560LRR_14464671.6e-1142.7
TkA03G515900PF12799LRR_44464791.1e-0629.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HWL3拟南芥sp|F4HWL3|RLP4_ARATH Receptor-like protein 470.200%Swiss-Prot高置信
C0LGG3拟南芥sp|C0LGG3|Y5182_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5182024.000%Swiss-Prot低置信
Q9LIG2拟南芥sp|Q9LIG2|RLK6_ARATH Receptor-like protein kinase At3g2134024.700%Swiss-Prot低置信
Q9C8I6拟南芥sp|Q9C8I6|IOS1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IOS124.800%Swiss-Prot低置信
C0LGD6拟南芥sp|C0LGD6|Y1570_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0570026.800%Swiss-Prot低置信

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